RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592159.1

KDM4B-209, Transcript of lysine demethylase 4B, humanhuman

TSL 3

Gene KDM4B, Length 411 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4B-209ENST00000592159 KPNA5O15131 536 aa9.5□□□□□ -0.89
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KDM4B-209ENST00000592159 MOCOSQ96EN8 888 aa9.49□□□□□ -0.89
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KDM4B-209ENST00000592159 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
KDM4B-209ENST00000592159 ATOH8Q96SQ7 321 aa9.49□□□□□ -0.89
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