RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 PARGQ86W56 976 aa30.23■■■□□ 2.43
CAPNS1-206ENST00000588815 TBC1D21Q8IYX1 336 aa30.23■■■□□ 2.43
CAPNS1-206ENST00000588815 OR5K2Q8NHB8 316 aa30.23■■■□□ 2.43
CAPNS1-206ENST00000588815 HGH1Q9BTY7 390 aa30.23■■■□□ 2.43
CAPNS1-206ENST00000588815 ACSS2Q9NR19 701 aa30.23■■■□□ 2.43
CAPNS1-206ENST00000588815 FBXO4Q9UKT5 387 aa30.23■■■□□ 2.43
CAPNS1-206ENST00000588815 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa30.23■■■□□ 2.43
CAPNS1-206ENST00000588815 LRRC14BA6NHZ5 514 aa30.22■■■□□ 2.43
CAPNS1-206ENST00000588815 GIPC1O14908 333 aa30.22■■■□□ 2.43
CAPNS1-206ENST00000588815 FGF4P08620 206 aa30.22■■■□□ 2.43
CAPNS1-206ENST00000588815 BDKRB1P46663 353 aa30.22■■■□□ 2.43
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC6A12P48065 614 aa30.22■■■□□ 2.43
CAPNS1-206ENST00000588815 CDH13P55290 713 aa30.22■■■□□ 2.43
CAPNS1-206ENST00000588815 GTF2H2Q13888 395 aa30.22■■■□□ 2.43
CAPNS1-206ENST00000588815 FZD2Q14332 565 aa30.22■■■□□ 2.43
CAPNS1-206ENST00000588815 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa30.22■■■□□ 2.43
CAPNS1-206ENST00000588815 TSSK4Q6SA08 328 aa30.22■■■□□ 2.43
CAPNS1-206ENST00000588815 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa30.22■■■□□ 2.43
CAPNS1-206ENST00000588815 RD3Q7Z3Z2 195 aa30.22■■■□□ 2.43
CAPNS1-206ENST00000588815 HID1Q8IV36 788 aa30.22■■■□□ 2.43
CAPNS1-206ENST00000588815 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa30.22■■■□□ 2.43
CAPNS1-206ENST00000588815 RGL4Q8IZJ4 473 aa30.22■■■□□ 2.43
CAPNS1-206ENST00000588815 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa30.22■■■□□ 2.43
CAPNS1-206ENST00000588815 DEFB119Q8N690 84 aa30.22■■■□□ 2.43
CAPNS1-206ENST00000588815 OR9A1PQ8NGU1 263 aa30.22■■■□□ 2.43
CAPNS1-206ENST00000588815 C10orf82Q8WW14 230 aa30.22■■■□□ 2.43
CAPNS1-206ENST00000588815 PNPOQ9NVS9 261 aa30.22■■■□□ 2.43
CAPNS1-206ENST00000588815 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa30.22■■■□□ 2.43
CAPNS1-206ENST00000588815 USH1CQ9Y6N9 552 aa30.22■■■□□ 2.43
CAPNS1-206ENST00000588815 KATNA1O75449 491 aa30.21■■■□□ 2.43
CAPNS1-206ENST00000588815 KITP10721 976 aa30.21■■■□□ 2.43
CAPNS1-206ENST00000588815 MPSTP25325 297 aa30.21■■■□□ 2.43
CAPNS1-206ENST00000588815 CCR10P46092 362 aa30.21■■■□□ 2.43
CAPNS1-206ENST00000588815 PKNOX1P55347 436 aa30.21■■■□□ 2.43
CAPNS1-206ENST00000588815 CTBSQ01459 385 aa30.21■■■□□ 2.43
CAPNS1-206ENST00000588815 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa30.21■■■□□ 2.43
CAPNS1-206ENST00000588815 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP30.21■■■□□ 2.43
CAPNS1-206ENST00000588815 C1orf216Q8TAB5 229 aa30.21■■■□□ 2.43
CAPNS1-206ENST00000588815 TRPC4APQ8TEL6 797 aa30.21■■■□□ 2.43
CAPNS1-206ENST00000588815 STON2Q8WXE9 905 aa30.21■■■□□ 2.43
CAPNS1-206ENST00000588815 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP30.21■■■□□ 2.43
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF382Q96SR6 550 aa30.21■■■□□ 2.43
CAPNS1-206ENST00000588815 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP30.21■■■□□ 2.43
CAPNS1-206ENST00000588815 ZBTB26Q9HCK0 441 aa30.21■■■□□ 2.43
CAPNS1-206ENST00000588815 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP30.21■■■□□ 2.43
CAPNS1-206ENST00000588815 PSMD13Q9UNM6 376 aa30.21■■■□□ 2.43
CAPNS1-206ENST00000588815 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa30.21■■■□□ 2.43
CAPNS1-206ENST00000588815 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa30.21■■■□□ 2.43
CAPNS1-206ENST00000588815 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa30.2■■■□□ 2.43
CAPNS1-206ENST00000588815 MATN2O00339 956 aa30.2■■■□□ 2.43
CAPNS1-206ENST00000588815 RPL10P27635 214 aaKnown RBP30.2■■■□□ 2.43
CAPNS1-206ENST00000588815 HALP42357 657 aa30.2■■■□□ 2.43
CAPNS1-206ENST00000588815 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP30.2■■■□□ 2.43
CAPNS1-206ENST00000588815 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP30.2■■■□□ 2.43
CAPNS1-206ENST00000588815 SH2D4BQ5SQS7 431 aa30.2■■■□□ 2.43
CAPNS1-206ENST00000588815 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP30.2■■■□□ 2.43
CAPNS1-206ENST00000588815 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa30.2■■■□□ 2.43
CAPNS1-206ENST00000588815 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa30.2■■■□□ 2.43
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEFF1Q8IYR6 380 aa30.2■■■□□ 2.43
CAPNS1-206ENST00000588815 PHC3Q8NDX5 983 aa30.2■■■□□ 2.43
CAPNS1-206ENST00000588815 AGAP11Q8TF27 550 aa30.2■■■□□ 2.43
CAPNS1-206ENST00000588815 ESAMQ96AP7 390 aa30.2■■■□□ 2.43
CAPNS1-206ENST00000588815 PKP4Q99569 1192 aa30.2■■■□□ 2.43
CAPNS1-206ENST00000588815 TM9SF3Q9HD45 589 aa30.2■■■□□ 2.43
CAPNS1-206ENST00000588815 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP30.2■■■□□ 2.43
CAPNS1-206ENST00000588815 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP30.2■■■□□ 2.43
CAPNS1-206ENST00000588815 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP30.2■■■□□ 2.43
CAPNS1-206ENST00000588815 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa30.2■■■□□ 2.43
CAPNS1-206ENST00000588815 HDAC3O15379 428 aa30.19■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP30.19■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 EPB42P16452 691 aa30.19■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 HSD17B2P37059 387 aa30.19■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 ARFIP2P53365 341 aa30.19■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 FBXO48Q5FWF7 155 aa30.19■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 DTWD2Q8NBA8 298 aa30.19■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 RFWD2Q8NHY2 731 aa30.19■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 GPBAR1Q8TDU6 330 aa30.19■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 GAB3Q8WWW8 586 aa30.19■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 C12orf66Q96MD2 445 aa30.19■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 GSDMCQ9BYG8 508 aa30.19■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM168Q9H0V1 697 aa30.19■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 MVB12BQ9H7P6 319 aa30.19■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 KCNK13Q9HB14 408 aa30.19■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 MID1IP1Q9NPA3 183 aa30.19■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 POLG2Q9UHN1 485 aa30.19■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 DCTN4Q9UJW0 460 aa30.19■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 ASB1Q9Y576 335 aa30.19■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 PDZK1P1A8MUH7 402 aa30.19■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 TLR4O00206 839 aa30.19■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP30.19■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 ESRRBO95718 433 aa30.19■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 OTCP00480 354 aa30.19■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 SH3BP2P78314 561 aa30.19■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP30.19■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 ARHGAP19Q14CB8 494 aa30.19■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 AGTRAPQ6RW13 159 aa30.19■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP30.19■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 CLYBLQ8N0X4 340 aa30.19■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 TEX9Q8N6V9 391 aa30.19■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM105Q8N8V8 129 aa30.19■■■□□ 2.42
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