RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567434.5

CCNDBP1-211, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene CCNDBP1, Length 713 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-211ENST00000567434 MED8Q96G25 268 aa16.57■□□□□ 0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 ELMO2Q96JJ3 720 aa16.57■□□□□ 0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 FAM117AQ9C073 453 aa16.57■□□□□ 0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 TWSG1Q9GZX9 223 aa16.57■□□□□ 0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 KCND1Q9NSA2 647 aa16.57■□□□□ 0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 ACTR10Q9NZ32 417 aa16.57■□□□□ 0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 PCYOX1Q9UHG3 505 aa16.57■□□□□ 0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 KCND3Q9UK17 655 aa16.57■□□□□ 0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 PADI1Q9ULC6 663 aa16.57■□□□□ 0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa16.56■□□□□ 0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF185O15231 689 aa16.56■□□□□ 0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 SFTPCP11686 197 aa16.56■□□□□ 0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 ITGB6P18564 788 aa16.56■□□□□ 0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 TERF1P54274 439 aa16.56■□□□□ 0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 GNG11P61952 73 aa16.56■□□□□ 0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 KIR2DS3Q14952 304 aa16.56■□□□□ 0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa16.56■□□□□ 0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa16.56■□□□□ 0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 NEPROQ6NW34 567 aa16.56■□□□□ 0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 TTC23LQ6PF05 361 aa16.56■□□□□ 0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 CES3Q6UWW8 571 aa16.56■□□□□ 0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 NAPRTQ6XQN6 538 aa16.56■□□□□ 0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 UNC5AQ6ZN44 842 aa16.56■□□□□ 0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 OTOAQ7RTW8 1153 aa16.56■□□□□ 0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 PCGF5Q86SE9 256 aa16.56■□□□□ 0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 TMEM135Q86UB9 458 aa16.56■□□□□ 0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa16.56■□□□□ 0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 LMNTD2Q8IXW0 634 aa16.56■□□□□ 0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa16.56■□□□□ 0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 LPGAT1Q92604 370 aa16.56■□□□□ 0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 RUNDC3BQ96NL0 473 aa16.56■□□□□ 0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa16.56■□□□□ 0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa16.56■□□□□ 0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 XKR8Q9H6D3 395 aa16.56■□□□□ 0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa16.56■□□□□ 0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 USP27XA6NNY8 438 aa16.55■□□□□ 0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 IQCF5A8MTL0 148 aa16.55■□□□□ 0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 C21orf140B9A014 251 aa16.55■□□□□ 0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 ATP5DP30049 168 aa16.55■□□□□ 0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 RAB28P51157 221 aa16.55■□□□□ 0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 PTK6Q13882 451 aa16.55■□□□□ 0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 KYNUQ16719 465 aa16.55■□□□□ 0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 CILP2Q8IUL8 1156 aa16.55■□□□□ 0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 VRK3Q8IV63 474 aa16.55■□□□□ 0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 KRT222Q8N1A0 295 aa16.55■□□□□ 0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 STARD8Q92502 1023 aa16.55■□□□□ 0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC22A18Q96BI1 424 aa16.55■□□□□ 0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 LRFN5Q96NI6 719 aa16.55■□□□□ 0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 BIRC8Q96P09 236 aa16.55■□□□□ 0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa16.55■□□□□ 0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa16.55■□□□□ 0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa16.55■□□□□ 0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 GOLGA8MH3BSY2 632 aa16.54■□□□□ 0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 TERTO14746 1132 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 SCRG1O75711 98 aa16.54■□□□□ 0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 USP1O94782 785 aa16.54■□□□□ 0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 TIAF1O95411 115 aa16.54■□□□□ 0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 RECKO95980 971 aa16.54■□□□□ 0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 ST6GAL1P15907 406 aa16.54■□□□□ 0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 UGT2B7P16662 529 aa16.54■□□□□ 0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 PKLRP30613 574 aa16.54■□□□□ 0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 DLSTP36957 453 aa16.54■□□□□ 0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 CCNFP41002 786 aa16.54■□□□□ 0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 GPR19Q15760 415 aa16.54■□□□□ 0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 TBR1Q16650 682 aa16.54■□□□□ 0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC5A12Q1EHB4 618 aa16.54■□□□□ 0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 CTSL3PQ5NE16 218 aa16.54■□□□□ 0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 BORAQ6PGQ7 559 aa16.54■□□□□ 0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 TMEM126BQ8IUX1 230 aa16.54■□□□□ 0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 UNC5BQ8IZJ1 945 aa16.54■□□□□ 0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 CALML6Q8TD86 181 aa16.54■□□□□ 0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 SEC14L1Q92503 715 aa16.54■□□□□ 0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 EXTL1Q92935 676 aa16.54■□□□□ 0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 TCTN2Q96GX1 697 aa16.54■□□□□ 0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 PPM1MQ96MI6 270 aa16.54■□□□□ 0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 FOPNLQ96NB1 174 aa16.54■□□□□ 0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 OR2A14Q96R47 310 aa16.54■□□□□ 0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 LHX9Q9NQ69 397 aa16.54■□□□□ 0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 RNF14Q9UBS8 474 aa16.54■□□□□ 0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 ASIC3Q9UHC3 531 aa16.54■□□□□ 0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 SERTAD3Q9UJW9 196 aa16.54■□□□□ 0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 CROTQ9UKG9 612 aa16.54■□□□□ 0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 SAR1BQ9Y6B6 198 aa16.54■□□□□ 0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 A0A0J9YY10 115 aa16.53■□□□□ 0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61 ms