RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560934.1

LINS1-210, Transcript of lines homolog 1, human

TSL 4

Gene LINS1, Length 562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINS1-210	ENST00000560934	GGT5	P36269	586 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	GPD2	P43304	727 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	ARPP19	P56211	112 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	YWHAH	Q04917	246 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	GALNT2	Q10471	571 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	ELAVL2	Q12926	359 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	CAMK1	Q14012	370 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	SLC18A3	Q16572	532 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	USP41	Q3LFD5	358 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	C2CD6	Q53TS8	623 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	TDRD12	Q587J7	1177 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	CCDC122	Q5T0U0	273 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	ARHGAP17	Q68EM7	881 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	ALKBH5	Q6P6C2	394 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	LCLAT1	Q6UWP7	414 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	PHLDB2	Q86SQ0	1253 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	IGFN1	Q86VF2	1251 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	GPSM1	Q86YR5	675 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	CCDC170	Q8IYT3	715 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	THEM5	Q8N1Q8	247 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	TTC39C	Q8N584	583 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	ATAD1	Q8NBU5	361 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	CCDC112	Q8NEF3	446 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF548	Q8NEK5	533 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	SPATA18	Q8TC71	538 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	KIAA1524	Q8TCG1	905 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	SLC2A14	Q8TDB8	520 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	SLC35F5	Q8WV83	523 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	FAR1	Q8WVX9	515 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	ST8SIA4	Q92187	359 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	HSPH1	Q92598	858 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	CNOT9	Q92600	299 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	SH3KBP1	Q96B97	665 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	MSI2	Q96DH6	328 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	ELP4	Q96EB1	424 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	PCED1B	Q96HM7	432 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	APOPT1	Q96IL0	206 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	KCNK16	Q96T55	309 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	HNRNPAB	Q99729	332 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	SYT15	Q9BQS2	421 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	LHX5	Q9H2C1	402 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	PRO3102	Q9H379	93 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	FAM124B	Q9H5Z6	455 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	ACTR5	Q9H9F9	607 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	FAM49B	Q9NUQ9	324 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	TMEM30A	Q9NV96	361 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	SEPT11	Q9NVA2	429 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	TRMT1	Q9NXH9	659 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	TUBA8	Q9NY65	449 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	TSPAN16	Q9UKR8	245 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	CDH9	Q9ULB4	789 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	MTUS1	Q9ULD2	1270 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	ARHGAP26	Q9UNA1	814 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	DNAH12	Q6ZR08	3092 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	LTBP2	Q14767	1821 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	SF3B1	O75533	1304 aa	Known RBP eCLIP	4.53	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	TDRD15	B5MCY1	1934 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	TRBV5-7	A0A0A0MS05	114 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	ARHGEF37	A1IGU5	675 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	EIF3CL	B5ME19	914 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	TEX28	O15482	410 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	MED7	O43513	233 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	TLX3	O43711	291 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	RTN2	O75298	545 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	TULP3	O75386	442 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	TMCC1	O94876	653 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	CXCL14	O95715	111 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	IL1A	P01583	271 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	RB1	P06400	928 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	H2AFZ	P0C0S5	128 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	BDNF	P23560	247 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	CYP2F1	P24903	491 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	ADORA2B	P29275	332 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	CDH5	P33151	784 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	OR1D2	P34982	312 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	CYLC1	P35663	651 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	GALC	P54803	685 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	CDH15	P55291	814 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	TMPRSS3	P57727	454 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	GPR17	Q13304	367 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	SPA17	Q15506	151 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	GOLGA7B	Q2TAP0	167 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	SYTL3	Q4VX76	610 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	MDH1B	Q5I0G3	518 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	INTS11	Q5TA45	600 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	NAA35	Q5VZE5	725 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	NUGGC	Q68CJ6	796 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	ACAD10	Q6JQN1	1059 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	PMF1	Q6P1K2	205 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	H2AFV	Q71UI9	128 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	PIP4P1	Q86T03	277 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	TRIM74	Q86UV6	250 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	TRIM73	Q86UV7	250 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	PIGZ	Q86VD9	579 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	VPS36	Q86VN1	386 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF677	Q86XU0	584 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	PHF13	Q86YI8	300 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	TDH	Q8IZJ6	230 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	CCAR2	Q8N163	923 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68

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