RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546248.5

TRDN-205, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,179 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-205ENST00000546248 PGBD5Q8N414 524 aa5.42□□□□□ -1.54
TRDN-205ENST00000546248 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP5.42□□□□□ -1.54
TRDN-205ENST00000546248 ACVR1CQ8NER5 493 aa5.42□□□□□ -1.54
TRDN-205ENST00000546248 OR56A1Q8NGH5 318 aa5.42□□□□□ -1.54
TRDN-205ENST00000546248 OR52K2Q8NGK3 314 aa5.42□□□□□ -1.54
TRDN-205ENST00000546248 LRRC8CQ8TDW0 803 aa5.42□□□□□ -1.54
TRDN-205ENST00000546248 ACMSDQ8TDX5 336 aa5.42□□□□□ -1.54
TRDN-205ENST00000546248 C10orf82Q8WW14 230 aa5.42□□□□□ -1.54
TRDN-205ENST00000546248 CDKL2Q92772 493 aa5.42□□□□□ -1.54
TRDN-205ENST00000546248 PSMG2Q969U7 264 aa5.42□□□□□ -1.54
TRDN-205ENST00000546248 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
TRDN-205ENST00000546248 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
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TRDN-205ENST00000546248 NSMCE3Q96MG7 304 aa5.42□□□□□ -1.54
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TRDN-205ENST00000546248 CPNE1Q99829 537 aa5.42□□□□□ -1.54
TRDN-205ENST00000546248 FICDQ9BVA6 458 aa5.42□□□□□ -1.54
TRDN-205ENST00000546248 IL22Q9GZX6 179 aa5.42□□□□□ -1.54
TRDN-205ENST00000546248 C11orf49Q9H6J7 331 aa5.42□□□□□ -1.54
TRDN-205ENST00000546248 KCNK13Q9HB14 408 aa5.42□□□□□ -1.54
TRDN-205ENST00000546248 PDFQ9HBH1 243 aa5.42□□□□□ -1.54
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TRDN-205ENST00000546248 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
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TRDN-205ENST00000546248 GKN1Q9NS71 199 aa5.42□□□□□ -1.54
TRDN-205ENST00000546248 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
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TRDN-205ENST00000546248 COX11Q9Y6N1 276 aa5.42□□□□□ -1.54
TRDN-205ENST00000546248 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
TRDN-205ENST00000546248 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa5.42□□□□□ -1.54
TRDN-205ENST00000546248 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP5.41□□□□□ -1.54
TRDN-205ENST00000546248 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa5.41□□□□□ -1.54
TRDN-205ENST00000546248 CCDC78A2IDD5 438 aa5.41□□□□□ -1.54
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TRDN-205ENST00000546248 PLIN3O60664 434 aa5.41□□□□□ -1.54
TRDN-205ENST00000546248 PRAMEF11O60813 436 aa5.41□□□□□ -1.54
TRDN-205ENST00000546248 PMPCBO75439 489 aa5.41□□□□□ -1.54
TRDN-205ENST00000546248 KIAA0754O94854 1291 aa5.41□□□□□ -1.54
TRDN-205ENST00000546248 TGDSO95455 350 aa5.41□□□□□ -1.54
TRDN-205ENST00000546248 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
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TRDN-205ENST00000546248 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
TRDN-205ENST00000546248 MYF5P13349 255 aa5.41□□□□□ -1.54
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TRDN-205ENST00000546248 SPRP35270 261 aaPredicted RBP5.41□□□□□ -1.54
TRDN-205ENST00000546248 PTH2RP49190 550 aa5.41□□□□□ -1.54
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TRDN-205ENST00000546248 SGSHP51688 502 aa5.41□□□□□ -1.54
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TRDN-205ENST00000546248 MTA1Q13330 715 aa5.41□□□□□ -1.54
TRDN-205ENST00000546248 MPP3Q13368 585 aa5.41□□□□□ -1.54
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TRDN-205ENST00000546248 CYTH1Q15438 398 aa5.41□□□□□ -1.54
TRDN-205ENST00000546248 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa5.41□□□□□ -1.54
TRDN-205ENST00000546248 HECTD3Q5T447 861 aa5.41□□□□□ -1.54
TRDN-205ENST00000546248 MARC1Q5VT66 337 aa5.41□□□□□ -1.54
TRDN-205ENST00000546248 IL31Q6EBC2 164 aa5.41□□□□□ -1.54
TRDN-205ENST00000546248 RD3Q7Z3Z2 195 aa5.41□□□□□ -1.54
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TRDN-205ENST00000546248 KCNMB4Q86W47 210 aa5.41□□□□□ -1.54
TRDN-205ENST00000546248 PDSS2Q86YH6 399 aa5.41□□□□□ -1.54
TRDN-205ENST00000546248 CNTN4Q8IWV2 1026 aa5.41□□□□□ -1.54
TRDN-205ENST00000546248 C10orf67Q8IYJ2 551 aa5.41□□□□□ -1.54
TRDN-205ENST00000546248 CFAP52Q8N1V2 620 aa5.41□□□□□ -1.54
TRDN-205ENST00000546248 DCLK2Q8N568 766 aa5.41□□□□□ -1.54
TRDN-205ENST00000546248 CCDC63Q8NA47 563 aa5.41□□□□□ -1.54
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TRDN-205ENST00000546248 IPMKQ8NFU5 416 aa5.41□□□□□ -1.54
TRDN-205ENST00000546248 OR6Y1Q8NGX8 325 aa5.41□□□□□ -1.54
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TRDN-205ENST00000546248 GPR35Q9HC97 309 aa5.41□□□□□ -1.54
TRDN-205ENST00000546248 NT5MQ9NPB1 228 aa5.41□□□□□ -1.54
TRDN-205ENST00000546248 TREX1Q9NSU2 369 aa5.41□□□□□ -1.54
TRDN-205ENST00000546248 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP5.41□□□□□ -1.54
TRDN-205ENST00000546248 SPG21Q9NZD8 308 aa5.41□□□□□ -1.54
TRDN-205ENST00000546248 CPNE7Q9UBL6 633 aa5.41□□□□□ -1.54
TRDN-205ENST00000546248 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa5.41□□□□□ -1.54
TRDN-205ENST00000546248 STOML2Q9UJZ1 356 aa5.41□□□□□ -1.54
TRDN-205ENST00000546248 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
TRDN-205ENST00000546248 SLC12A4Q9UP95 1085 aa5.41□□□□□ -1.54
TRDN-205ENST00000546248 CDYLQ9Y232 598 aa5.41□□□□□ -1.54
TRDN-205ENST00000546248 CHKBQ9Y259 395 aa5.41□□□□□ -1.54
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