RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545882.5

CNN3-207, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CNN3, Length 1,902 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-207ENST00000545882 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 SEC22BO75396 215 aa14.95□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 CREG1O75629 220 aa14.95□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 WDR47O94967 919 aa14.95□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 PRAMEF1O95521 474 aa14.95□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 IL6P05231 212 aa14.95□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 PFKLP17858 780 aa14.95□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 PCMT1P22061 227 aa14.95□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 BFSP2Q13515 415 aa14.95□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 SPCS2Q15005 226 aa14.95□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 SGO1Q5FBB7 561 aa14.95□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 GPRC6AQ5T6X5 926 aa14.95□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 GALNT18Q6P9A2 607 aa14.95□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa14.95□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 ABI1Q8IZP0 508 aa14.95□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 NAT16Q8N8M0 369 aa14.95□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 ZNF555Q8NEP9 628 aa14.95□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 OR5K1Q8NHB7 308 aa14.95□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 CLHC1Q8NHS4 586 aa14.95□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 UBTD2Q8WUN7 234 aa14.95□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 USP7Q93009 1102 aa14.95□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 SDCCAG3Q96C92 435 aa14.95□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 EGFL8Q99944 293 aa14.95□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 APOL5Q9BWW9 433 aa14.95□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 LRTM1Q9HBL6 345 aa14.95□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 OPTCQ9UBM4 332 aa14.95□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa14.95□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa14.95□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa14.94□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa14.94□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 C16orf96A6NNT2 1141 aa14.94□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 H0Y626 953 aa14.94□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 H7C4K7 107 aa14.94□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 CBFA2T3O75081 653 aa14.94□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 ULK1O75385 1050 aa14.94□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 PGLSO95336 258 aa14.94□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 TRIM16O95361 564 aa14.94□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 RETP07949 1114 aa14.94□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 ZNF12P17014 697 aa14.94□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 RPL17P18621 184 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 EPORP19235 508 aa14.94□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 DGKAP23743 735 aa14.94□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 HTR1BP28222 390 aa14.94□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 RHOAP61586 193 aa14.94□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 SP3Q02447 781 aa14.94□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 EPS8Q12929 822 aa14.94□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 CDKN3Q16667 212 aa14.94□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 ZNF691Q5VV52 312 aa14.94□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 GCNT7Q6ZNI0 430 aa14.94□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 CENPSQ8N2Z9 138 aa14.94□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 DDHD1Q8NEL9 900 aa14.94□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 FBXO22Q8NEZ5 403 aa14.94□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 OR52E6Q96RD3 313 aa14.94□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 FUNDC2Q9BWH2 189 aa14.94□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 ASB8Q9H765 288 aa14.94□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 EXD2Q9NVH0 621 aa14.94□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 VNN3Q9NY84 501 aa14.94□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 WWOXQ9NZC7 414 aa14.94□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 TRPS1Q9UHF7 1281 aa14.94□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 GNPTGQ9UJJ9 305 aa14.94□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 INVSQ9Y283 1065 aa14.94□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa14.94□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 OR51B4Q9Y5P0 310 aa14.94□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 A0A1W2PQY0 241 aa14.94□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 SOBPA7XYQ1 873 aa14.94□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 FAM220BPB1ANY3 271 aa14.94□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 K7EPI3 171 aa14.94□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 K7ERQ8 282 aa14.94□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 ARVCFO00192 962 aa14.94□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 SLC1A7O00341 560 aa14.94□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 GNGT2O14610 69 aa14.94□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 HS6ST1O60243 411 aa14.94□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 SULT1C4O75897 302 aa14.94□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 CLPXO76031 633 aa14.94□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 B3GALT4O96024 378 aa14.94□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 FUCA1P04066 466 aa14.94□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 GALTP07902 379 aa14.94□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 IMPDH2P12268 514 aa14.94□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 BCKDHAP12694 445 aa14.94□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 PTPN6P29350 595 aa14.94□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 RGS4P49798 205 aa14.94□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 GP2P55259 537 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 RAB15P59190 212 aa14.94□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 GPNMBQ14956 572 aa14.94□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 LRIF1Q5T3J3 769 aa14.94□□□□□ -0.02
CNN3-207ENST00000545882 CACHD1Q5VU97 1274 aa14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms