RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533677.1

PAFAH1B2-208, Transcript of platelet activating factor acetylhydrolase 1b catalytic subunit 2, human

TSL 3

Gene PAFAH1B2, Length 756 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	PALB2	Q86YC2	1186 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	ZC3H3	Q8IXZ2	948 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	RBFA	Q8N0V3	343 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	ADSSL1	Q8N142	457 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PAFAH1B2-208	ENST00000533677		Q8N9P0	234 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	XXYLT1	Q8NBI6	393 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	TMEM163	Q8TC26	289 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	RSPH1	Q8WYR4	309 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	CCDC127	Q96BQ5	260 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	PPM1M	Q96MI6	270 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	KLHL5	Q96PQ7	755 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	GFM1	Q96RP9	751 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	RTP3	Q9BQQ7	232 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	NPFFR1	Q9GZQ6	430 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	PAIP1	Q9H074	479 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	UBE2Z	Q9H832	354 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	SNTG1	Q9NSN8	517 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	SPATS2L	Q9NUQ6	558 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	PPP1R14D	Q9NXH3	145 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	UBQLN1	Q9UMX0	589 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	TRAF3IP3	Q9Y228	551 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	SF3B1	O75533	1304 aa	Known RBP eCLIP	7.38	□□□□□ -1.23
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	PIR	O00625	290 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	PDXK	O00764	312 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	LDB2	O43679	373 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	TADA2A	O75478	443 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	RFPL2	O75678	378 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	CXCL14	O95715	111 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	LCAT	P04180	440 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	SLC2A4	P14672	509 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	DCTD	P32321	178 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	PAFAH1B1	P43034	410 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	CLCN4	P51793	760 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	SMC1A	Q14683	1233 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	PSMD6	Q15008	389 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	ZNF284	Q2VY69	593 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	ATG9B	Q674R7	924 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	CENPP	Q6IPU0	288 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	SPOPL	Q6IQ16	392 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	CCDC70	Q6NSX1	233 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	ZNF549	Q6P9A3	640 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	FAM43B	Q6ZT52	329 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	C11orf57	Q6ZUT1	292 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	TADA2B	Q86TJ2	420 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	LURAP1L	Q8IV03	231 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	MRPL43	Q8N983	215 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	TEX45	Q8NA69	505 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	STKLD1	Q8NE28	680 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	OR10T2	Q8NGX3	314 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	GSDMA	Q96QA5	445 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	SDCBP2	Q9H190	292 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	PLEKHA5	Q9HAU0	1116 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	DPP3	Q9NY33	737 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	KIAA1456	Q9P272	454 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	THEG	Q9P2T0	379 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	C2CD2	Q9Y426	696 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	ZNF233	A6NK53	670 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	LIAS	O43766	372 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	CYP3A5	P20815	502 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	GNLY	P22749	145 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	SP100	P23497	879 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	ABCD1	P33897	745 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	PGGT1B	P53609	377 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	NR1H2	P55055	460 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	UFM1	P61960	85 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	ROR1	Q01973	937 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	ROR2	Q01974	943 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	PSMD5	Q16401	504 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	PRICKLE4	Q2TBC4	344 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	USP41	Q3LFD5	358 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	CBWD6	Q4V339	395 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	HSP90AA4P	Q58FG1	418 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	CBWD3	Q5JTY5	395 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	FAM69A	Q5T7M9	428 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	SERTAD4-AS1	Q5TG53	156 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	DCLRE1A	Q6PJP8	1040 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	SCARA5	Q6ZMJ2	495 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	STXBP4	Q6ZWJ1	553 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	RRM2B	Q7LG56	351 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	ZNF367	Q7RTV3	350 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	DENND6A	Q8IWF6	608 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	BEST2	Q8NFU1	509 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	NELFB	Q8WX92	580 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	ZUFSP	Q96AP4	578 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	PABPC5	Q96DU9	382 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	SENP8	Q96LD8	212 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	PI4K2A	Q9BTU6	479 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	ASB7	Q9H672	318 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	TLE6	Q9H808	572 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	MTRR	Q9UBK8	725 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	HMGXB4	Q9UGU5	601 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	TMEM98	Q9Y2Y6	226 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	CKAP5	Q14008	2032 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	MIA3	Q5JRA6	1907 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	TICRR	Q7Z2Z1	1910 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	MYO15A	Q9UKN7	3530 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	BDP1	A6H8Y1	2624 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	TEX13C	A0A0J9YWL9	993 aa		7.36	□□□□□ -1.23

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.8 ms