RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531908.5

RPS13-208, Transcript of ribosomal protein S13, human

TSL 2

Gene RPS13, Length 746 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS13-208	ENST00000531908	FKRP	Q9H9S5	495 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	SEBOX	Q9HB31	216 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	ZNF580	Q9UK33	172 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	VPS28	Q9UK41	221 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	KLHL20	Q9Y2M5	609 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	CMAHP	Q9Y471	501 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	LILRA5	A6NI73	299 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	SRRM3	A6NNA2	597 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	MAP2K7	O14733	419 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	AP5Z1	O43299	807 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	PPIP5K2	O43314	1243 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	KIN	O60870	393 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	PPP1R3D	O95685	299 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	PDHB	P11177	359 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	AKR1B1	P15121	316 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	ANXA7	P20073	488 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	S1PR1	P21453	382 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	KRT2	P35908	639 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	MC1R	Q01726	317 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	CHAF1B	Q13112	559 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	SYT16	Q17RD7	645 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	SETMAR	Q53H47	684 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	SPATA1	Q5VX52	437 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	C18orf63	Q68DL7	685 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	TUBA1A	Q71U36	451 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	BLID	Q8IZY5	108 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	C4orf32	Q8N8J7	132 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	OR2AK2	Q8NG84	335 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	UTP15	Q8TED0	518 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	PIGT	Q969N2	578 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	SAT2	Q96F10	170 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	ELMOD3	Q96FG2	381 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	OR2A14	Q96R47	310 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	TUBA1C	Q9BQE3	449 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	PIGM	Q9H3S5	423 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	BARHL2	Q9NY43	387 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	NYAP2	Q9P242	653 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	FBXL17	Q9UF56	701 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	KCNS2	Q9ULS6	477 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	STX8	Q9UNK0	236 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	PLIN4	Q96Q06	1357 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	SMTNL1	A8MU46	457 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908		B4DLN1	442 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	PSMD14	O00487	310 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	SMAD9	O15198	467 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	GOLGA8H	P0CJ92	632 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	PFKFB1	P16118	471 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	UGT1A1	P22309	533 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	HADHA	P40939	763 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	MSH2	P43246	934 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	SYK	P43405	635 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	MMP14	P50281	582 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	GPR143	P51810	404 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	MRPL12	P52815	198 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	RPL36A	P83881	106 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	CREB5	Q02930	508 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	EEF1A2	Q05639	463 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	CXCL9	Q07325	125 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	TCP10	Q12799	353 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	PRKG2	Q13237	762 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	PLEKHS1	Q5SXH7	462 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	PMS2CL	Q68D20	193 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	PAPD4	Q6PIY7	484 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	FASTKD5	Q7L8L6	764 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	TSPAN33	Q86UF1	283 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	KMT5C	Q86Y97	462 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	MAP7D3	Q8IWC1	876 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	TAGAP	Q8N103	731 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	MUC20	Q8N307	709 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	EMC1	Q8N766	993 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	SMRP1	Q8NCR6	262 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	TRPC4AP	Q8TEL6	797 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	SECTM1	Q8WVN6	248 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	FAM151A	Q8WW52	585 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	ABTB1	Q969K4	478 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	FAM120B	Q96EK7	910 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	CALML4	Q96GE6	196 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	FEM1C	Q96JP0	617 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	CCDC68	Q9H2F9	335 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	GHITM	Q9H3K2	345 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	DNAJC18	Q9H819	358 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	TMEM30A	Q9NV96	361 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	SETD4	Q9NVD3	440 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	ANO10	Q9NW15	660 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	MTMR10	Q9NXD2	777 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	NSMCE4A	Q9NXX6	385 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	TUBE1	Q9UJT0	475 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	NENF	Q9UMX5	172 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	MAST2	Q6P0Q8	1798 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		4.89	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.3 ms