RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504450.1

SH3BP2-209, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 844 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SH3BP2-209ENST00000504450 PPP3R2Q96LZ3 170 aa10.54□□□□□ -0.72
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SH3BP2-209ENST00000504450 ZFP14Q9HCL3 533 aa10.54□□□□□ -0.72
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SH3BP2-209ENST00000504450 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa10.54□□□□□ -0.72
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SH3BP2-209ENST00000504450 ANTXRLA6NF34 631 aa10.53□□□□□ -0.72
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SH3BP2-209ENST00000504450 PEX1O43933 1283 aa10.53□□□□□ -0.72
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SH3BP2-209ENST00000504450 CLDN9O95484 217 aa10.53□□□□□ -0.72
SH3BP2-209ENST00000504450 C8BP07358 591 aa10.53□□□□□ -0.72
SH3BP2-209ENST00000504450 RPSAP08865 295 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
SH3BP2-209ENST00000504450 GSTM1P09488 218 aa10.53□□□□□ -0.72
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SH3BP2-209ENST00000504450 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa10.53□□□□□ -0.72
SH3BP2-209ENST00000504450 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
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SH3BP2-209ENST00000504450 NME4O00746 187 aa10.52□□□□□ -0.73
SH3BP2-209ENST00000504450 NPC1O15118 1278 aa10.52□□□□□ -0.73
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SH3BP2-209ENST00000504450 ATG13O75143 517 aa10.52□□□□□ -0.73
SH3BP2-209ENST00000504450 ULK1O75385 1050 aa10.52□□□□□ -0.73
SH3BP2-209ENST00000504450 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
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