RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	TTPA	P49638	278 aa		16.78	■□□□□ 0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	ITGA8	P53708	1063 aa		16.78	■□□□□ 0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	CAV1	Q03135	178 aa		16.78	■□□□□ 0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	MRNIP	Q6NTE8	343 aa		16.78	■□□□□ 0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF517	Q6ZMY9	492 aa	Predicted RBP	16.78	■□□□□ 0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF534	Q76KX8	674 aa		16.78	■□□□□ 0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	CLDN19	Q8N6F1	224 aa		16.78	■□□□□ 0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	FERD3L	Q96RJ6	166 aa		16.78	■□□□□ 0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	CARD6	Q9BX69	1037 aa		16.78	■□□□□ 0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC25A18	Q9H1K4	315 aa		16.78	■□□□□ 0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	LHX9	Q9NQ69	397 aa		16.78	■□□□□ 0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	CATSPERZ	Q9NTU4	200 aa		16.78	■□□□□ 0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	OR6C2	Q9NZP2	312 aa		16.78	■□□□□ 0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	WHRN	Q9P202	907 aa		16.78	■□□□□ 0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC2A6	Q9UGQ3	507 aa		16.78	■□□□□ 0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	CFAP20	Q9Y6A4	193 aa	Known RBP	16.78	■□□□□ 0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC5A10	A0PJK1	596 aa		16.77	■□□□□ 0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	CD3EAP	O15446	510 aa	Known RBP	16.77	■□□□□ 0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	RAD51C	O43502	376 aa		16.77	■□□□□ 0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	SEC31A	O94979	1220 aa	Known RBP	16.77	■□□□□ 0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	TTC4	O95801	387 aa		16.77	■□□□□ 0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	FOLR1	P15328	257 aa		16.77	■□□□□ 0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	TCN2	P20062	427 aa		16.77	■□□□□ 0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	IVD	P26440	423 aa		16.77	■□□□□ 0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	ACADL	P28330	430 aa		16.77	■□□□□ 0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	NMBR	P28336	390 aa		16.77	■□□□□ 0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	KPNA2	P52292	529 aa	Known RBP	16.77	■□□□□ 0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	CDC20	Q12834	499 aa		16.77	■□□□□ 0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	THOC5	Q13769	683 aa	Known RBP	16.77	■□□□□ 0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	HIF1A	Q16665	826 aa		16.77	■□□□□ 0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	KCTD19	Q17RG1	926 aa	Predicted RBP	16.77	■□□□□ 0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	HIBCH	Q6NVY1	386 aa	Predicted RBP	16.77	■□□□□ 0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	AMIGO1	Q86WK6	493 aa		16.77	■□□□□ 0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	LRRC6	Q86X45	466 aa		16.77	■□□□□ 0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	LILRA3	Q8N6C8	439 aa	Predicted RBP	16.77	■□□□□ 0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	OR4E2	Q8NGC2	313 aa		16.77	■□□□□ 0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	APOBEC4	Q8WW27	367 aa	Known RBP	16.77	■□□□□ 0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	STARD8	Q92502	1023 aa		16.77	■□□□□ 0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	LRRC39	Q96DD0	335 aa		16.77	■□□□□ 0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	FANCE	Q9HB96	536 aa		16.77	■□□□□ 0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	TREX1	Q9NSU2	369 aa		16.77	■□□□□ 0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	SNX24	Q9Y343	169 aa		16.77	■□□□□ 0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	C2orf74	A8MZ97	194 aa		16.76	■□□□□ 0.27
HDAC10-216	ENST00000489424		J3QKU1	62 aa		16.76	■□□□□ 0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	KPNA5	O15131	536 aa		16.76	■□□□□ 0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	CPNE3	O75131	537 aa	Known RBP	16.76	■□□□□ 0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	USP1	O94782	785 aa		16.76	■□□□□ 0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	VAPB	O95292	243 aa		16.76	■□□□□ 0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF28	P17035	718 aa		16.76	■□□□□ 0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	PDHA2	P29803	388 aa		16.76	■□□□□ 0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	PRDX3	P30048	256 aa	Known RBP	16.76	■□□□□ 0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	SHMT2	P34897	504 aa		16.76	■□□□□ 0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	BBS9	Q3SYG4	887 aa		16.76	■□□□□ 0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	GLE1	Q53GS7	698 aa	Known RBP	16.76	■□□□□ 0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	PWWP2B	Q6NUJ5	590 aa		16.76	■□□□□ 0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	GALNT6	Q8NCL4	622 aa		16.76	■□□□□ 0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	OR52E1	Q8NGJ3	308 aa		16.76	■□□□□ 0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	OR5K2	Q8NHB8	316 aa		16.76	■□□□□ 0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	CALML6	Q8TD86	181 aa		16.76	■□□□□ 0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	ASZ1	Q8WWH4	475 aa		16.76	■□□□□ 0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF669	Q96BR6	464 aa	Predicted RBP	16.76	■□□□□ 0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF501	Q96CX3	271 aa	Predicted RBP	16.76	■□□□□ 0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF778	Q96MU6	729 aa		16.76	■□□□□ 0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	TCF12	Q99081	682 aa		16.76	■□□□□ 0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	DPH2	Q9BQC3	489 aa	Predicted RBP	16.76	■□□□□ 0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	DPH5	Q9H2P9	285 aa		16.76	■□□□□ 0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	IL17B	Q9UHF5	180 aa		16.76	■□□□□ 0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	LNPEP	Q9UIQ6	1025 aa		16.76	■□□□□ 0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	VPS9D1	Q9Y2B5	631 aa		16.76	■□□□□ 0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	SPTA1	P02549	2419 aa		16.75	■□□□□ 0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	NKX2-8	O15522	239 aa		16.75	■□□□□ 0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	NDUFS3	O75489	264 aa		16.75	■□□□□ 0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	RPN2	P04844	631 aa		16.75	■□□□□ 0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	PGAM1	P18669	254 aa		16.75	■□□□□ 0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	POLR2C	P19387	275 aa	Predicted RBP	16.75	■□□□□ 0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	CDH3	P22223	829 aa		16.75	■□□□□ 0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	DLST	P36957	453 aa		16.75	■□□□□ 0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	MAGEA3	P43357	314 aa		16.75	■□□□□ 0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	RPL21	P46778	160 aa	Known RBP	16.75	■□□□□ 0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	PPP1CA	P62136	330 aa		16.75	■□□□□ 0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	CYP4F2	P78329	520 aa		16.75	■□□□□ 0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	ANKRD20A4	Q4UJ75	823 aa		16.75	■□□□□ 0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	RNF187	Q5TA31	235 aa	Predicted RBP	16.75	■□□□□ 0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	KIAA0930	Q6ICG6	404 aa	Predicted RBP	16.75	■□□□□ 0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	DUS1L	Q6P1R4	473 aa	Known RBP	16.75	■□□□□ 0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	CENPU	Q71F23	418 aa		16.75	■□□□□ 0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	ADGRF3	Q8IZF5	1079 aa		16.75	■□□□□ 0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	MMGT1	Q8N4V1	131 aa		16.75	■□□□□ 0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	ELMO1	Q92556	727 aa		16.75	■□□□□ 0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	MFSD3	Q96ES6	412 aa		16.75	■□□□□ 0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	SIGLEC10	Q96LC7	697 aa		16.75	■□□□□ 0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	CROT	Q9UKG9	612 aa		16.75	■□□□□ 0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	OR51F1	A6NGY5	319 aa		16.74	■□□□□ 0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	PRMT5	O14744	637 aa	Predicted RBP	16.74	■□□□□ 0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	GPC4	O75487	556 aa		16.74	■□□□□ 0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	FKBP9	O95302	570 aa		16.74	■□□□□ 0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	KLK3	P07288	261 aa	Predicted RBP	16.74	■□□□□ 0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	HBQ1	P09105	142 aa		16.74	■□□□□ 0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	RAB40AL	P0C0E4	278 aa		16.74	■□□□□ 0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	EBLN1	P0CF75	366 aa		16.74	■□□□□ 0.27

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