RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487876.1

RPSA-208, Transcript of ribosomal protein SA, human

TSL 4

Gene RPSA, Length 572 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPSA-208	ENST00000487876	ABR	Q12979	859 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RPSA-208	ENST00000487876	LY6D	Q14210	128 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RPSA-208	ENST00000487876	GRB7	Q14451	532 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RPSA-208	ENST00000487876	LARP7	Q4G0J3	582 aa	Known RBP eCLIP	12.5	□□□□□ -0.41
RPSA-208	ENST00000487876	TAF1B	Q53T94	588 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
RPSA-208	ENST00000487876	ZNF470	Q6ECI4	717 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RPSA-208	ENST00000487876	NEPRO	Q6NW34	567 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RPSA-208	ENST00000487876	CENPU	Q71F23	418 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RPSA-208	ENST00000487876	TMEM135	Q86UB9	458 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RPSA-208	ENST00000487876	KMT5C	Q86Y97	462 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RPSA-208	ENST00000487876	CILP2	Q8IUL8	1156 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RPSA-208	ENST00000487876	FLVCR1-AS1	Q8TAF5	88 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RPSA-208	ENST00000487876	ASZ1	Q8WWH4	475 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RPSA-208	ENST00000487876	EXTL1	Q92935	676 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RPSA-208	ENST00000487876	SLCO2A1	Q92959	643 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RPSA-208	ENST00000487876	ZNF501	Q96CX3	271 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
RPSA-208	ENST00000487876	SIGLEC10	Q96LC7	697 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RPSA-208	ENST00000487876	SLC12A9	Q9BXP2	914 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RPSA-208	ENST00000487876	PITPNM3	Q9BZ71	974 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RPSA-208	ENST00000487876	SEMA4C	Q9C0C4	833 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RPSA-208	ENST00000487876	PDE7B	Q9NP56	450 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RPSA-208	ENST00000487876	GALP	Q9UBC7	116 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RPSA-208	ENST00000487876	IL17B	Q9UHF5	180 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RPSA-208	ENST00000487876	PCYOX1	Q9UHG3	505 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RPSA-208	ENST00000487876	RARRES3	Q9UL19	164 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RPSA-208	ENST00000487876	MRPS18B	Q9Y676	258 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
RPSA-208	ENST00000487876	SAR1B	Q9Y6B6	198 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RPSA-208	ENST00000487876	MAD1L1	Q9Y6D9	718 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RPSA-208	ENST00000487876	RPS6KL1	Q9Y6S9	549 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RPSA-208	ENST00000487876	COL6A6	A6NMZ7	2263 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RPSA-208	ENST00000487876	PIPSL	A2A3N6	862 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RPSA-208	ENST00000487876	CTAGE9	A4FU28	777 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RPSA-208	ENST00000487876	C2orf74	A8MZ97	194 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RPSA-208	ENST00000487876	MATN2	O00339	956 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RPSA-208	ENST00000487876	DNALI1	O14645	258 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
RPSA-208	ENST00000487876	SLCO2B1	O94956	709 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RPSA-208	ENST00000487876	NTRK1	P04629	796 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RPSA-208	ENST00000487876	CHRM5	P08912	532 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
RPSA-208	ENST00000487876	UGT2B7	P16662	529 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RPSA-208	ENST00000487876	PAM	P19021	973 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RPSA-208	ENST00000487876	OGN	P20774	298 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
RPSA-208	ENST00000487876	F8A1	P23610	371 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RPSA-208	ENST00000487876	IVD	P26440	423 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RPSA-208	ENST00000487876	PEBP1	P30086	187 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
RPSA-208	ENST00000487876	PKLR	P30613	574 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RPSA-208	ENST00000487876	SHMT2	P34897	504 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RPSA-208	ENST00000487876	SLC1A2	P43004	574 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RPSA-208	ENST00000487876	TUBB4B	P68371	445 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RPSA-208	ENST00000487876	ACY1	Q03154	408 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RPSA-208	ENST00000487876	ABHD18	Q0P651	414 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RPSA-208	ENST00000487876	CTBP1	Q13363	440 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RPSA-208	ENST00000487876	TUBB2A	Q13885	445 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RPSA-208	ENST00000487876	MAP7	Q14244	749 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RPSA-208	ENST00000487876	TMED2	Q15363	201 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RPSA-208	ENST00000487876	LINC00303	Q3SY05	128 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RPSA-208	ENST00000487876	MSS51	Q4VC12	460 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RPSA-208	ENST00000487876	DNAJC21	Q5F1R6	531 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
RPSA-208	ENST00000487876	PRAMEF17	Q5VTA0	474 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RPSA-208	ENST00000487876	IZUMO3	Q5VZ72	239 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RPSA-208	ENST00000487876	SPESP1	Q6UW49	350 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RPSA-208	ENST00000487876	C6orf15	Q6UXA7	325 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
RPSA-208	ENST00000487876	SDCCAG8	Q86SQ7	713 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
RPSA-208	ENST00000487876	LRRC6	Q86X45	466 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RPSA-208	ENST00000487876	DENND6A	Q8IWF6	608 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RPSA-208	ENST00000487876	FAM20C	Q8IXL6	584 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RPSA-208	ENST00000487876	CARF	Q8N187	725 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RPSA-208	ENST00000487876	ZSCAN1	Q8NBB4	408 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RPSA-208	ENST00000487876	STAMBPL1	Q96FJ0	436 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RPSA-208	ENST00000487876	PWWP2A	Q96N64	755 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RPSA-208	ENST00000487876	IL17F	Q96PD4	163 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RPSA-208	ENST00000487876	TRAPPC9	Q96Q05	1148 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RPSA-208	ENST00000487876	PANX3	Q96QZ0	392 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RPSA-208	ENST00000487876	TRIM51	Q9BSJ1	452 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RPSA-208	ENST00000487876	MENT	Q9BUN1	341 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RPSA-208	ENST00000487876	TUBB2B	Q9BVA1	445 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RPSA-208	ENST00000487876	AKIRIN1	Q9H9L7	192 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
RPSA-208	ENST00000487876	GPN2	Q9H9Y4	310 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
RPSA-208	ENST00000487876	FBXO6	Q9NRD1	293 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
RPSA-208	ENST00000487876	C1GALT1	Q9NS00	363 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RPSA-208	ENST00000487876	POLG2	Q9UHN1	485 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RPSA-208	ENST00000487876	NFS1	Q9Y697	457 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RPSA-208	ENST00000487876	S1PR4	O95977	384 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RPSA-208	ENST00000487876	BDKRB1	P46663	353 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RPSA-208	ENST00000487876	DHX9	Q08211	1270 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
RPSA-208	ENST00000487876	COL9A2	Q14055	689 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
RPSA-208	ENST00000487876	ZIC1	Q15915	447 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RPSA-208	ENST00000487876	CCSMST1	Q4G0I0	132 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RPSA-208	ENST00000487876	TMTC4	Q5T4D3	741 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RPSA-208	ENST00000487876	RNF187	Q5TA31	235 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
RPSA-208	ENST00000487876	ATP1A1-AS1	Q5TC04	95 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RPSA-208	ENST00000487876	ARMC3	Q5W041	872 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RPSA-208	ENST00000487876	UNC5D	Q6UXZ4	953 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RPSA-208	ENST00000487876	CDHR3	Q6ZTQ4	885 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RPSA-208	ENST00000487876	OTOA	Q7RTW8	1153 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RPSA-208	ENST00000487876	TAX1BP1	Q86VP1	789 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RPSA-208	ENST00000487876	IGDCC3	Q8IVU1	814 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RPSA-208	ENST00000487876	C2orf73	Q8N5S3	287 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
RPSA-208	ENST00000487876	ESX1	Q8N693	406 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RPSA-208	ENST00000487876	LINC01555	Q8NAE3	123 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RPSA-208	ENST00000487876	SKA2	Q8WVK7	121 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41

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