RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486917.1

PRRT1-208, Transcript of proline rich transmembrane protein 1, human

TSL 5

Gene PRRT1, Length 620 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRRT1-208	ENST00000486917	PTPN7	P35236	360 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PRRT1-208	ENST00000486917	EIF3E	P60228	445 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
PRRT1-208	ENST00000486917	GSTM4	Q03013	218 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PRRT1-208	ENST00000486917	SPARCL1	Q14515	664 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PRRT1-208	ENST00000486917	MYBPC3	Q14896	1274 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PRRT1-208	ENST00000486917	NR6A1	Q15406	480 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PRRT1-208	ENST00000486917	DCAF10	Q5QP82	559 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PRRT1-208	ENST00000486917	CCDC181	Q5TID7	509 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PRRT1-208	ENST00000486917	RHBDD2	Q6NTF9	364 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PRRT1-208	ENST00000486917	ZNF449	Q6P9G9	518 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PRRT1-208	ENST00000486917	IGFL3	Q6UXB1	125 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PRRT1-208	ENST00000486917	TRIM73	Q86UV7	250 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PRRT1-208	ENST00000486917	CLDN19	Q8N6F1	224 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PRRT1-208	ENST00000486917	OR5AR1	Q8NGP9	310 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PRRT1-208	ENST00000486917	FLVCR1-AS1	Q8TAF5	88 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PRRT1-208	ENST00000486917	TBRG4	Q969Z0	631 aa	Known RBP eCLIP	13.77	□□□□□ -0.21
PRRT1-208	ENST00000486917	FER1L6-AS2	Q96M78	137 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PRRT1-208	ENST00000486917	PPP1R2P1	Q96PQ5	205 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PRRT1-208	ENST00000486917	OR2A14	Q96R47	310 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PRRT1-208	ENST00000486917	FAM118B	Q9BPY3	351 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PRRT1-208	ENST00000486917	SPRTN	Q9H040	489 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
PRRT1-208	ENST00000486917	ASF1B	Q9NVP2	202 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PRRT1-208	ENST00000486917	B3GNT3	Q9Y2A9	372 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PRRT1-208	ENST00000486917	MACROD2	A1Z1Q3	448 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PRRT1-208	ENST00000486917	CNOT3	O75175	753 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
PRRT1-208	ENST00000486917	STK10	O94804	968 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
PRRT1-208	ENST00000486917	CLDN1	O95832	211 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PRRT1-208	ENST00000486917	LDLR	P01130	860 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PRRT1-208	ENST00000486917	CTSB	P07858	339 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PRRT1-208	ENST00000486917	TPBGL	P0DKB5	382 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PRRT1-208	ENST00000486917	ACADL	P28330	430 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PRRT1-208	ENST00000486917	SHMT2	P34897	504 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PRRT1-208	ENST00000486917	FOLR3	P41439	243 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PRRT1-208	ENST00000486917	KYNU	Q16719	465 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PRRT1-208	ENST00000486917	DEFB110	Q30KQ9	67 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PRRT1-208	ENST00000486917	ZRANB3	Q5FWF4	1079 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PRRT1-208	ENST00000486917	CRB2	Q5IJ48	1285 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PRRT1-208	ENST00000486917	C1orf189	Q5VU69	101 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PRRT1-208	ENST00000486917	MLIP	Q5VWP3	458 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PRRT1-208	ENST00000486917	KCTD11	Q693B1	232 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PRRT1-208	ENST00000486917	DARS2	Q6PI48	645 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
PRRT1-208	ENST00000486917	UNC5A	Q6ZN44	842 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PRRT1-208	ENST00000486917	MAMDC2	Q7Z304	686 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
PRRT1-208	ENST00000486917	PIANP	Q8IYJ0	282 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PRRT1-208	ENST00000486917	GALNT16	Q8N428	558 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PRRT1-208	ENST00000486917	CLEC1A	Q8NC01	280 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PRRT1-208	ENST00000486917	OR2Y1	Q8NGV0	311 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PRRT1-208	ENST00000486917	PROKR1	Q8TCW9	393 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PRRT1-208	ENST00000486917	N4BP2L2	Q92802	583 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
PRRT1-208	ENST00000486917	INPP5D	Q92835	1189 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PRRT1-208	ENST00000486917	OSBPL8	Q9BZF1	889 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PRRT1-208	ENST00000486917	ZNF552	Q9H707	407 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
PRRT1-208	ENST00000486917	NLE1	Q9NVX2	485 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
PRRT1-208	ENST00000486917	PTRH2	Q9Y3E5	179 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
PRRT1-208	ENST00000486917	PCDHA3	Q9Y5H8	950 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PRRT1-208	ENST00000486917	CROCC	Q5TZA2	2017 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PRRT1-208	ENST00000486917	LIN7A	O14910	233 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
PRRT1-208	ENST00000486917	ZSCAN9	O15535	394 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
PRRT1-208	ENST00000486917	AP2A2	O94973	939 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PRRT1-208	ENST00000486917	IGHE	P01854	428 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PRRT1-208	ENST00000486917	ALPP	P05187	535 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PRRT1-208	ENST00000486917	CHRM5	P08912	532 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
PRRT1-208	ENST00000486917	CD63	P08962	238 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PRRT1-208	ENST00000486917	CTNNA2	P26232	953 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PRRT1-208	ENST00000486917	SOX8	P57073	446 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PRRT1-208	ENST00000486917	DCD	P81605	110 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
PRRT1-208	ENST00000486917	CACNG1	Q06432	222 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PRRT1-208	ENST00000486917	DBN1	Q16643	649 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PRRT1-208	ENST00000486917	ZNF787	Q6DD87	383 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PRRT1-208	ENST00000486917	MRPL14	Q6P1L8	145 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
PRRT1-208	ENST00000486917	TAS2R42	Q7RTR8	314 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PRRT1-208	ENST00000486917	PPP1R32	Q7Z5V6	425 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PRRT1-208	ENST00000486917	HOOK3	Q86VS8	718 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PRRT1-208	ENST00000486917	TMEM151B	Q8IW70	566 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PRRT1-208	ENST00000486917	CISD2	Q8N5K1	135 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
PRRT1-208	ENST00000486917	TC2N	Q8N9U0	490 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PRRT1-208	ENST00000486917	CDKN2AIPNL	Q96HQ2	116 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PRRT1-208	ENST00000486917	RANBP9	Q96S59	729 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PRRT1-208	ENST00000486917	BARD1	Q99728	777 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
PRRT1-208	ENST00000486917	AP1M1	Q9BXS5	423 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PRRT1-208	ENST00000486917	P4HTM	Q9NXG6	502 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PRRT1-208	ENST00000486917	SPHK1	Q9NYA1	384 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PRRT1-208	ENST00000486917	OR6C2	Q9NZP2	312 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PRRT1-208	ENST00000486917	IFT80	Q9P2H3	777 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
PRRT1-208	ENST00000486917	DHCR7	Q9UBM7	475 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
PRRT1-208	ENST00000486917	GPN3	Q9UHW5	284 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
PRRT1-208	ENST00000486917	SRPK3	Q9UPE1	567 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PRRT1-208	ENST00000486917	CDYL	Q9Y232	598 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PRRT1-208	ENST00000486917	ASF1A	Q9Y294	204 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PRRT1-208	ENST00000486917	PCDHA13	Q9Y5I0	950 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PRRT1-208	ENST00000486917	PRSS21	Q9Y6M0	314 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PRRT1-208	ENST00000486917		A0A0J9YY10	115 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PRRT1-208	ENST00000486917	MASP2	O00187	686 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PRRT1-208	ENST00000486917	PEX12	O00623	359 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PRRT1-208	ENST00000486917	KLHL41	O60662	606 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PRRT1-208	ENST00000486917	IPO13	O94829	963 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
PRRT1-208	ENST00000486917	UMOD	P07911	640 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PRRT1-208	ENST00000486917	PSMA3	P25788	255 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PRRT1-208	ENST00000486917	COL8A1	P27658	744 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PRRT1-208	ENST00000486917	NSG1	P42857	185 aa		13.74	□□□□□ -0.21

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