RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466681.1

MALSU1-202, Transcript of mitochondrial assembly of ribosomal large subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MALSU1, Length 3,044 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1-202ENST00000466681 FAM25GB3EWG6 89 aa14.73□□□□□ -0.05
MALSU1-202ENST00000466681 M0R082 166 aa14.73□□□□□ -0.05
MALSU1-202ENST00000466681 TREHO43280 583 aa14.73□□□□□ -0.05
MALSU1-202ENST00000466681 ECI2O75521 394 aa14.73□□□□□ -0.05
MALSU1-202ENST00000466681 RHOBTB1O94844 696 aa14.73□□□□□ -0.05
MALSU1-202ENST00000466681 RRM2P31350 389 aa14.73□□□□□ -0.05
MALSU1-202ENST00000466681 ERVK-8P63133 956 aa14.73□□□□□ -0.05
MALSU1-202ENST00000466681 TUBA1BP68363 451 aa14.73□□□□□ -0.05
MALSU1-202ENST00000466681 MAPKAPK3Q16644 382 aa14.73□□□□□ -0.05
MALSU1-202ENST00000466681 FBXO47Q5MNV8 452 aa14.73□□□□□ -0.05
MALSU1-202ENST00000466681 TUBA1AQ71U36 451 aa14.73□□□□□ -0.05
MALSU1-202ENST00000466681 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
MALSU1-202ENST00000466681 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa14.73□□□□□ -0.05
MALSU1-202ENST00000466681 FAM167AQ96KS9 214 aa14.73□□□□□ -0.05
MALSU1-202ENST00000466681 APOL4Q9BPW4 351 aa14.73□□□□□ -0.05
MALSU1-202ENST00000466681 SLC39A8Q9C0K1 460 aa14.73□□□□□ -0.05
MALSU1-202ENST00000466681 SLC6A13Q9NSD5 602 aa14.73□□□□□ -0.05
MALSU1-202ENST00000466681 GPR83Q9NYM4 423 aa14.73□□□□□ -0.05
MALSU1-202ENST00000466681 FBXW11Q9UKB1 542 aa14.73□□□□□ -0.05
MALSU1-202ENST00000466681 KCNH4Q9UQ05 1017 aa14.73□□□□□ -0.05
MALSU1-202ENST00000466681 ARL5AQ9Y689 179 aa14.73□□□□□ -0.05
MALSU1-202ENST00000466681 QSER1Q2KHR3 1735 aa14.73□□□□□ -0.05
MALSU1-202ENST00000466681 NRXN2Q9P2S2 1712 aa14.73□□□□□ -0.05
MALSU1-202ENST00000466681 TNFRSF21O75509 655 aa14.73□□□□□ -0.05
MALSU1-202ENST00000466681 C1QCP02747 245 aa14.73□□□□□ -0.05
MALSU1-202ENST00000466681 STSP08842 583 aa14.73□□□□□ -0.05
MALSU1-202ENST00000466681 CCNYL3P0C7X3 344 aa14.73□□□□□ -0.05
MALSU1-202ENST00000466681 SSTR4P31391 388 aa14.73□□□□□ -0.05
MALSU1-202ENST00000466681 RYKP34925 604 aa14.73□□□□□ -0.05
MALSU1-202ENST00000466681 GEMP55040 296 aa14.73□□□□□ -0.05
MALSU1-202ENST00000466681 MED22Q15528 200 aa14.73□□□□□ -0.05
MALSU1-202ENST00000466681 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
MALSU1-202ENST00000466681 AP5B1Q2VPB7 878 aa14.73□□□□□ -0.05
MALSU1-202ENST00000466681 CDONQ4KMG0 1287 aa14.73□□□□□ -0.05
MALSU1-202ENST00000466681 VTCN1Q7Z7D3 282 aa14.73□□□□□ -0.05
MALSU1-202ENST00000466681 ZFAND4Q86XD8 727 aa14.73□□□□□ -0.05
MALSU1-202ENST00000466681 CAMKK1Q8N5S9 505 aa14.73□□□□□ -0.05
MALSU1-202ENST00000466681 RDH12Q96NR8 316 aa14.73□□□□□ -0.05
MALSU1-202ENST00000466681 TTPALQ9BTX7 342 aa14.73□□□□□ -0.05
MALSU1-202ENST00000466681 KRT84Q9NSB2 600 aa14.73□□□□□ -0.05
MALSU1-202ENST00000466681 CD274Q9NZQ7 290 aa14.73□□□□□ -0.05
MALSU1-202ENST00000466681 GABRQQ9UN88 632 aa14.73□□□□□ -0.05
MALSU1-202ENST00000466681 A8MX80 341 aa14.72□□□□□ -0.05
MALSU1-202ENST00000466681 H3BM21 787 aa14.72□□□□□ -0.05
MALSU1-202ENST00000466681 CREG1O75629 220 aa14.72□□□□□ -0.05
MALSU1-202ENST00000466681 KRT6AP02538 564 aa14.72□□□□□ -0.05
MALSU1-202ENST00000466681 KRT6BP04259 564 aa14.72□□□□□ -0.05
MALSU1-202ENST00000466681 YES1P07947 543 aa14.72□□□□□ -0.05
MALSU1-202ENST00000466681 IL12RB1P42701 662 aa14.72□□□□□ -0.05
MALSU1-202ENST00000466681 SCNN1GP51170 649 aa14.72□□□□□ -0.05
MALSU1-202ENST00000466681 ARHGDIAP52565 204 aa14.72□□□□□ -0.05
MALSU1-202ENST00000466681 RAB25P57735 213 aa14.72□□□□□ -0.05
MALSU1-202ENST00000466681 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
MALSU1-202ENST00000466681 SMARCB1Q12824 385 aa14.72□□□□□ -0.05
MALSU1-202ENST00000466681 BAK1Q16611 211 aa14.72□□□□□ -0.05
MALSU1-202ENST00000466681 SPANXN4Q5MJ08 99 aa14.72□□□□□ -0.05
MALSU1-202ENST00000466681 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
MALSU1-202ENST00000466681 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa14.72□□□□□ -0.05
MALSU1-202ENST00000466681 SPATA19Q7Z5L4 167 aa14.72□□□□□ -0.05
MALSU1-202ENST00000466681 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
MALSU1-202ENST00000466681 PGBD5Q8N414 524 aa14.72□□□□□ -0.05
MALSU1-202ENST00000466681 OR13C4Q8NGS5 318 aa14.72□□□□□ -0.05
MALSU1-202ENST00000466681 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
MALSU1-202ENST00000466681 GPR20Q99678 358 aa14.72□□□□□ -0.05
MALSU1-202ENST00000466681 DHRS9Q9BPW9 319 aa14.72□□□□□ -0.05
MALSU1-202ENST00000466681 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
MALSU1-202ENST00000466681 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
MALSU1-202ENST00000466681 PRM3Q9NNZ6 103 aa14.72□□□□□ -0.05
MALSU1-202ENST00000466681 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa14.72□□□□□ -0.05
MALSU1-202ENST00000466681 NPR3P17342 541 aa14.72□□□□□ -0.05
MALSU1-202ENST00000466681 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
MALSU1-202ENST00000466681 ACVR2AP27037 513 aa14.72□□□□□ -0.05
MALSU1-202ENST00000466681 HMGCS1Q01581 520 aa14.72□□□□□ -0.05
MALSU1-202ENST00000466681 DSC2Q02487 901 aa14.72□□□□□ -0.05
MALSU1-202ENST00000466681 DMC1Q14565 340 aa14.72□□□□□ -0.05
MALSU1-202ENST00000466681 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
MALSU1-202ENST00000466681 DDR2Q16832 855 aa14.72□□□□□ -0.05
MALSU1-202ENST00000466681 Q6ZSR9 355 aa14.72□□□□□ -0.05
MALSU1-202ENST00000466681 GLCCI1Q86VQ1 547 aa14.72□□□□□ -0.05
MALSU1-202ENST00000466681 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
MALSU1-202ENST00000466681 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa14.72□□□□□ -0.05
MALSU1-202ENST00000466681 SIMC1Q8NDZ2 872 aa14.72□□□□□ -0.05
MALSU1-202ENST00000466681 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
MALSU1-202ENST00000466681 GRPEL2Q8TAA5 225 aa14.72□□□□□ -0.05
MALSU1-202ENST00000466681 RASSF5Q8WWW0 418 aa14.72□□□□□ -0.05
MALSU1-202ENST00000466681 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
MALSU1-202ENST00000466681 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
MALSU1-202ENST00000466681 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
MALSU1-202ENST00000466681 BCL7BQ9BQE9 202 aa14.72□□□□□ -0.05
MALSU1-202ENST00000466681 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
MALSU1-202ENST00000466681 KIAA0513O60268 411 aa14.71□□□□□ -0.05
MALSU1-202ENST00000466681 PPP3CCP48454 512 aa14.71□□□□□ -0.05
MALSU1-202ENST00000466681 HUNKP57058 714 aa14.71□□□□□ -0.05
MALSU1-202ENST00000466681 RPP38P78345 283 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
MALSU1-202ENST00000466681 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
MALSU1-202ENST00000466681 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
MALSU1-202ENST00000466681 ARMCX4Q5H9R4 360 aa14.71□□□□□ -0.05
MALSU1-202ENST00000466681 FAM109AQ8N4B1 249 aa14.71□□□□□ -0.05
MALSU1-202ENST00000466681 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
MALSU1-202ENST00000466681 SLC30A2Q9BRI3 323 aa14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms