RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464168.5

USP4-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 4, humanhuman

TSL 4

Gene USP4, Length 601 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4-208ENST00000464168 RHBDD2Q6NTF9 364 aa21.85■■□□□ 1.09
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USP4-208ENST00000464168 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
USP4-208ENST00000464168 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP21.85■■□□□ 1.09
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USP4-208ENST00000464168 C17orf62Q9BQA9 187 aa21.85■■□□□ 1.09
USP4-208ENST00000464168 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa21.85■■□□□ 1.09
USP4-208ENST00000464168 ASF1BQ9NVP2 202 aa21.85■■□□□ 1.09
USP4-208ENST00000464168 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
USP4-208ENST00000464168 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa21.85■■□□□ 1.09
USP4-208ENST00000464168 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
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USP4-208ENST00000464168 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa21.85■■□□□ 1.09
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USP4-208ENST00000464168 CBX6O95503 412 aa21.84■■□□□ 1.09
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USP4-208ENST00000464168 KCTD11Q693B1 232 aa21.84■■□□□ 1.09
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USP4-208ENST00000464168 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa21.84■■□□□ 1.09
USP4-208ENST00000464168 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa21.84■■□□□ 1.09
USP4-208ENST00000464168 SPHK1Q9NYA1 384 aa21.84■■□□□ 1.09
USP4-208ENST00000464168 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
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USP4-208ENST00000464168 AP2A2O94973 939 aa21.83■■□□□ 1.09
USP4-208ENST00000464168 CTNNA2P26232 953 aa21.83■■□□□ 1.09
USP4-208ENST00000464168 ACADLP28330 430 aa21.83■■□□□ 1.09
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USP4-208ENST00000464168 CLEC1AQ8NC01 280 aa21.83■■□□□ 1.09
USP4-208ENST00000464168 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa21.83■■□□□ 1.09
USP4-208ENST00000464168 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
USP4-208ENST00000464168 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
USP4-208ENST00000464168 CDYLQ9Y232 598 aa21.83■■□□□ 1.09
USP4-208ENST00000464168 ASF1AQ9Y294 204 aa21.83■■□□□ 1.09
USP4-208ENST00000464168 PRSS21Q9Y6M0 314 aa21.83■■□□□ 1.09
USP4-208ENST00000464168 PEX12O00623 359 aa21.82■■□□□ 1.08
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USP4-208ENST00000464168 FOLR3P41439 243 aa21.82■■□□□ 1.08
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USP4-208ENST00000464168 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
USP4-208ENST00000464168 INPP5DQ92835 1189 aa21.81■■□□□ 1.08
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USP4-208ENST00000464168 BRD3Q15059 726 aa21.8■■□□□ 1.08
USP4-208ENST00000464168 SPA17Q15506 151 aa21.8■■□□□ 1.08
USP4-208ENST00000464168 PARP6Q2NL67 630 aa21.8■■□□□ 1.08
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