RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460094.1

CAMSAP1-204, Transcript of calmodulin regulated spectrin associated protein 1, human

TSL 2

Gene CAMSAP1, Length 371 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CAMSAP1-204	ENST00000460094	ANXA7	P20073	488 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
CAMSAP1-204	ENST00000460094	SP100	P23497	879 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
CAMSAP1-204	ENST00000460094	THOP1	P52888	689 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CAMSAP1-204	ENST00000460094	TFAP4	Q01664	338 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CAMSAP1-204	ENST00000460094	PPARD	Q03181	441 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CAMSAP1-204	ENST00000460094	ZKSCAN8	Q15776	578 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
CAMSAP1-204	ENST00000460094	GLDN	Q6ZMI3	551 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
CAMSAP1-204	ENST00000460094	DIS3L2	Q8IYB7	885 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
CAMSAP1-204	ENST00000460094	SCML4	Q8N228	414 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CAMSAP1-204	ENST00000460094	ETNPPL	Q8TBG4	499 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CAMSAP1-204	ENST00000460094	GMPPA	Q96IJ6	420 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
CAMSAP1-204	ENST00000460094	CAPNS2	Q96L46	248 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CAMSAP1-204	ENST00000460094	MYCBP	Q99417	103 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
CAMSAP1-204	ENST00000460094	PAIP2	Q9BPZ3	127 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
CAMSAP1-204	ENST00000460094	RHNO1	Q9BSD3	238 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CAMSAP1-204	ENST00000460094	MBNL1	Q9NR56	388 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
CAMSAP1-204	ENST00000460094	KCNE2	Q9Y6J6	123 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CAMSAP1-204	ENST00000460094	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CAMSAP1-204	ENST00000460094	FAM237B	A0A1B0GVD1	139 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CAMSAP1-204	ENST00000460094	CCER2	I3L3R5	266 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CAMSAP1-204	ENST00000460094	DCX	O43602	365 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CAMSAP1-204	ENST00000460094	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
CAMSAP1-204	ENST00000460094	SORBS2	O94875	1100 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
CAMSAP1-204	ENST00000460094	NGF	P01138	241 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CAMSAP1-204	ENST00000460094	HIST1H2AB	P04908	130 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CAMSAP1-204	ENST00000460094	HIST1H2AD	P20671	130 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CAMSAP1-204	ENST00000460094	CBL	P22681	906 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CAMSAP1-204	ENST00000460094	TNNT3	P45378	269 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
CAMSAP1-204	ENST00000460094	MRPS5	P82675	430 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
CAMSAP1-204	ENST00000460094	ZRSR2	Q15696	482 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
CAMSAP1-204	ENST00000460094	CTU2	Q2VPK5	515 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
CAMSAP1-204	ENST00000460094	TMEM31	Q5JXX7	168 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CAMSAP1-204	ENST00000460094	ALS2CL	Q60I27	953 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CAMSAP1-204	ENST00000460094	BHLHB9	Q6PI77	547 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CAMSAP1-204	ENST00000460094	HIST3H2A	Q7L7L0	130 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CAMSAP1-204	ENST00000460094	GPALPP1	Q8IXQ4	340 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CAMSAP1-204	ENST00000460094	ZNF843	Q8N446	348 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CAMSAP1-204	ENST00000460094	ZNF611	Q8N823	705 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CAMSAP1-204	ENST00000460094	HJURP	Q8NCD3	748 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
CAMSAP1-204	ENST00000460094	MNS1	Q8NEH6	495 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CAMSAP1-204	ENST00000460094	RBM4B	Q9BQ04	359 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
CAMSAP1-204	ENST00000460094	SEMA6A	Q9H2E6	1030 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CAMSAP1-204	ENST00000460094	CGN	Q9P2M7	1197 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
CAMSAP1-204	ENST00000460094	ASIC3	Q9UHC3	531 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CAMSAP1-204	ENST00000460094	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CAMSAP1-204	ENST00000460094	KIF3A	Q9Y496	699 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CAMSAP1-204	ENST00000460094	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CAMSAP1-204	ENST00000460094	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	3.79	□□□□□ -1.8
CAMSAP1-204	ENST00000460094	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CAMSAP1-204	ENST00000460094	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CAMSAP1-204	ENST00000460094	NOTCH2	Q04721	2471 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CAMSAP1-204	ENST00000460094	GIMAP1-GIMAP5	A0A087WTJ2	511 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CAMSAP1-204	ENST00000460094	HMGB1P1	B2RPK0	211 aa	Predicted RBP	3.79	□□□□□ -1.8
CAMSAP1-204	ENST00000460094	TMEM189-UBE2V1	I3L0A0	370 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CAMSAP1-204	ENST00000460094	SCAMP1	O15126	338 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CAMSAP1-204	ENST00000460094	ZBTB43	O43298	467 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CAMSAP1-204	ENST00000460094	TMCC2	O75069	709 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CAMSAP1-204	ENST00000460094	CLEC3B	P05452	202 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CAMSAP1-204	ENST00000460094	TYMP	P19971	482 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CAMSAP1-204	ENST00000460094	GPR143	P51810	404 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CAMSAP1-204	ENST00000460094	KCNJ10	P78508	379 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CAMSAP1-204	ENST00000460094	GAGE2B	Q13066	116 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CAMSAP1-204	ENST00000460094	UBE2V1	Q13404	147 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CAMSAP1-204	ENST00000460094	GAGE2E	Q4V326	116 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CAMSAP1-204	ENST00000460094	GAGE2A	Q6NT46	116 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CAMSAP1-204	ENST00000460094	ZNF613	Q6PF04	617 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CAMSAP1-204	ENST00000460094	DENND5B	Q6ZUT9	1274 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CAMSAP1-204	ENST00000460094	FASTKD5	Q7L8L6	764 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
CAMSAP1-204	ENST00000460094	SH2D6	Q7Z4S9	175 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CAMSAP1-204	ENST00000460094	ISCA2	Q86U28	154 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CAMSAP1-204	ENST00000460094	NGEF	Q8N5V2	710 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CAMSAP1-204	ENST00000460094	FRMD1	Q8N878	549 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CAMSAP1-204	ENST00000460094	L3MBTL4	Q8NA19	623 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CAMSAP1-204	ENST00000460094	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CAMSAP1-204	ENST00000460094	GSDMB	Q8TAX9	411 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CAMSAP1-204	ENST00000460094	GIMAP5	Q96F15	307 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CAMSAP1-204	ENST00000460094	PRAC1	Q96KF2	57 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CAMSAP1-204	ENST00000460094	TBATA	Q96M53	351 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CAMSAP1-204	ENST00000460094	TIGD1	Q96MW7	591 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CAMSAP1-204	ENST00000460094	SLC22A12	Q96S37	553 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CAMSAP1-204	ENST00000460094	VGLL1	Q99990	258 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CAMSAP1-204	ENST00000460094	MCRIP2	Q9BUT9	160 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
CAMSAP1-204	ENST00000460094	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CAMSAP1-204	ENST00000460094	KLHL8	Q9P2G9	620 aa	Predicted RBP	3.79	□□□□□ -1.8
CAMSAP1-204	ENST00000460094	GAGE2D	Q9UEU5	116 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CAMSAP1-204	ENST00000460094	LIMA1	Q9UHB6	759 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
CAMSAP1-204	ENST00000460094	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CAMSAP1-204	ENST00000460094	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
CAMSAP1-204	ENST00000460094	SAMD9	Q5K651	1589 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CAMSAP1-204	ENST00000460094	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CAMSAP1-204	ENST00000460094	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	3.79	□□□□□ -1.8
CAMSAP1-204	ENST00000460094	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CAMSAP1-204	ENST00000460094	CFAP46	Q8IYW2	2715 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CAMSAP1-204	ENST00000460094	CRB1	P82279	1406 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CAMSAP1-204	ENST00000460094	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CAMSAP1-204	ENST00000460094		H3BQ06	376 aa	Predicted RBP	3.78	□□□□□ -1.8
CAMSAP1-204	ENST00000460094	AP2A2	O94973	939 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CAMSAP1-204	ENST00000460094	EIF2S1	P05198	315 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
CAMSAP1-204	ENST00000460094	CCDC172	P0C7W6	258 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CAMSAP1-204	ENST00000460094	ATP1A3	P13637	1013 aa		3.78	□□□□□ -1.8

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.4 ms