RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447905.1

CSF2RBP1-201, Transcript of colony stimulating factor 2 receptor beta common subunit pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene CSF2RBP1, Length 391 nt, Biotype unprocessed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2RBP1-201ENST00000447905 FDFT1P37268 417 aa14.59□□□□□ -0.07
CSF2RBP1-201ENST00000447905 GRIA1P42261 906 aa14.59□□□□□ -0.07
CSF2RBP1-201ENST00000447905 PTGIRP43119 386 aa14.59□□□□□ -0.07
CSF2RBP1-201ENST00000447905 CD97P48960 835 aa14.59□□□□□ -0.07
CSF2RBP1-201ENST00000447905 PGDP52209 483 aa14.59□□□□□ -0.07
CSF2RBP1-201ENST00000447905 ITGA1P56199 1179 aa14.59□□□□□ -0.07
CSF2RBP1-201ENST00000447905 PTCHD3Q3KNS1 767 aa14.59□□□□□ -0.07
CSF2RBP1-201ENST00000447905 TSTD2Q5T7W7 516 aa14.59□□□□□ -0.07
CSF2RBP1-201ENST00000447905 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa14.59□□□□□ -0.07
CSF2RBP1-201ENST00000447905 CLEC18BQ6UXF7 455 aa14.59□□□□□ -0.07
CSF2RBP1-201ENST00000447905 TRIM73Q86UV7 250 aa14.59□□□□□ -0.07
CSF2RBP1-201ENST00000447905 HOOK3Q86VS8 718 aa14.59□□□□□ -0.07
CSF2RBP1-201ENST00000447905 CLEC18CQ8NCF0 446 aa14.59□□□□□ -0.07
CSF2RBP1-201ENST00000447905 OR5K2Q8NHB8 316 aa14.59□□□□□ -0.07
CSF2RBP1-201ENST00000447905 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa14.59□□□□□ -0.07
CSF2RBP1-201ENST00000447905 TCTN2Q96GX1 697 aa14.59□□□□□ -0.07
CSF2RBP1-201ENST00000447905 ZNF778Q96MU6 729 aa14.59□□□□□ -0.07
CSF2RBP1-201ENST00000447905 RANBP9Q96S59 729 aa14.59□□□□□ -0.07
CSF2RBP1-201ENST00000447905 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa14.59□□□□□ -0.07
CSF2RBP1-201ENST00000447905 SPHK1Q9NYA1 384 aa14.59□□□□□ -0.07
CSF2RBP1-201ENST00000447905 IMPACTQ9P2X3 320 aa14.59□□□□□ -0.07
CSF2RBP1-201ENST00000447905 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CSF2RBP1-201ENST00000447905 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CSF2RBP1-201ENST00000447905 MAST4O15021 2626 aa14.58□□□□□ -0.08
CSF2RBP1-201ENST00000447905 HEATR9A2RTY3 570 aa14.58□□□□□ -0.08
CSF2RBP1-201ENST00000447905 H3BMH7 237 aa14.58□□□□□ -0.08
CSF2RBP1-201ENST00000447905 HCRTR1O43613 425 aa14.58□□□□□ -0.08
CSF2RBP1-201ENST00000447905 GOT2P00505 430 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
CSF2RBP1-201ENST00000447905 IFNB1P01574 187 aa14.58□□□□□ -0.08
CSF2RBP1-201ENST00000447905 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
CSF2RBP1-201ENST00000447905 HBQ1P09105 142 aa14.58□□□□□ -0.08
CSF2RBP1-201ENST00000447905 ETS1P14921 441 aa14.58□□□□□ -0.08
CSF2RBP1-201ENST00000447905 ADRA1DP25100 572 aa14.58□□□□□ -0.08
CSF2RBP1-201ENST00000447905 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
CSF2RBP1-201ENST00000447905 ACVR1Q04771 509 aa14.58□□□□□ -0.08
CSF2RBP1-201ENST00000447905 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP14.58□□□□□ -0.08
CSF2RBP1-201ENST00000447905 ZIC1Q15915 447 aa14.58□□□□□ -0.08
CSF2RBP1-201ENST00000447905 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
CSF2RBP1-201ENST00000447905 FAM198BQ6UWH4 519 aa14.58□□□□□ -0.08
CSF2RBP1-201ENST00000447905 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa14.58□□□□□ -0.08
CSF2RBP1-201ENST00000447905 PRUNE1Q86TP1 453 aa14.58□□□□□ -0.08
CSF2RBP1-201ENST00000447905 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
CSF2RBP1-201ENST00000447905 ZBTB2Q8N680 514 aa14.58□□□□□ -0.08
CSF2RBP1-201ENST00000447905 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
CSF2RBP1-201ENST00000447905 OR4L1Q8NH43 312 aa14.58□□□□□ -0.08
CSF2RBP1-201ENST00000447905 C1orf54Q8WWF1 131 aa14.58□□□□□ -0.08
CSF2RBP1-201ENST00000447905 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP14.58□□□□□ -0.08
CSF2RBP1-201ENST00000447905 TTC1Q99614 292 aa14.58□□□□□ -0.08
CSF2RBP1-201ENST00000447905 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
CSF2RBP1-201ENST00000447905 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
CSF2RBP1-201ENST00000447905 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa14.58□□□□□ -0.08
CSF2RBP1-201ENST00000447905 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
CSF2RBP1-201ENST00000447905 OR6C2Q9NZP2 312 aa14.58□□□□□ -0.08
CSF2RBP1-201ENST00000447905 RIMKLBQ9ULI2 386 aa14.58□□□□□ -0.08
CSF2RBP1-201ENST00000447905 ZNF148Q9UQR1 794 aa14.58□□□□□ -0.08
CSF2RBP1-201ENST00000447905 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
CSF2RBP1-201ENST00000447905 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
CSF2RBP1-201ENST00000447905 DOCK10Q96BY6 2186 aa14.57□□□□□ -0.08
CSF2RBP1-201ENST00000447905 E7EVH7 732 aa14.57□□□□□ -0.08
CSF2RBP1-201ENST00000447905 CEACAM4O75871 244 aa14.57□□□□□ -0.08
CSF2RBP1-201ENST00000447905 TMEM63AO94886 807 aa14.57□□□□□ -0.08
CSF2RBP1-201ENST00000447905 AGXTP21549 392 aa14.57□□□□□ -0.08
CSF2RBP1-201ENST00000447905 GABRA4P48169 554 aa14.57□□□□□ -0.08
CSF2RBP1-201ENST00000447905 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
CSF2RBP1-201ENST00000447905 SNX1Q13596 522 aa14.57□□□□□ -0.08
CSF2RBP1-201ENST00000447905 NCF4Q15080 339 aa14.57□□□□□ -0.08
CSF2RBP1-201ENST00000447905 SYTL3Q4VX76 610 aa14.57□□□□□ -0.08
CSF2RBP1-201ENST00000447905 SEL1L2Q5TEA6 688 aa14.57□□□□□ -0.08
CSF2RBP1-201ENST00000447905 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
CSF2RBP1-201ENST00000447905 AFTPHQ6ULP2 937 aa14.57□□□□□ -0.08
CSF2RBP1-201ENST00000447905 ZNF534Q76KX8 674 aa14.57□□□□□ -0.08
CSF2RBP1-201ENST00000447905 GPR135Q8IZ08 494 aa14.57□□□□□ -0.08
CSF2RBP1-201ENST00000447905 OR6P1Q8NGX9 317 aa14.57□□□□□ -0.08
CSF2RBP1-201ENST00000447905 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
CSF2RBP1-201ENST00000447905 CASS4Q9NQ75 786 aa14.57□□□□□ -0.08
CSF2RBP1-201ENST00000447905 RAB6BQ9NRW1 208 aa14.57□□□□□ -0.08
CSF2RBP1-201ENST00000447905 ANKMY1Q9P2S6 941 aa14.57□□□□□ -0.08
CSF2RBP1-201ENST00000447905 PLAGL1Q9UM63 463 aa14.57□□□□□ -0.08
CSF2RBP1-201ENST00000447905 ESPL1Q14674 2120 aa14.57□□□□□ -0.08
CSF2RBP1-201ENST00000447905 LRRK2Q5S007 2527 aa14.57□□□□□ -0.08
CSF2RBP1-201ENST00000447905 NUP210LQ5VU65 1888 aa14.57□□□□□ -0.08
CSF2RBP1-201ENST00000447905 TTLL8A6PVC2 850 aa14.56□□□□□ -0.08
CSF2RBP1-201ENST00000447905 ZNF185O15231 689 aa14.56□□□□□ -0.08
CSF2RBP1-201ENST00000447905 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
CSF2RBP1-201ENST00000447905 OR2B3O76000 313 aa14.56□□□□□ -0.08
CSF2RBP1-201ENST00000447905 CTSBP07858 339 aa14.56□□□□□ -0.08
CSF2RBP1-201ENST00000447905 CBSLP0DN79 551 aa14.56□□□□□ -0.08
CSF2RBP1-201ENST00000447905 CDC25BP30305 580 aa14.56□□□□□ -0.08
CSF2RBP1-201ENST00000447905 CCR7P32248 378 aa14.56□□□□□ -0.08
CSF2RBP1-201ENST00000447905 CBSP35520 551 aa14.56□□□□□ -0.08
CSF2RBP1-201ENST00000447905 SEMA3AQ14563 771 aa14.56□□□□□ -0.08
CSF2RBP1-201ENST00000447905 DEFB110Q30KQ9 67 aa14.56□□□□□ -0.08
CSF2RBP1-201ENST00000447905 NADK2Q4G0N4 442 aa14.56□□□□□ -0.08
CSF2RBP1-201ENST00000447905 MED25Q71SY5 747 aa14.56□□□□□ -0.08
CSF2RBP1-201ENST00000447905 NLRP9Q7RTR0 991 aa14.56□□□□□ -0.08
CSF2RBP1-201ENST00000447905 ATCAYQ86WG3 371 aa14.56□□□□□ -0.08
CSF2RBP1-201ENST00000447905 VRK3Q8IV63 474 aa14.56□□□□□ -0.08
CSF2RBP1-201ENST00000447905 DNAJC22Q8N4W6 341 aa14.56□□□□□ -0.08
CSF2RBP1-201ENST00000447905 GLIS1Q8NBF1 620 aa14.56□□□□□ -0.08
CSF2RBP1-201ENST00000447905 FDCSPQ8NFU4 85 aa14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.6 ms