RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446904.5

SH3BP4-206, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 829 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-206ENST00000446904 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
SH3BP4-206ENST00000446904 BLACEA4D250 179 aa9.96□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 C9J4A7 227 aa9.96□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 PSMD3O43242 534 aa9.96□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 HCRTR1O43613 425 aa9.96□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 OR1I1O60431 355 aa9.96□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 VPS4BO75351 444 aa9.96□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 CEACAM4O75871 244 aa9.96□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 OR2B3O76000 313 aa9.96□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 TMEM63AO94886 807 aa9.96□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 CTSBP07858 339 aa9.96□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 TPBGLP0DKB5 382 aa9.96□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 CBSLP0DN79 551 aa9.96□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 GP1BBP13224 206 aa9.96□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 GNLYP22749 145 aa9.96□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 MSNP26038 577 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 ACADLP28330 430 aa9.96□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 OTX2P32243 289 aa9.96□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 SHMT2P34897 504 aa9.96□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 CBSP35520 551 aa9.96□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 RAPSNQ13702 412 aa9.96□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 ATP1A4Q13733 1029 aa9.96□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 ITIH4Q14624 930 aa9.96□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 ESPL1Q14674 2120 aa9.96□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 DEFB110Q30KQ9 67 aa9.96□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 SYTL3Q4VX76 610 aa9.96□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 C1orf189Q5VU69 101 aa9.96□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 GPR135Q8IZ08 494 aa9.96□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 SYCE1Q8N0S2 351 aa9.96□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 DNAAF3Q8N9W5 541 aa9.96□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 ATG4AQ8WYN0 398 aa9.96□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa9.96□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 DESI2Q9BSY9 194 aa9.96□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 NUDT9Q9BW91 350 aa9.96□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 RBSNQ9H1K0 784 aa9.96□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 SPHK1Q9NYA1 384 aa9.96□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 VPS4AQ9UN37 437 aa9.96□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa9.96□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa9.95□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa9.95□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa9.95□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 FTH1P02794 183 aa9.95□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 HBQ1P09105 142 aa9.95□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 AGXTP21549 392 aa9.95□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 PSMA3P25788 255 aa9.95□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 FOXN2P32314 431 aa9.95□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 KIF5AQ12840 1032 aa9.95□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 SLC9A5Q14940 896 aa9.95□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 MLIPQ5VWP3 458 aa9.95□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 LINC00523Q86TU6 105 aa9.95□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 RAB43Q86YS6 212 aa9.95□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 FAM20CQ8IXL6 584 aa9.95□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa9.95□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 GALNT11Q8NCW6 608 aa9.95□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 FDCSPQ8NFU4 85 aa9.95□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 OR13J1Q8NGT2 312 aa9.95□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa9.95□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 HDAC10Q969S8 669 aa9.95□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP9.95□□□□□ -0.822e-7■■■■■ 62.8
SH3BP4-206ENST00000446904 TCTN2Q96GX1 697 aa9.95□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 OR2A14Q96R47 310 aa9.95□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 IRAK4Q9NWZ3 460 aa9.95□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 OR6C2Q9NZP2 312 aa9.95□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 IMPACTQ9P2X3 320 aa9.95□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa9.95□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 POLG2Q9UHN1 485 aa9.95□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 PADI2Q9Y2J8 665 aa9.95□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 KLHL20Q9Y2M5 609 aa9.95□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa9.95□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa9.94□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 A0A0J9YY10 115 aa9.94□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 SLC5A10A0PJK1 596 aa9.94□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 QSOX1O00391 747 aa9.94□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 DPM1O60762 260 aa9.94□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 AGFG2O95081 481 aa9.94□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 GAS8O95995 478 aa9.94□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 GOT2P00505 430 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 IFNB1P01574 187 aa9.94□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 OR56A5P0C7T3 313 aa9.94□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 GRIA1P42261 906 aa9.94□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 GABRA4P48169 554 aa9.94□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 RRADP55042 308 aa9.94□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 FOXL2P58012 376 aa9.94□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 CDH17Q12864 832 aa9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms