RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431908.5

DDX39B-210, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 5

Gene DDX39B, Length 914 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-210ENST00000431908 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa11.49□□□□□ -0.57
DDX39B-210ENST00000431908 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
DDX39B-210ENST00000431908 SGTAO43765 313 aa11.48□□□□□ -0.57
DDX39B-210ENST00000431908 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
DDX39B-210ENST00000431908 DDAH2O95865 285 aa11.48□□□□□ -0.57
DDX39B-210ENST00000431908 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
DDX39B-210ENST00000431908 NSG1P42857 185 aa11.48□□□□□ -0.57
DDX39B-210ENST00000431908 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
DDX39B-210ENST00000431908 DCDP81605 110 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
DDX39B-210ENST00000431908 CACNG1Q06432 222 aa11.48□□□□□ -0.57
DDX39B-210ENST00000431908 OLIG2Q13516 323 aa11.48□□□□□ -0.57
DDX39B-210ENST00000431908 ATP1A4Q13733 1029 aa11.48□□□□□ -0.57
DDX39B-210ENST00000431908 LAMB3Q13751 1172 aa11.48□□□□□ -0.57
DDX39B-210ENST00000431908 SPARCL1Q14515 664 aa11.48□□□□□ -0.57
DDX39B-210ENST00000431908 PARP6Q2NL67 630 aa11.48□□□□□ -0.57
DDX39B-210ENST00000431908 P3H1Q32P28 736 aa11.48□□□□□ -0.57
DDX39B-210ENST00000431908 SPESP1Q6UW49 350 aa11.48□□□□□ -0.57
DDX39B-210ENST00000431908 LINC00523Q86TU6 105 aa11.48□□□□□ -0.57
DDX39B-210ENST00000431908 TMEM139Q8IV31 216 aa11.48□□□□□ -0.57
DDX39B-210ENST00000431908 IQCKQ8N0W5 287 aa11.48□□□□□ -0.57
DDX39B-210ENST00000431908 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
DDX39B-210ENST00000431908 GLIS1Q8NBF1 620 aa11.48□□□□□ -0.57
DDX39B-210ENST00000431908 STYXQ8WUJ0 223 aa11.48□□□□□ -0.57
DDX39B-210ENST00000431908 ELMO1Q92556 727 aa11.48□□□□□ -0.57
DDX39B-210ENST00000431908 KRT35Q92764 455 aa11.48□□□□□ -0.57
DDX39B-210ENST00000431908 PANX2Q96RD6 677 aa11.48□□□□□ -0.57
DDX39B-210ENST00000431908 NDC1Q9BTX1 674 aa11.48□□□□□ -0.57
DDX39B-210ENST00000431908 NUDT9Q9BW91 350 aa11.48□□□□□ -0.57
DDX39B-210ENST00000431908 TSSK1BQ9BXA7 367 aa11.48□□□□□ -0.57
DDX39B-210ENST00000431908 AP1M1Q9BXS5 423 aa11.48□□□□□ -0.57
DDX39B-210ENST00000431908 KLHL25Q9H0H3 589 aa11.48□□□□□ -0.57
DDX39B-210ENST00000431908 LRRC40Q9H9A6 602 aa11.48□□□□□ -0.57
DDX39B-210ENST00000431908 CASS4Q9NQ75 786 aa11.48□□□□□ -0.57
DDX39B-210ENST00000431908 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
DDX39B-210ENST00000431908 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
DDX39B-210ENST00000431908 SRPK3Q9UPE1 567 aa11.48□□□□□ -0.57
DDX39B-210ENST00000431908 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
DDX39B-210ENST00000431908 NUP210LQ5VU65 1888 aa11.48□□□□□ -0.57
DDX39B-210ENST00000431908 SHANK1Q9Y566 2161 aa11.48□□□□□ -0.57
DDX39B-210ENST00000431908 COL12A1Q99715 3063 aa11.47□□□□□ -0.57
DDX39B-210ENST00000431908 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa11.47□□□□□ -0.57
DDX39B-210ENST00000431908 CCDC78A2IDD5 438 aa11.47□□□□□ -0.57
DDX39B-210ENST00000431908 ISM1B1AKI9 464 aa11.47□□□□□ -0.57
DDX39B-210ENST00000431908 H7C0S8 307 aa11.47□□□□□ -0.57
DDX39B-210ENST00000431908 PJA2O43164 708 aa11.47□□□□□ -0.57
DDX39B-210ENST00000431908 OR56A5P0C7T3 313 aa11.47□□□□□ -0.57
DDX39B-210ENST00000431908 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
DDX39B-210ENST00000431908 PVRP15151 417 aa11.47□□□□□ -0.57
DDX39B-210ENST00000431908 PDHA2P29803 388 aa11.47□□□□□ -0.57
DDX39B-210ENST00000431908 PTPN7P35236 360 aa11.47□□□□□ -0.57
DDX39B-210ENST00000431908 ETF1P62495 437 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
DDX39B-210ENST00000431908 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
DDX39B-210ENST00000431908 CYP2A13Q16696 494 aa11.47□□□□□ -0.57
DDX39B-210ENST00000431908 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa11.47□□□□□ -0.57
DDX39B-210ENST00000431908 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa11.47□□□□□ -0.57
DDX39B-210ENST00000431908 LCN10Q6JVE6 187 aa11.47□□□□□ -0.57
DDX39B-210ENST00000431908 TLDC1Q6P9B6 456 aa11.47□□□□□ -0.57
DDX39B-210ENST00000431908 FAM198BQ6UWH4 519 aa11.47□□□□□ -0.57
DDX39B-210ENST00000431908 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa11.47□□□□□ -0.57
DDX39B-210ENST00000431908 TBC1D21Q8IYX1 336 aa11.47□□□□□ -0.57
DDX39B-210ENST00000431908 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa11.47□□□□□ -0.57
DDX39B-210ENST00000431908 TXLNBQ8N3L3 684 aa11.47□□□□□ -0.57
DDX39B-210ENST00000431908 ZADH2Q8N4Q0 377 aa11.47□□□□□ -0.57
DDX39B-210ENST00000431908 ZBTB2Q8N680 514 aa11.47□□□□□ -0.57
DDX39B-210ENST00000431908 CLDN19Q8N6F1 224 aa11.47□□□□□ -0.57
DDX39B-210ENST00000431908 UBL4BQ8N7F7 174 aa11.47□□□□□ -0.57
DDX39B-210ENST00000431908 TC2NQ8N9U0 490 aa11.47□□□□□ -0.57
DDX39B-210ENST00000431908 PROKR1Q8TCW9 393 aa11.47□□□□□ -0.57
DDX39B-210ENST00000431908 PTERQ96BW5 349 aa11.47□□□□□ -0.57
DDX39B-210ENST00000431908 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa11.47□□□□□ -0.57
DDX39B-210ENST00000431908 VPS50Q96JG6 964 aa11.47□□□□□ -0.57
DDX39B-210ENST00000431908 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
DDX39B-210ENST00000431908 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
DDX39B-210ENST00000431908 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
DDX39B-210ENST00000431908 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
DDX39B-210ENST00000431908 XKR8Q9H6D3 395 aa11.47□□□□□ -0.57
DDX39B-210ENST00000431908 L2HGDHQ9H9P8 463 aa11.47□□□□□ -0.57
DDX39B-210ENST00000431908 OR6C2Q9NZP2 312 aa11.47□□□□□ -0.57
DDX39B-210ENST00000431908 LUZP4Q9P127 313 aa11.47□□□□□ -0.57
DDX39B-210ENST00000431908 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
DDX39B-210ENST00000431908 LRRK2Q5S007 2527 aa11.46□□□□□ -0.57
DDX39B-210ENST00000431908 ICE1Q9Y2F5 2266 aa11.46□□□□□ -0.57
DDX39B-210ENST00000431908 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa11.46□□□□□ -0.57
DDX39B-210ENST00000431908 A0A0J9YY10 115 aa11.46□□□□□ -0.57
DDX39B-210ENST00000431908 TCP11X1B4DZS4 312 aa11.46□□□□□ -0.57
DDX39B-210ENST00000431908 CCL22O00626 93 aa11.46□□□□□ -0.57
DDX39B-210ENST00000431908 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
DDX39B-210ENST00000431908 SLU7O95391 586 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
DDX39B-210ENST00000431908 RPN2P04844 631 aa11.46□□□□□ -0.57
DDX39B-210ENST00000431908 UGT2B7P16662 529 aa11.46□□□□□ -0.57
DDX39B-210ENST00000431908 TPH1P17752 444 aa11.46□□□□□ -0.57
DDX39B-210ENST00000431908 RAPSNQ13702 412 aa11.46□□□□□ -0.57
DDX39B-210ENST00000431908 ITIH4Q14624 930 aa11.46□□□□□ -0.57
DDX39B-210ENST00000431908 POU6F1Q14863 301 aa11.46□□□□□ -0.57
DDX39B-210ENST00000431908 BRD3Q15059 726 aa11.46□□□□□ -0.57
DDX39B-210ENST00000431908 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
DDX39B-210ENST00000431908 SLC6A19Q695T7 634 aa11.46□□□□□ -0.57
DDX39B-210ENST00000431908 RHBDD2Q6NTF9 364 aa11.46□□□□□ -0.57
DDX39B-210ENST00000431908 UNC5AQ6ZN44 842 aa11.46□□□□□ -0.57
DDX39B-210ENST00000431908 REXO1L1PQ8IX06 675 aa11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.7 ms