RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427193.1

C9orf3-205, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 704 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-205ENST00000427193 TCF4P15884 667 aa5.54□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 PRLRP16471 622 aa5.54□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 YWHAQP27348 245 aa5.54□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 CCR2P41597 374 aa5.54□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 SLC1A1P43005 524 aa5.54□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 PPP3CCP48454 512 aa5.54□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 CXCR3P49682 368 aa5.54□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 ARSEP51690 589 aa5.54□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 HDAC4P56524 1084 aa5.54□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 SLC8A3P57103 927 aa5.54□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 TAF10Q12962 218 aa5.54□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 MTAPQ13126 283 aa5.54□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 SEMA3BQ13214 749 aa5.54□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 CNGA3Q16281 694 aa5.54□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 SLC25A52Q3SY17 297 aa5.54□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa5.54□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 RAB6CQ53S08 254 aa5.54□□□□□ -1.52
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C9orf3-205ENST00000427193 LIN9Q5TKA1 542 aa5.54□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 SDHAF4Q5VUM1 108 aa5.54□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 BSPRYQ5W0U4 402 aa5.54□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 IL31Q6EBC2 164 aa5.54□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 DNAJC24Q6P3W2 148 aa5.54□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 CCDC149Q6ZUS6 474 aa5.54□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 STRADAQ7RTN6 431 aa5.54□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 DEFB106AQ8N104 65 aa5.54□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 TXLNBQ8N3L3 684 aa5.54□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 EMC1Q8N766 993 aa5.54□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 TRIM58Q8NG06 486 aa5.54□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 RXFP2Q8WXD0 754 aa5.54□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 MCEEQ96PE7 176 aa5.54□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 MED10Q9BTT4 135 aa5.54□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 RAB6CQ9H0N0 254 aa5.54□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 SAP30LQ9HAJ7 183 aa5.54□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 POPDC2Q9HBU9 364 aa5.54□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 LRRC4Q9HBW1 653 aa5.54□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 LZTFL1Q9NQ48 299 aa5.54□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa5.54□□□□□ -1.52
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C9orf3-205ENST00000427193 RXFP3Q9NSD7 469 aa5.54□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 TMEM51Q9NW97 253 aa5.54□□□□□ -1.52
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C9orf3-205ENST00000427193 RRN3Q9NYV6 651 aa5.54□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 NEU3Q9UQ49 428 aa5.54□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 SPAG17Q6Q759 2223 aa5.54□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 SDK1Q7Z5N4 2213 aa5.54□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa5.53□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 CFAP46Q8IYW2 2715 aa5.53□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 MACROD2A1Z1Q3 448 aa5.53□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 C16orf96A6NNT2 1141 aa5.53□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 ZNF487B1APH4 448 aa5.53□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 ZNF814B7Z6K7 855 aa5.53□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 BUB1O43683 1085 aa5.53□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 RFPL2O75678 378 aa5.53□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 PALMO75781 387 aa5.53□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 EPN2O95208 641 aa5.53□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 MOCS3O95396 460 aa5.53□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 MT-ND5P03915 603 aa5.53□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 HRGP04196 525 aa5.53□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 PDGFRAP16234 1089 aa5.53□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 IL4RP24394 825 aa5.53□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 CTNNA2P26232 953 aa5.53□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 KLRC2P26717 231 aa5.53□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 DUSP1P28562 367 aa5.53□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 ARPP19P56211 112 aa5.53□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 STARD6P59095 220 aa5.53□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 TAS2R40P59535 323 aa5.53□□□□□ -1.52
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C9orf3-205ENST00000427193 ZXDBP98169 803 aa5.53□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 TWF1Q12792 350 aa5.53□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 MTA1Q13330 715 aa5.53□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 PLD1Q13393 1074 aa5.53□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 ACOX1Q15067 660 aa5.53□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 PRTGQ2VWP7 1150 aa5.53□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 NXNQ6DKJ4 435 aa5.53□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa5.53□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 OR6B2Q6IFH4 312 aa5.53□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 RFX8Q6ZV50 586 aa5.53□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa5.53□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa5.53□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 KIAA1328Q86T90 577 aa5.53□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 VSIG1Q86XK7 387 aa5.53□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 SCN4BQ8IWT1 228 aa5.53□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 UEVLDQ8IX04 471 aa5.53□□□□□ -1.52
C9orf3-205ENST00000427193 ZNF683Q8IZ20 524 aa5.53□□□□□ -1.52
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