RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423327.2

SPC24-201, Transcript of SPC24, NDC80 kinetochore complex component, humanhuman

TSL 2

Gene SPC24, Length 840 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24-201ENST00000423327 TTC1Q99614 292 aa14.98□□□□□ -0.01
SPC24-201ENST00000423327 SNX12Q9UMY4 172 aa14.98□□□□□ -0.01
SPC24-201ENST00000423327 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
SPC24-201ENST00000423327 KRT87PA6NCN2 255 aa14.97□□□□□ -0.01
SPC24-201ENST00000423327 C2orf74A8MZ97 194 aa14.97□□□□□ -0.01
SPC24-201ENST00000423327 AP3B1O00203 1094 aa14.97□□□□□ -0.01
SPC24-201ENST00000423327 PHF2O75151 1096 aa14.97□□□□□ -0.01
SPC24-201ENST00000423327 SLCO2B1O94956 709 aa14.97□□□□□ -0.01
SPC24-201ENST00000423327 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
SPC24-201ENST00000423327 PLA2G2AP14555 144 aa14.97□□□□□ -0.01
SPC24-201ENST00000423327 PKLRP30613 574 aa14.97□□□□□ -0.01
SPC24-201ENST00000423327 MAGEA3P43357 314 aa14.97□□□□□ -0.01
SPC24-201ENST00000423327 GABRA4P48169 554 aa14.97□□□□□ -0.01
SPC24-201ENST00000423327 TTPAP49638 278 aa14.97□□□□□ -0.01
SPC24-201ENST00000423327 ARL4DP49703 201 aa14.97□□□□□ -0.01
SPC24-201ENST00000423327 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
SPC24-201ENST00000423327 GPS2Q13227 327 aa14.97□□□□□ -0.01
SPC24-201ENST00000423327 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
SPC24-201ENST00000423327 LCN10Q6JVE6 187 aa14.97□□□□□ -0.01
SPC24-201ENST00000423327 CYB5D1Q6P9G0 228 aa14.97□□□□□ -0.01
SPC24-201ENST00000423327 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
SPC24-201ENST00000423327 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
SPC24-201ENST00000423327 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa14.97□□□□□ -0.01
SPC24-201ENST00000423327 LINC01555Q8NAE3 123 aa14.97□□□□□ -0.01
SPC24-201ENST00000423327 LPGAT1Q92604 370 aa14.97□□□□□ -0.01
SPC24-201ENST00000423327 SERPINB12Q96P63 405 aa14.97□□□□□ -0.01
SPC24-201ENST00000423327 EFHD1Q9BUP0 239 aa14.97□□□□□ -0.01
SPC24-201ENST00000423327 FAM60AQ9NP50 221 aa14.97□□□□□ -0.01
SPC24-201ENST00000423327 LATS2Q9NRM7 1088 aa14.97□□□□□ -0.01
SPC24-201ENST00000423327 KCND1Q9NSA2 647 aa14.97□□□□□ -0.01
SPC24-201ENST00000423327 CIDEBQ9UHD4 219 aa14.97□□□□□ -0.01
SPC24-201ENST00000423327 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
SPC24-201ENST00000423327 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa14.97□□□□□ -0.01
SPC24-201ENST00000423327 PIPSLA2A3N6 862 aa14.96□□□□□ -0.01
SPC24-201ENST00000423327 TMEM150CB9EJG8 249 aa14.96□□□□□ -0.01
SPC24-201ENST00000423327 H3BMH7 237 aa14.96□□□□□ -0.01
SPC24-201ENST00000423327 GOLGA8MH3BSY2 632 aa14.96□□□□□ -0.01
SPC24-201ENST00000423327 FANCGO15287 622 aa14.96□□□□□ -0.01
SPC24-201ENST00000423327 SCRG1O75711 98 aa14.96□□□□□ -0.01
SPC24-201ENST00000423327 CTSBP07858 339 aa14.96□□□□□ -0.01
SPC24-201ENST00000423327 MSL3P1P0C860 447 aa14.96□□□□□ -0.01
SPC24-201ENST00000423327 SHMT2P34897 504 aa14.96□□□□□ -0.01
SPC24-201ENST00000423327 POLE2P56282 527 aa14.96□□□□□ -0.01
SPC24-201ENST00000423327 DNASE1L3Q13609 305 aa14.96□□□□□ -0.01
SPC24-201ENST00000423327 GBX1Q14549 363 aa14.96□□□□□ -0.01
SPC24-201ENST00000423327 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
SPC24-201ENST00000423327 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
SPC24-201ENST00000423327 C16orf46Q6P387 395 aa14.96□□□□□ -0.01
SPC24-201ENST00000423327 BORAQ6PGQ7 559 aa14.96□□□□□ -0.01
SPC24-201ENST00000423327 CENPUQ71F23 418 aa14.96□□□□□ -0.01
SPC24-201ENST00000423327 TMEM135Q86UB9 458 aa14.96□□□□□ -0.01
SPC24-201ENST00000423327 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
SPC24-201ENST00000423327 FAM20CQ8IXL6 584 aa14.96□□□□□ -0.01
SPC24-201ENST00000423327 NAT8LQ8N9F0 302 aa14.96□□□□□ -0.01
SPC24-201ENST00000423327 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
SPC24-201ENST00000423327 MCUQ8NE86 351 aa14.96□□□□□ -0.01
SPC24-201ENST00000423327 IL17FQ96PD4 163 aa14.96□□□□□ -0.01
SPC24-201ENST00000423327 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa14.96□□□□□ -0.01
SPC24-201ENST00000423327 STARD5Q9NSY2 213 aa14.96□□□□□ -0.01
SPC24-201ENST00000423327 GALPQ9UBC7 116 aa14.96□□□□□ -0.01
SPC24-201ENST00000423327 POLG2Q9UHN1 485 aa14.96□□□□□ -0.01
SPC24-201ENST00000423327 GNPTGQ9UJJ9 305 aa14.96□□□□□ -0.01
SPC24-201ENST00000423327 ANAPC5Q9UJX4 755 aa14.96□□□□□ -0.01
SPC24-201ENST00000423327 PADI1Q9ULC6 663 aa14.96□□□□□ -0.01
SPC24-201ENST00000423327 NFS1Q9Y697 457 aa14.96□□□□□ -0.01
SPC24-201ENST00000423327 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa14.95□□□□□ -0.02
SPC24-201ENST00000423327 CES2O00748 559 aa14.95□□□□□ -0.02
SPC24-201ENST00000423327 ZSCAN12O43309 604 aa14.95□□□□□ -0.02
SPC24-201ENST00000423327 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
SPC24-201ENST00000423327 NIPSNAP2O75323 286 aa14.95□□□□□ -0.02
SPC24-201ENST00000423327 MLNP12872 115 aa14.95□□□□□ -0.02
SPC24-201ENST00000423327 TCN2P20062 427 aa14.95□□□□□ -0.02
SPC24-201ENST00000423327 RORAP35398 523 aa14.95□□□□□ -0.02
SPC24-201ENST00000423327 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
SPC24-201ENST00000423327 FNTAP49354 379 aa14.95□□□□□ -0.02
SPC24-201ENST00000423327 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
SPC24-201ENST00000423327 RPS18P62269 152 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
SPC24-201ENST00000423327 NFKB2Q00653 900 aa14.95□□□□□ -0.02
SPC24-201ENST00000423327 NFATC3Q12968 1075 aa14.95□□□□□ -0.02
SPC24-201ENST00000423327 KYNUQ16719 465 aa14.95□□□□□ -0.02
SPC24-201ENST00000423327 DEFB110Q30KQ9 67 aa14.95□□□□□ -0.02
SPC24-201ENST00000423327 CCSMST1Q4G0I0 132 aa14.95□□□□□ -0.02
SPC24-201ENST00000423327 TMTC4Q5T4D3 741 aa14.95□□□□□ -0.02
SPC24-201ENST00000423327 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
SPC24-201ENST00000423327 TMEM126BQ8IUX1 230 aa14.95□□□□□ -0.02
SPC24-201ENST00000423327 OR8K5Q8NH50 307 aa14.95□□□□□ -0.02
SPC24-201ENST00000423327 ASZ1Q8WWH4 475 aa14.95□□□□□ -0.02
SPC24-201ENST00000423327 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
SPC24-201ENST00000423327 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
SPC24-201ENST00000423327 OR6C2Q9NZP2 312 aa14.95□□□□□ -0.02
SPC24-201ENST00000423327 PYCARDQ9ULZ3 195 aa14.95□□□□□ -0.02
SPC24-201ENST00000423327 PCSK5Q92824 1860 aa14.95□□□□□ -0.02
SPC24-201ENST00000423327 A0A0J9YY10 115 aa14.94□□□□□ -0.02
SPC24-201ENST00000423327 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa14.94□□□□□ -0.02
SPC24-201ENST00000423327 B8ZZF3 427 aa14.94□□□□□ -0.02
SPC24-201ENST00000423327 NDUFS3O75489 264 aa14.94□□□□□ -0.02
SPC24-201ENST00000423327 MT-ND3P03897 115 aa14.94□□□□□ -0.02
SPC24-201ENST00000423327 APOA4P06727 396 aa14.94□□□□□ -0.02
SPC24-201ENST00000423327 OGNP20774 298 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
SPC24-201ENST00000423327 BDKRB1P46663 353 aa14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.4 ms