RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415409.5

HDAC8-211, Transcript of histone deacetylase 8, humanhuman

TSL 5

Gene HDAC8, Length 913 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8-211ENST00000415409 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 FZD4Q9ULV1 537 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 CHD5Q8TDI0 1954 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 OBSL1O75147 1896 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 BPTFQ12830 3046 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 TBC1D3EA0A087X179 549 aa6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 A0A1W2PQF6 199 aa6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 SLC5A10A0PJK1 596 aa6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 KLHL33A6NCF5 533 aa6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 MGAT4DA6NG13 374 aa6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 B2RBV5 119 aa6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 GPR89AB7ZAQ6 455 aa6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 SHISA8B8ZZ34 492 aa6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 TBC1D3LB9A6J9 549 aa6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 GFYI3L273 518 aa6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 K7ESM1 405 aa6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 E2F3O00716 465 aa6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 PIP5K1BO14986 540 aa6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 UBDO15205 165 aa6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 TAPBPO15533 448 aa6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 ADAM23O75077 832 aa6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 POP7O75817 140 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 SOD1P00441 154 aa6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 CATP04040 527 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 THBS1P07996 1170 aa6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 TBC1D3HP0C7X1 549 aa6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 GPR89BP0CG08 455 aa6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 THRAP10827 490 aa6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 SRFP11831 508 aa6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 EPB42P16452 691 aa6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 PIK3R1P27986 724 aa6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 HMOX2P30519 316 aa6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 HSPA7P48741 367 aa6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 CCNG1P51959 295 aa6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 TAS2R38P59533 333 aa6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 STX1BP61266 288 aa6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 ABRQ12979 859 aa6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 KLF10Q13118 480 aa6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 TDGQ13569 410 aa6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 SQLEQ14534 574 aa6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 HERC3Q15034 1050 aa6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 MAPRE2Q15555 327 aa6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 WSCD2Q2TBF2 565 aa6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 MAP7D1Q3KQU3 841 aa6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 UGT3A2Q3SY77 523 aa6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 DNAL1Q4LDG9 190 aa6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 FBXO48Q5FWF7 155 aa6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 NEK5Q6P3R8 708 aa6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 USP30Q70CQ3 517 aa6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 MILR1Q7Z6M3 343 aa6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 TRIM74Q86UV6 250 aa6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 LONP2Q86WA8 852 aa6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 HEATR4Q86WZ0 1026 aa6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 HORMAD1Q86X24 394 aa6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 TREML1Q86YW5 311 aa6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 VRK3Q8IV63 474 aa6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 DDIASQ8IXT1 998 aa6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 C10orf67Q8IYJ2 551 aa6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 CFAP206Q8IYR0 622 aa6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 SLC22A15Q8IZD6 547 aa6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 CFAP61Q8NHU2 1237 aa6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 METTL6Q8TCB7 284 aa6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 HM13Q8TCT9 377 aa6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 TWIST2Q8WVJ9 160 aa6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 DLG3Q92796 817 aa6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 ESAMQ96AP7 390 aa6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 MCUR1Q96AQ8 359 aa6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 ABHD17AQ96GS6 310 aa6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 COX14Q96I36 57 aa6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 CCDC138Q96M89 665 aa6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 WDR26Q9H7D7 661 aa6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 IPPKQ9H8X2 491 aa6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 SLC40A1Q9NP59 571 aa6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 THEGQ9P2T0 379 aa6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 ATXN10Q9UBB4 475 aa6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 FAM8A1Q9UBU6 413 aa6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 SERGEFQ9UGK8 458 aa6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
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