RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415172.1

VPS13A-AS1-201, VPS13A antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS13A-AS1, Length 519 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ETV5P41161 510 aa16.86■□□□□ 0.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TSPAN7P41732 249 aa16.86■□□□□ 0.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SEPHS1P49903 392 aa16.86■□□□□ 0.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CLCN7P51798 805 aa16.86■□□□□ 0.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RAB15P59190 212 aa16.86■□□□□ 0.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GBX1Q14549 363 aa16.86■□□□□ 0.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TRADDQ15628 312 aa16.86■□□□□ 0.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 UGT3A1Q6NUS8 523 aa16.86■□□□□ 0.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CAPN12Q6ZSI9 719 aa16.86■□□□□ 0.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CARFQ8N187 725 aa16.86■□□□□ 0.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SEC14L1Q92503 715 aa16.86■□□□□ 0.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NDNQ99608 321 aa16.86■□□□□ 0.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 XKR8Q9H6D3 395 aa16.86■□□□□ 0.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FAM114A2Q9NRY5 505 aa16.86■□□□□ 0.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OCIAD1Q9NX40 245 aa16.86■□□□□ 0.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLC39A1Q9NY26 324 aa16.86■□□□□ 0.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLC17A6Q9P2U8 582 aa16.86■□□□□ 0.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ICKQ9UPZ9 632 aa16.86■□□□□ 0.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 IGSF10Q6WRI0 2623 aa16.86■□□□□ 0.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa16.86■□□□□ 0.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 C2orf74A8MZ97 194 aa16.85■□□□□ 0.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 BTN3A3O00478 584 aa16.85■□□□□ 0.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 BTN3A1O00481 513 aa16.85■□□□□ 0.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RRP8O43159 456 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 AHSGP02765 367 aa16.85■□□□□ 0.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLC5A2P31639 672 aa16.85■□□□□ 0.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ARL4DP49703 201 aa16.85■□□□□ 0.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 BMPERQ8N8U9 685 aa16.85■□□□□ 0.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF248Q8NDW4 579 aa16.85■□□□□ 0.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 USP7Q93009 1102 aa16.85■□□□□ 0.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DCBLD2Q96PD2 775 aa16.85■□□□□ 0.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TAAR9Q96RI9 348 aa16.85■□□□□ 0.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GPR21Q99679 349 aa16.85■□□□□ 0.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MAP3K3Q99759 626 aa16.85■□□□□ 0.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DDA1Q9BW61 102 aa16.85■□□□□ 0.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FAM129AQ9BZQ8 928 aa16.85■□□□□ 0.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 B3GNT4Q9C0J1 378 aa16.85■□□□□ 0.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa16.85■□□□□ 0.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TAS2R13Q9NYV9 303 aa16.85■□□□□ 0.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MOCS1Q9NZB8 636 aa16.85■□□□□ 0.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OR6C2Q9NZP2 312 aa16.85■□□□□ 0.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GALPQ9UBC7 116 aa16.85■□□□□ 0.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 POMT2Q9UKY4 750 aa16.85■□□□□ 0.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MED16Q9Y2X0 877 aa16.85■□□□□ 0.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DHRS7Q9Y394 339 aa16.85■□□□□ 0.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KNTC1P50748 2209 aa16.84■□□□□ 0.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PIPSLA2A3N6 862 aa16.84■□□□□ 0.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PRAMEF10O60809 474 aa16.84■□□□□ 0.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GSTA2P09210 222 aa16.84■□□□□ 0.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GABRB3P28472 473 aa16.84■□□□□ 0.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SSTR1P30872 391 aa16.84■□□□□ 0.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CCNFP41002 786 aa16.84■□□□□ 0.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RAB28P51157 221 aa16.84■□□□□ 0.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CUL1Q13616 776 aa16.84■□□□□ 0.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KLHL38Q2WGJ6 581 aa16.84■□□□□ 0.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ACSBG2Q5FVE4 666 aa16.84■□□□□ 0.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DCAF12Q5T6F0 453 aa16.84■□□□□ 0.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CYB5D1Q6P9G0 228 aa16.84■□□□□ 0.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NEK10Q6ZWH5 1172 aa16.84■□□□□ 0.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLC26A11Q86WA9 606 aa16.84■□□□□ 0.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KMT5CQ86Y97 462 aa16.84■□□□□ 0.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RAB42Q8N4Z0 105 aa16.84■□□□□ 0.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GIMAP7Q8NHV1 300 aa16.84■□□□□ 0.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CD200R1Q8TD46 325 aa16.84■□□□□ 0.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MAGEC3Q8TD91 643 aa16.84■□□□□ 0.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KLHL6Q8WZ60 621 aa16.84■□□□□ 0.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CDKL2Q92772 493 aa16.84■□□□□ 0.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 INPP5DQ92835 1189 aa16.84■□□□□ 0.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RAD51AP1Q96B01 352 aa16.84■□□□□ 0.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLC30A3Q99726 388 aa16.84■□□□□ 0.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa16.84■□□□□ 0.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa16.84■□□□□ 0.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ACTR10Q9NZ32 417 aa16.84■□□□□ 0.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SEMA5BQ9P283 1151 aa16.84■□□□□ 0.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PLAGL1Q9UM63 463 aa16.84■□□□□ 0.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa16.84■□□□□ 0.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa16.84■□□□□ 0.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NFS1Q9Y697 457 aa16.84■□□□□ 0.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa16.83■□□□□ 0.28
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 C9orf172C9J069 976 aa16.83■□□□□ 0.28
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MATN4O95460 622 aa16.83■□□□□ 0.28
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 C1orf105O95561 183 aa16.83■□□□□ 0.28
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CBSLP0DN79 551 aa16.83■□□□□ 0.28
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NELFEP18615 380 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CDH3P22223 829 aa16.83■□□□□ 0.28
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CD82P27701 267 aa16.83■□□□□ 0.28
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PKLRP30613 574 aa16.83■□□□□ 0.28
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CBSP35520 551 aa16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms