RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409189.7

CCL20-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 839 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-202ENST00000409189 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 TRIM8Q9BZR9 551 aa6.51□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 TRIM4Q9C037 500 aa6.51□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 FAM107BQ9H098 131 aa6.51□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 ARNT2Q9HBZ2 717 aa6.51□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 TRPC7Q9HCX4 862 aa6.51□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 GGA2Q9UJY4 613 aa6.51□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa6.51□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa6.51□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 CPQQ9Y646 472 aa6.51□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 FAM169AQ9Y6X4 670 aa6.51□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 LRBAP50851 2863 aa6.51□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 NBASA2RRP1 2371 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 CHD5Q8TDI0 1954 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 HEATR9A2RTY3 570 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 ERICH4A6NGS2 130 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 TRIM49D1C9J1S8 452 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 TIMM44O43615 452 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 SLC28A2O43868 658 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 CBFA2T3O75081 653 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 GLRA3O75311 464 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 RFPL3O75679 317 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 GJB3O75712 270 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 APBB3O95704 486 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 EPOP01588 193 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 MT-ND3P03897 115 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 IRF1P10914 325 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 HADHAP40939 763 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 MAGEA12P43365 314 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 MEOX1P50221 254 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 SERPINB8P50452 374 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 NEK3P51956 506 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 DGKEP52429 567 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 LIMK2P53671 638 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 WNT3AP56704 352 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP6.5□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 SLC10A7Q0GE19 358 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 CDH18Q13634 790 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 LY6DQ14210 128 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 DMC1Q14565 340 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 ITIH4Q14624 930 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 PDK4Q16654 411 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 MPP7Q5T2T1 576 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 GRTP1Q5TC63 336 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 PACS1Q6VY07 963 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 GALNT7Q86SF2 657 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 LCA5Q86VQ0 697 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 KCNMB4Q86W47 210 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 ZNF354CQ86Y25 554 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 LMNTD2Q8IXW0 634 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 C4orf33Q8N1A6 199 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 HDDC3Q8N4P3 179 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 MINDY1Q8N5J2 469 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 ANKRD42Q8N9B4 389 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 BANPQ8N9N5 519 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 DENND1AQ8TEH3 1009 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 RLN3Q8WXF3 142 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 ATP2A3Q93084 1043 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 CABS1Q96KC9 395 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 RBBP8Q99708 897 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 KIF9Q9HAQ2 790 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 NT5MQ9NPB1 228 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 KCNK9Q9NPC2 374 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 SMYD2Q9NRG4 433 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 RIMKLBQ9ULI2 386 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 ZFHX3Q15911 3703 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 CEP192Q8TEP8 1941 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa6.49□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 J3KR12 359 aa6.49□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 EBAG9O00559 213 aa6.49□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 COPEO14579 308 aa6.49□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 KDELR3O43731 214 aa6.49□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 USP12O75317 370 aa6.49□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 IL1BP01584 269 aa6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms