RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399409.7

RABGGTA-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTA, Length 2,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-202ENST00000399409 OR52E6Q96RD3 313 aa22.58■■□□□ 1.21
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RABGGTA-202ENST00000399409 RPIAP49247 311 aa22.57■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 GGTA1PQ4G0N0 100 aa22.57■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa22.57■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa22.57■■□□□ 1.2
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RABGGTA-202ENST00000399409 TUBA1CQ9BQE3 449 aa22.57■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 ACTR8Q9H981 624 aa22.57■■□□□ 1.2
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RABGGTA-202ENST00000399409 BCKDHAP12694 445 aa22.57■■□□□ 1.2
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RABGGTA-202ENST00000399409 ARHGEF6Q15052 776 aa22.57■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 SUSD1Q6UWL2 747 aa22.57■■□□□ 1.2
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RABGGTA-202ENST00000399409 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa22.57■■□□□ 1.2
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RABGGTA-202ENST00000399409 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa22.56■■□□□ 1.2
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RABGGTA-202ENST00000399409 H0Y858 1186 aa22.56■■□□□ 1.2
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RABGGTA-202ENST00000399409 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
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RABGGTA-202ENST00000399409 FAM162AQ96A26 154 aa22.56■■□□□ 1.2
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RABGGTA-202ENST00000399409 SUV39H2Q9H5I1 410 aa22.56■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 MAGIXQ9H6Y5 334 aa22.56■■□□□ 1.2
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RABGGTA-202ENST00000399409 PRPH2P23942 346 aa22.55■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 MAPK1P28482 360 aa22.55■■□□□ 1.2
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RABGGTA-202ENST00000399409 TTC23Q5W5X9 447 aa22.55■■□□□ 1.2
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RABGGTA-202ENST00000399409 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP22.55■■□□□ 1.2
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RABGGTA-202ENST00000399409 PCNAP12004 261 aa22.55■■□□□ 1.2
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RABGGTA-202ENST00000399409 HNMTP50135 292 aa22.55■■□□□ 1.2
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