RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370826.3

RABGGTB-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGGTB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-202ENST00000370826 PIGNO95427 931 aa3.53□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 CD48P09326 243 aa3.53□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 HOXC8P31273 242 aa3.53□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 GLIPR1P48060 266 aa3.53□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF75DP51815 510 aa3.53□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 RASA2Q15283 850 aa3.53□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF628Q5EBL2 1059 aa3.53□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC30A6Q6NXT4 461 aa3.53□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF449Q6P9G9 518 aa3.53□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 MFSD6Q6ZSS7 791 aa3.53□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 TMPRSS11BQ86T26 416 aa3.53□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 CFAP206Q8IYR0 622 aa3.53□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF843Q8N446 348 aa3.53□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa3.53□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 CNBD1Q8NA66 436 aa3.53□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 NPEPL1Q8NDH3 523 aa3.53□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 FBXO17Q96EF6 278 aa3.53□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 ARSGQ96EG1 525 aa3.53□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 SFXN2Q96NB2 322 aa3.53□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 SERINC2Q96SA4 455 aa3.53□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 Q9N2K0 584 aa3.53□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC52A3Q9NQ40 469 aa3.53□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 SERINC1Q9NRX5 453 aa3.53□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 WDR35Q9P2L0 1181 aa3.53□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC24A2Q9UI40 661 aa3.53□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 GAB2Q9UQC2 676 aa3.53□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa3.52□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 A0A0G2JLW4 131 aa3.52□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa3.52□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 DNM1LO00429 736 aa3.52□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 CLIC2O15247 247 aa3.52□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 KRT86O43790 486 aa3.52□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 PATE4P0C8F1 98 aa3.52□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 PRSS56P0CW18 603 aa3.52□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 SMIM18P0DKX4 95 aa3.52□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 MC5RP33032 325 aa3.52□□□□□ -1.85
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RABGGTB-202ENST00000370826 B3GALT5-AS1P59052 145 aa3.52□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 KRT81Q14533 505 aa3.52□□□□□ -1.85
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RABGGTB-202ENST00000370826 KIAA1644Q3SXP7 199 aa3.52□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 PHLDA2Q53GA4 152 aa3.52□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 SYT14P1Q58G82 188 aa3.52□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 GFI1BQ5VTD9 330 aa3.52□□□□□ -1.85
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RABGGTB-202ENST00000370826 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
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RABGGTB-202ENST00000370826 SSMEM1Q8WWF3 244 aa3.52□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 ATL1Q8WXF7 558 aa3.52□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 NR4A3Q92570 626 aa3.52□□□□□ -1.85
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RABGGTB-202ENST00000370826 DHX58Q96C10 678 aa3.52□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 DUX3Q96PT4 197 aa3.52□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 SEPHS2Q99611 448 aa3.52□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 LAT2Q9GZY6 243 aa3.52□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 S1PR5Q9H228 398 aa3.52□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 SIX2Q9NPC8 291 aa3.52□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP3.52□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 STK26Q9P289 416 aa3.52□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa3.52□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 KCNJ14Q9UNX9 436 aa3.52□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 C2CD2Q9Y426 696 aa3.52□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 WDR81Q562E7 1941 aa3.52□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa3.51□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 A0A1W2PN81 502 aa3.51□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 A0A1W2PPQ1 181 aa3.51□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 TRIM77I1YAP6 450 aa3.51□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 ATP6V0E1O15342 81 aa3.51□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 SOCS5O75159 536 aa3.51□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 NGFP01138 241 aa3.51□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 IGHV2-70P01814 119 aa3.51□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 MYBL1P10243 752 aa3.51□□□□□ -1.85
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RABGGTB-202ENST00000370826 CA4P22748 312 aa3.51□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 CPT2P23786 658 aa3.51□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 MPZP25189 248 aa3.51□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 ITGA3P26006 1051 aa3.51□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 PTPN3P26045 913 aa3.51□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 CHRNB4P30926 498 aa3.51□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 CHRNA7P36544 502 aa3.51□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
RABGGTB-202ENST00000370826 PDX1P52945 283 aa3.51□□□□□ -1.85
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