RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332029.2

SOCS1-201, Transcript of suppressor of cytokine signaling 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SOCS1, Length 1,225 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS1-201ENST00000332029 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 MAP3K7O43318 606 aa20.43■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 DPM1O60762 260 aa20.43■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 IFNB1P01574 187 aa20.43■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 CAPN1P07384 714 aa20.43■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 ST6GAL1P15907 406 aa20.43■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 FOXN2P32314 431 aa20.43■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 LMAN1P49257 510 aa20.43■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 ITGA1P56199 1179 aa20.43■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 PRKG2Q13237 762 aa20.43■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 PACS1Q6VY07 963 aa20.43■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa20.43■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 AMIGO1Q86WK6 493 aa20.43■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 LURAP1LQ8IV03 231 aa20.43■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 FDCSPQ8NFU4 85 aa20.43■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 C1orf54Q8WWF1 131 aa20.43■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 HGH1Q9BTY7 390 aa20.43■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 PITPNM3Q9BZ71 974 aa20.43■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa20.43■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 GUCA1BQ9UMX6 200 aa20.43■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 HEATR9A2RTY3 570 aa20.42■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 E7EVH7 732 aa20.42■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 ZNF185O15231 689 aa20.42■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 KRT86O43790 486 aa20.42■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 SUN1O94901 812 aa20.42■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 PTCHD3Q3KNS1 767 aa20.42■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 ZBTB2Q8N680 514 aa20.42■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 OR13J1Q8NGT2 312 aa20.42■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 HDAC10Q969S8 669 aa20.42■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP20.42■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 NUDT9Q9BW91 350 aa20.42■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 SERTAD3Q9UJW9 196 aa20.42■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 SPTBP11277 2137 aa20.42■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 C2orf74A8MZ97 194 aa20.41■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 E7EQ34 232 aa20.41■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 FTH1P02794 183 aa20.41■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 ETS1P14921 441 aa20.41■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 GRIA1P42261 906 aa20.41■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 SNX1Q13596 522 aa20.41■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 NCF4Q15080 339 aa20.41■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa20.41■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa20.41■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 MED25Q71SY5 747 aa20.41■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 HPS6Q86YV9 775 aa20.41■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa20.41■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 SSC4DQ8WTU2 575 aa20.41■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 ELMO1Q92556 727 aa20.41■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa20.41■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 RANBP9Q96S59 729 aa20.41■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 MFRPQ9BY79 579 aa20.41■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 KLHL25Q9H0H3 589 aa20.41■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 XKR8Q9H6D3 395 aa20.41■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 RAB6BQ9NRW1 208 aa20.41■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 ACTR10Q9NZ32 417 aa20.41■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 LUZP4Q9P127 313 aa20.41■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa20.41■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 RIMKLBQ9ULI2 386 aa20.41■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 A6NL46 340 aa20.4■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 C9J4A7 227 aa20.4■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 OR56A5P0C7T3 313 aa20.4■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 PVRP15151 417 aa20.4■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 ADRA1DP25100 572 aa20.4■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 ACADLP28330 430 aa20.4■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 RRADP55042 308 aa20.4■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 ATP1A4Q13733 1029 aa20.4■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 BRD3Q15059 726 aa20.4■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 RPS6KA1Q15418 735 aa20.4■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 TSTD2Q5T7W7 516 aa20.4■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 AFTPHQ6ULP2 937 aa20.4■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 PRUNE1Q86TP1 453 aa20.4■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 CCDC89Q8N998 374 aa20.4■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 Q8NA96 180 aa20.4■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 GLIS1Q8NBF1 620 aa20.4■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 OR5AR1Q8NGP9 310 aa20.4■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 TTC1Q99614 292 aa20.4■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 SLAMF7Q9NQ25 335 aa20.4■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 CASS4Q9NQ75 786 aa20.4■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 GPR83Q9NYM4 423 aa20.4■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 MED13Q9UHV7 2174 aa20.4■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 ICKQ9UPZ9 632 aa20.4■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 ASF1AQ9Y294 204 aa20.4■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 ICE1Q9Y2F5 2266 aa20.4■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 NOTCH2Q04721 2471 aa20.39■□□□□ 0.86
SOCS1-201ENST00000332029 ZNF749O43361 778 aa20.39■□□□□ 0.85
SOCS1-201ENST00000332029 OR1I1O60431 355 aa20.39■□□□□ 0.85
SOCS1-201ENST00000332029 SEMA7AO75326 666 aa20.39■□□□□ 0.85
SOCS1-201ENST00000332029 GOT2P00505 430 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
SOCS1-201ENST00000332029 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
SOCS1-201ENST00000332029 SLC6A19Q695T7 634 aa20.39■□□□□ 0.85
SOCS1-201ENST00000332029 NAPRTQ6XQN6 538 aa20.39■□□□□ 0.85
SOCS1-201ENST00000332029 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa20.39■□□□□ 0.85
SOCS1-201ENST00000332029 RAB43Q86YS6 212 aa20.39■□□□□ 0.85
SOCS1-201ENST00000332029 TBC1D21Q8IYX1 336 aa20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms