RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000307180.4

TSNARE1-201, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,907 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-201ENST00000307180 SEMA4FO95754 770 aa15.52■□□□□ 0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 IGLV3-19P01714 112 aa15.52■□□□□ 0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 CLCN7P51798 805 aa15.52■□□□□ 0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 HK3P52790 923 aa15.52■□□□□ 0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 ADPRHP54922 357 aa15.52■□□□□ 0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa15.52■□□□□ 0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 ZFP1Q6P2D0 407 aa15.52■□□□□ 0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 SLC36A4Q6YBV0 504 aa15.52■□□□□ 0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 ZSWIM9Q86XI8 627 aa15.52■□□□□ 0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 PDSS2Q86YH6 399 aa15.52■□□□□ 0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa15.52■□□□□ 0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 OR9I1Q8NGQ6 314 aa15.52■□□□□ 0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 DTNBP1Q96EV8 351 aa15.52■□□□□ 0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa15.52■□□□□ 0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 TSC22D3Q99576 134 aa15.52■□□□□ 0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 YIPF3Q9GZM5 350 aa15.52■□□□□ 0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa15.52■□□□□ 0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 GIMAP2Q9UG22 337 aa15.52■□□□□ 0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 PCTPQ9UKL6 214 aa15.52■□□□□ 0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 FZD4Q9ULV1 537 aa15.52■□□□□ 0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa15.52■□□□□ 0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 THADAQ6YHU6 1953 aa15.51■□□□□ 0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa15.51■□□□□ 0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa15.51■□□□□ 0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 TBC1D3EA0A087X179 549 aa15.51■□□□□ 0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa15.51■□□□□ 0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 TBC1D3LB9A6J9 549 aa15.51■□□□□ 0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 SNX2O60749 519 aa15.51■□□□□ 0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 VPS4BO75351 444 aa15.51■□□□□ 0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 MLYCDO95822 493 aa15.51■□□□□ 0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 TBC1D3HP0C7X1 549 aa15.51■□□□□ 0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 ADRB3P13945 408 aa15.51■□□□□ 0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 LBPP18428 481 aa15.51■□□□□ 0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 MAPK8P45983 427 aa15.51■□□□□ 0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 SEMG2Q02383 582 aa15.51■□□□□ 0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 NHLH1Q02575 133 aa15.51■□□□□ 0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 TRIP10Q15642 601 aa15.51■□□□□ 0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 KIF19Q2TAC6 998 aa15.51■□□□□ 0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa15.51■□□□□ 0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa15.51■□□□□ 0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 FAM151BQ6UXP7 276 aa15.51■□□□□ 0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 HACD2Q6Y1H2 254 aa15.51■□□□□ 0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 LPCAT2Q7L5N7 544 aa15.51■□□□□ 0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 SERPINA9Q86WD7 417 aa15.51■□□□□ 0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 PQLC1Q8N2U9 271 aa15.51■□□□□ 0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 TUBGCP3Q96CW5 907 aa15.51■□□□□ 0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 HGH1Q9BTY7 390 aa15.51■□□□□ 0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 HDAC8Q9BY41 377 aa15.51■□□□□ 0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 SGK2Q9HBY8 427 aa15.51■□□□□ 0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 CD274Q9NZQ7 290 aa15.51■□□□□ 0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 BTRCQ9Y297 605 aa15.51■□□□□ 0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 A0A0J9YYE9 177 aa15.51■□□□□ 0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa15.51■□□□□ 0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 GOLGA8CPA6NN73 597 aa15.51■□□□□ 0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 PEX1O43933 1283 aa15.51■□□□□ 0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 TRBC1P01850 177 aa15.51■□□□□ 0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 XPAP23025 273 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 HNF1BP35680 557 aa15.51■□□□□ 0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 NBL1P41271 181 aa15.51■□□□□ 0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 TAS2R38P59533 333 aa15.51■□□□□ 0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 CDKN3Q16667 212 aa15.51■□□□□ 0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 SFT2D3Q587I9 215 aa15.51■□□□□ 0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 TMEM154Q6P9G4 183 aa15.51■□□□□ 0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 SYVN1Q86TM6 617 aa15.51■□□□□ 0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 FAM156AQ8NDB6 213 aa15.51■□□□□ 0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 SNX19Q92543 992 aa15.51■□□□□ 0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 GATA6Q92908 595 aa15.51■□□□□ 0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 HSPA12BQ96MM6 686 aa15.51■□□□□ 0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 POLG2Q9UHN1 485 aa15.51■□□□□ 0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 CROTQ9UKG9 612 aa15.51■□□□□ 0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 RAB23Q9ULC3 237 aa15.51■□□□□ 0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 ITM2BQ9Y287 266 aa15.51■□□□□ 0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 TIMM22Q9Y584 194 aa15.51■□□□□ 0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa15.5■□□□□ 0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 CLDN7O95471 211 aa15.5■□□□□ 0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 ESRRBO95718 433 aa15.5■□□□□ 0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 HGFP14210 728 aa15.5■□□□□ 0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 TIMP2P16035 220 aa15.5■□□□□ 0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 MAOBP27338 520 aa15.5■□□□□ 0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 PEX2P28328 305 aa15.5■□□□□ 0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 RBBP7Q16576 425 aa15.5■□□□□ 0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 GSTA3Q16772 222 aa15.5■□□□□ 0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 PMS2CLQ68D20 193 aa15.5■□□□□ 0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 LAYNQ6UX15 382 aa15.5■□□□□ 0.07
TSNARE1-201ENST00000307180 MIER2Q8N344 545 aa15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms