RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000302313.9

WDR48-201, Transcript of WD repeat domain 48, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene WDR48, Length 3,707 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR48-201ENST00000302313 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
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WDR48-201ENST00000302313 OPTCQ9UBM4 332 aa7.05□□□□□ -1.28
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