RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258499.7

USP44-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 44, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP44, Length 4,022 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP44-201ENST00000258499 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
USP44-201ENST00000258499 SCELO95171 688 aa4.65□□□□□ -1.67
USP44-201ENST00000258499 PGLSO95336 258 aa4.65□□□□□ -1.67
USP44-201ENST00000258499 CLDN9O95484 217 aa4.65□□□□□ -1.67
USP44-201ENST00000258499 RPS17P08708 135 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
USP44-201ENST00000258499 MAPK1P28482 360 aa4.65□□□□□ -1.67
USP44-201ENST00000258499 TUFMP49411 452 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
USP44-201ENST00000258499 NUDT6P53370 316 aa4.65□□□□□ -1.67
USP44-201ENST00000258499 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
USP44-201ENST00000258499 STARD3Q14849 445 aa4.65□□□□□ -1.67
USP44-201ENST00000258499 CHRNA6Q15825 494 aa4.65□□□□□ -1.67
USP44-201ENST00000258499 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
USP44-201ENST00000258499 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
USP44-201ENST00000258499 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa4.65□□□□□ -1.67
USP44-201ENST00000258499 Q6ZSR9 355 aa4.65□□□□□ -1.67
USP44-201ENST00000258499 HIPK1Q86Z02 1210 aa4.65□□□□□ -1.67
USP44-201ENST00000258499 OR8H2Q8N162 312 aa4.65□□□□□ -1.67
USP44-201ENST00000258499 SVOPQ8N4V2 548 aa4.65□□□□□ -1.67
USP44-201ENST00000258499 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
USP44-201ENST00000258499 RAET1EQ8TD07 263 aa4.65□□□□□ -1.67
USP44-201ENST00000258499 CD200R1Q8TD46 325 aa4.65□□□□□ -1.67
USP44-201ENST00000258499 ITFG2Q969R8 447 aa4.65□□□□□ -1.67
USP44-201ENST00000258499 MYEOVQ96EZ4 313 aa4.65□□□□□ -1.67
USP44-201ENST00000258499 TMEM169Q96HH4 297 aa4.65□□□□□ -1.67
USP44-201ENST00000258499 ABHD8Q96I13 439 aa4.65□□□□□ -1.67
USP44-201ENST00000258499 C8orf48Q96LL4 319 aa4.65□□□□□ -1.67
USP44-201ENST00000258499 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
USP44-201ENST00000258499 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa4.65□□□□□ -1.67
USP44-201ENST00000258499 FAM118AQ9NWS6 357 aa4.65□□□□□ -1.67
USP44-201ENST00000258499 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
USP44-201ENST00000258499 MTRRQ9UBK8 725 aa4.65□□□□□ -1.67
USP44-201ENST00000258499 SNX6Q9UNH7 406 aa4.65□□□□□ -1.67
USP44-201ENST00000258499 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa4.65□□□□□ -1.67
USP44-201ENST00000258499 TESMINQ9Y4I5 508 aa4.65□□□□□ -1.67
USP44-201ENST00000258499 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa4.65□□□□□ -1.67
USP44-201ENST00000258499 MYO7AQ13402 2215 aa4.65□□□□□ -1.67
USP44-201ENST00000258499 KNL1Q8NG31 2342 aa4.65□□□□□ -1.67
USP44-201ENST00000258499 M0QZQ0 153 aa4.64□□□□□ -1.67
USP44-201ENST00000258499 HAS3O00219 553 aa4.64□□□□□ -1.67
USP44-201ENST00000258499 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
USP44-201ENST00000258499 TNFRSF10BO14763 440 aa4.64□□□□□ -1.67
USP44-201ENST00000258499 TBX1O43435 398 aa4.64□□□□□ -1.67
USP44-201ENST00000258499 RGS10O43665 173 aa4.64□□□□□ -1.67
USP44-201ENST00000258499 CACNG3O60359 315 aa4.64□□□□□ -1.67
USP44-201ENST00000258499 ZNF623O75123 536 aa4.64□□□□□ -1.67
USP44-201ENST00000258499 OPN1SWP03999 348 aa4.64□□□□□ -1.67
USP44-201ENST00000258499 CYP11A1P05108 521 aa4.64□□□□□ -1.67
USP44-201ENST00000258499 IL6P05231 212 aa4.64□□□□□ -1.67
USP44-201ENST00000258499 SERPIND1P05546 499 aa4.64□□□□□ -1.67
USP44-201ENST00000258499 KRT8P05787 483 aa4.64□□□□□ -1.67
USP44-201ENST00000258499 OPRL1P41146 370 aa4.64□□□□□ -1.67
USP44-201ENST00000258499 CCL23P55773 120 aa4.64□□□□□ -1.67
USP44-201ENST00000258499 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
USP44-201ENST00000258499 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
USP44-201ENST00000258499 CBLBQ13191 982 aa4.64□□□□□ -1.67
USP44-201ENST00000258499 PHKG1Q16816 387 aa4.64□□□□□ -1.67
USP44-201ENST00000258499 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
USP44-201ENST00000258499 XKR6Q5GH73 641 aa4.64□□□□□ -1.67
USP44-201ENST00000258499 MANEALQ5VSG8 457 aa4.64□□□□□ -1.67
USP44-201ENST00000258499 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
USP44-201ENST00000258499 CERS6Q6ZMG9 384 aa4.64□□□□□ -1.67
USP44-201ENST00000258499 OR5K1Q8NHB7 308 aa4.64□□□□□ -1.67
USP44-201ENST00000258499 ACDQ96AP0 544 aa4.64□□□□□ -1.67
USP44-201ENST00000258499 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
USP44-201ENST00000258499 ZBED2Q9BTP6 218 aa4.64□□□□□ -1.67
USP44-201ENST00000258499 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP4.64□□□□□ -1.67
USP44-201ENST00000258499 ITM2CQ9NQX7 267 aa4.64□□□□□ -1.67
USP44-201ENST00000258499 FAIMQ9NVQ4 179 aa4.64□□□□□ -1.67
USP44-201ENST00000258499 FNIP2Q9P278 1114 aa4.64□□□□□ -1.67
USP44-201ENST00000258499 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa4.64□□□□□ -1.67
USP44-201ENST00000258499 OGDHLQ9ULD0 1010 aa4.64□□□□□ -1.67
USP44-201ENST00000258499 DUSP12Q9UNI6 340 aa4.64□□□□□ -1.67
USP44-201ENST00000258499 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa4.64□□□□□ -1.67
USP44-201ENST00000258499 GMEB1Q9Y692 573 aa4.64□□□□□ -1.67
USP44-201ENST00000258499 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
USP44-201ENST00000258499 TRIM43BA6NCK2 446 aa4.64□□□□□ -1.67
USP44-201ENST00000258499 OR2AG2A6NM03 316 aa4.64□□□□□ -1.67
USP44-201ENST00000258499 H0YAE9 185 aa4.64□□□□□ -1.67
USP44-201ENST00000258499 FPGTO14772 594 aa4.64□□□□□ -1.67
USP44-201ENST00000258499 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
USP44-201ENST00000258499 UGT2B4P06133 528 aa4.64□□□□□ -1.67
USP44-201ENST00000258499 OR56A5P0C7T3 313 aa4.64□□□□□ -1.67
USP44-201ENST00000258499 TCF3P15923 654 aa4.64□□□□□ -1.67
USP44-201ENST00000258499 SERPINA4P29622 427 aa4.64□□□□□ -1.67
USP44-201ENST00000258499 SLC6A4P31645 630 aa4.64□□□□□ -1.67
USP44-201ENST00000258499 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
USP44-201ENST00000258499 TPTEP56180 551 aa4.64□□□□□ -1.67
USP44-201ENST00000258499 UBE3AQ05086 875 aa4.64□□□□□ -1.67
USP44-201ENST00000258499 FPGSQ05932 587 aa4.64□□□□□ -1.67
USP44-201ENST00000258499 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
USP44-201ENST00000258499 CHIT1Q13231 466 aa4.64□□□□□ -1.67
USP44-201ENST00000258499 RFX4Q33E94 735 aa4.64□□□□□ -1.67
USP44-201ENST00000258499 CYHR1Q6ZMK1 362 aa4.64□□□□□ -1.67
USP44-201ENST00000258499 C11orf96Q7Z7L8 435 aa4.64□□□□□ -1.67
USP44-201ENST00000258499 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
USP44-201ENST00000258499 TBC1D15Q8TC07 691 aa4.64□□□□□ -1.67
USP44-201ENST00000258499 TSPEARQ8WU66 669 aa4.64□□□□□ -1.67
USP44-201ENST00000258499 CAPSLQ8WWF8 208 aa4.64□□□□□ -1.67
USP44-201ENST00000258499 NELL1Q92832 810 aa4.64□□□□□ -1.67
USP44-201ENST00000258499 SLC39A13Q96H72 371 aa4.64□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.3 ms