RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000042824.12

Herc1-201, Transcript of HECT and RLD domain-containing E3 ubiquitin protein ligase family member 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Herc1, Length 15,153 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc1-201ENSMUST00000042824 Vsx2Q61412 361 aa5.75□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Pwwp2aQ69Z61 730 aa5.75□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Zfp759Q7M6X3 721 aa5.75□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Btnl1Q7TST0 509 aa5.75□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Tm9sf4Q8BH24 643 aa5.75□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Fem1abQ8C0T1 654 aa5.75□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Olfr801Q8VEU1 318 aa5.75□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 EmcnQ9R0H2 261 aa5.75□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Fem1aaQ9Z2G1 654 aa5.75□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Vmn1r2A2AMT6 306 aa5.75□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Ankrd34aB2RW11 495 aa5.75□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Olfr741L7N1Y5 311 aa5.75□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Mcpt2P15119 244 aa5.75□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Obox3Q3UT54 335 aa5.75□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Slc35d3Q8BGF8 422 aa5.75□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Fzd10Q8BKG4 582 aa5.75□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Ccdc71Q8VEG0 433 aa5.75□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Capns2Q9D7J7 247 aa5.75□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Jph1Q9ET80 660 aa5.75□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Tsc22d3Q9Z2S7 137 aa5.75□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Rad51dO55230 329 aa5.75□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Hoxb6P09023 224 aa5.75□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Il18P70380 192 aa5.75□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Olfr681Q3SXH8 315 aa5.75□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 PterQ60866 349 aa5.75□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Vrk2Q8BN21 503 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Olfr679Q8VGV0 315 aa5.75□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Haus5Q9D786 619 aa5.75□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Aldh7a1Q9DBF1 539 aa5.75□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Prokr1Q9JKL1 393 aa5.75□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 C2cd2E9Q3C1 696 aa5.75□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Gm14496K7N5U4 849 aa5.75□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 BckdhaP50136 442 aa5.75□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Eml1Q05BC3 814 aa5.75□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Cntn2Q61330 1040 aa5.75□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Zc3h11aQ6NZF1 792 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 MogsQ80UM7 834 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Tab1Q8CF89 502 aa5.75□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Cd207Q8VBX4 331 aa5.75□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Chmp1b2Q9CQD4 199 aa5.75□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Net1Q9Z206 595 aa5.75□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Trim67Q505D9 768 aa5.75□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Gpr17Q6NS65 339 aa5.75□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Bhlhb9Q6PB60 539 aa5.75□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Bend5Q8C6D4 421 aa5.75□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Wdr12Q9JJA4 423 aa5.75□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Apc2Q9Z1K7 2274 aa5.75□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Ccdc120A2AEV7 629 aa5.75□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Znf518bB2RRE4 1077 aa5.75□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Snx3O70492 162 aa5.75□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Irx2P81066 474 aa5.75□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Cyp3a16Q64481 504 aa5.75□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Lrrc66Q8K0B3 872 aa5.75□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Rad18Q9QXK2 509 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Olfr1508Q9R0K4 310 aa5.75□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Insl5Q9WUG6 135 aa5.75□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Lcn5A2AJB7 192 aa5.75□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Rem1O35929 297 aa5.75□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 F2P19221 618 aa5.75□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Htr5bP31387 370 aa5.75□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 AdprhP54923 362 aa5.75□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Inpp5jP59644 1003 aa5.75□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Kir3dl1P83555 432 aa5.75□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Znf185Q62394 352 aa5.75□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Arl4dQ99PE9 201 aa5.75□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Cntd1Q9D995 334 aa5.75□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Bloc1s6Q9R0C0 172 aa5.75□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Uba2Q9Z1F9 638 aa5.75□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Fbxo47A2A6H3 451 aa5.75□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Gm20503G3UZK1 150 aa5.75□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Cyp2a12P56593 492 aa5.75□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Actr1aP61164 376 aa5.75□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 ptchd1Q14B62 888 aa5.75□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Tha1Q6XPS7 400 aa5.75□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Foxo6Q70KY4 559 aa5.75□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Timm29Q8BGX2 266 aa5.75□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Slc15a3Q8BPX9 578 aa5.75□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Actr1bQ8R5C5 376 aa5.75□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Tmem150aQ91WN2 271 aa5.75□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Slc25a36Q922G0 311 aa5.75□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Dhrs7bQ99J47 323 aa5.75□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Pmf1Q9CPV5 202 aa5.75□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Senp8Q9D2Z4 221 aa5.75□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Rab13Q9DD03 202 aa5.75□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Stard5Q9EPQ7 213 aa5.75□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Vps29Q9QZ88 182 aa5.75□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 9330159F19RikD3Z623 648 aa5.75□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Vmn2r18E9Q280 788 aa5.75□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Ccdc7bE9Q9Y3 381 aa5.75□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Sh3pxd2aO89032 1124 aa5.75□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 CidecP56198 239 aa5.75□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Rab33aP97950 237 aa5.75□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 RykQ01887 594 aa5.75□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Spz1Q99MY0 378 aa5.75□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Adgrf4Q9D2L6 698 aa5.75□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Gmeb1Q9JL60 562 aa5.75□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Vmn2r116E9Q6I0 856 aa5.75□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Grik2P39087 908 aa5.75□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Znf367Q0VDT2 340 aa5.75□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Olfr1313Q7TQW8 311 aa5.75□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 38.2 ms