RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027404.11

Ptprn-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptprn, Length 3,554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn-201ENSMUST00000027404 DnpepQ9Z2W0 473 aa15.78■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pramef25A2ASI9 494 aa15.77■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Nipsnap3aB1AWZ3 247 aa15.77■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rnf169E9Q7F2 694 aa15.77■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm3642K7N6V4 267 aa15.77■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Emp3O35912 163 aa15.77■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pdx1P52946 284 aa15.77■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dab1P97318 588 aa15.77■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Nr4a2Q06219 598 aa15.77■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 LvrnQ2KHK3 559 aa15.77■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Lpcat1Q3TFD2 534 aa15.77■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ca4Q64444 305 aa15.77■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 MtdhQ80WJ7 579 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mup21Q80YX8 181 aa15.77■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Adnp2Q8CHC8 1165 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vmn1r203Q8R273 311 aa15.77■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gpn2Q8VEJ1 310 aa15.77■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tex22Q9D9U4 189 aa15.77■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dock1Q8BUR4 1865 aa15.77■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pcdh15Q99PJ1 1943 aa15.77■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ank3G5E8K5 1961 aa15.77■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Spin2gA0A0N4SW15 236 aa15.77■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pabpc4lG5E8X2 370 aa15.77■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Spin2eJ3QNQ0 234 aa15.77■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ms4a15Q3UPL6 245 aa15.77■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vtcn1Q7TSP5 283 aa15.77■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rsbn1Q80T69 795 aa15.77■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Prap1Q80XD8 149 aa15.77■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ppp1r1cQ8BKK4 108 aa15.77■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Itpk1Q8BYN3 419 aa15.77■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Akr1c20Q8VC77 323 aa15.77■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr183Q8VFB9 309 aa15.77■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 VitQ8VHI5 650 aa15.77■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Q9CXL3 195 aa15.77■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cnbd2Q9D5U8 673 aa15.77■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zbp1Q9QY24 411 aa15.77■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ccdc163A2AGD7 326 aa15.77■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 9330159F19RikD3Z623 648 aa15.77■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm20441G3UYJ7 252 aa15.77■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Prf1P10820 554 aa15.77■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 MaxP28574 160 aa15.77■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 OstnP61364 130 aa15.77■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Kcnj8P97794 424 aa15.77■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc23a3Q60850 611 aa15.77■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Apex2Q68G58 516 aa15.77■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Q8BH50 245 aa15.77■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rcn3Q8BH97 328 aa15.77■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 AcppQ8CE08 381 aa15.77■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 MfrpQ8K480 584 aa15.77■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Kcna10B2RQA1 511 aa15.76■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 St3gal5O88829 414 aa15.76■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 JunbP09450 344 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sap25Q1EHW4 186 aa15.76■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Hp1bp3Q3TEA8 554 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 D13Ertd608eQ3UPR8 151 aa15.76■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 RasefQ5RI75 627 aa15.76■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Krtcap2Q5RL79 136 aa15.76■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sec24dQ6NXL1 1032 aa15.76■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rpp38Q80UU2 280 aa15.76■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gpr171Q8BG55 319 aa15.76■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Steap3Q8CI59 488 aa15.76■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Prmt5Q8CIG8 637 aa15.76■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Trib2Q8K4K3 343 aa15.76■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 SelenomQ8VHC3 145 aa15.76■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tspan11Q9D1D1 253 aa15.76■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Enpp2Q9R1E6 862 aa15.76■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm7535F7CXE4 302 aa15.76■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm4847G3X946 537 aa15.76■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm10715J3QP74 227 aa15.76■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Idh2P54071 452 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Kcnk2P97438 426 aa15.76■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 VwdeQ6DFV8 926 aa15.76■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cpsf6Q6NVF9 551 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Wfikkn2Q7TQN3 571 aa15.76■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Kirrel1Q80W68 789 aa15.76■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zcchc4Q8BKW4 512 aa15.76■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fignl1Q8BPY9 683 aa15.76■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 CcsapQ8QZT2 252 aa15.76■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vmn1r198Q8R263 300 aa15.76■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fcf1Q9CTH6 198 aa15.76■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dnajb9Q9QYI6 222 aa15.76■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Epm2aQ9WUA5 330 aa15.76■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ehd1Q9WVK4 534 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sirpb1aA0A0A6YYP6 397 aa15.76■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Akap17bA2A3V1 959 aa15.76■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc43a3A2AVZ9 502 aa15.76■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 TagapB2RWW0 714 aa15.76■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ifi213D3Z5G0 586 aa15.76■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 A530032D15RikE9Q422 215 aa15.76■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sult3a1O35403 293 aa15.76■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 PargO88622 969 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fth1P09528 182 aa15.76■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 ArvcfP98203 962 aa15.76■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cyp2c65Q148B1 490 aa15.76■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Glb1l2Q3UPY5 636 aa15.76■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Plk5Q4FZD7 595 aa15.76■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Usp17laQ61068 526 aa15.76■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 RragdQ7TT45 449 aa15.76■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc45a3Q8K0H7 553 aa15.76■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vmn1r18Q8R2C8 299 aa15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 48.9 ms