RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 SH3BP2P78314 561 aa24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 ENPP7Q6UWV6 458 aa24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 VTI1BQ9UEU0 232 aa24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 MOSPD1Q9UJG1 213 aa24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 PRR19A6NJB7 356 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 C1orf105O95561 183 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 ACP5P13686 325 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 PDZD3Q86UT5 571 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 KIRREL3Q8IZU9 778 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 HGH1Q9BTY7 390 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 PCED1AQ9H1Q7 454 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 KLC4Q9NSK0 619 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 DNAJC28Q9NX36 388 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 TNFRSF10CO14798 259 aa24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 HDAC3O15379 428 aa24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 NDUFS2O75306 463 aa24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 MLYCDO95822 493 aa24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
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CAPNS1-215ENST00000628018 RABIFP47224 123 aa24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 TTC23LQ6PF05 361 aa24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 Q6ZSR6 202 aa24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 CADM4Q8NFZ8 388 aa24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 AGAP11Q8TF27 550 aa24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 OR1E3Q8WZA6 343 aa24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 FBXL8Q96CD0 374 aa24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 EBF4Q9BQW3 602 aa24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 WWP1Q9H0M0 922 aa24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 MID1IP1Q9NPA3 183 aa24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 ACSL5Q9ULC5 683 aa24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 METTL12A8MUP2 240 aa24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM233B4DJY2 109 aa24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 PI15O43692 258 aa24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 GDF5P43026 501 aa24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 BDKRB1P46663 353 aa24.27■■□□□ 1.48
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CAPNS1-215ENST00000628018 THOP1P52888 689 aa24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 GTF2H2Q13888 395 aa24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 CCSMST1Q4G0I0 132 aa24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 EPGNQ6UW88 154 aa24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 UNC5DQ6UXZ4 953 aa24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 MAPK15Q8TD08 544 aa24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 EDAQ92838 391 aa24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 FAR2Q96K12 515 aa24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 CCDC138Q96M89 665 aa24.27■■□□□ 1.48
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CAPNS1-215ENST00000628018 GPSM3Q9Y4H4 160 aa24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 TRAF6Q9Y4K3 522 aa24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 KRT87PA6NCN2 255 aa24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1-215ENST00000628018 K7EPI3 171 aa24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1-215ENST00000628018 AXIN1O15169 862 aa24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1-215ENST00000628018 STK16O75716 305 aa24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC6A12P48065 614 aa24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1-215ENST00000628018 IDH3AP50213 366 aa24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1-215ENST00000628018 IFT88Q13099 833 aa24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1-215ENST00000628018 OR13H1Q8NG92 308 aa24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1-215ENST00000628018 PDXPQ96GD0 296 aa24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1-215ENST00000628018 OR2M4Q96R27 311 aa24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1-215ENST00000628018 OPTCQ9UBM4 332 aa24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1-215ENST00000628018 INVSQ9Y283 1065 aa24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A1B0GTL3 188 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-215ENST00000628018 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-215ENST00000628018 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa24.25■■□□□ 1.47
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CAPNS1-215ENST00000628018 CLYBLQ8N0X4 340 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-215ENST00000628018 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-215ENST00000628018 TEX9Q8N6V9 391 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF382Q96SR6 550 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-215ENST00000628018 PKP4Q99569 1192 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-215ENST00000628018 GPR27Q9NS67 375 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-215ENST00000628018 HEY2Q9UBP5 337 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF225Q9UK10 706 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-215ENST00000628018 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-215ENST00000628018 PSMD13Q9UNM6 376 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-215ENST00000628018 KCNK6Q9Y257 313 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-215ENST00000628018 CCT8L1PA6NM43 557 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-215ENST00000628018 DCTN3O75935 186 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-215ENST00000628018 ESRRBO95718 433 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-215ENST00000628018 RBBP7Q16576 425 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-215ENST00000628018 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-215ENST00000628018 SYVN1Q86TM6 617 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM174AQ8TBP5 190 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-215ENST00000628018 STON2Q8WXE9 905 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-215ENST00000628018 ATL1Q8WXF7 558 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-215ENST00000628018 SNX19Q92543 992 aa24.25■■□□□ 1.47
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