RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589528.1

ACTN4-211, Transcript of actinin alpha 4, humanhuman

TSL 2

Gene ACTN4, Length 441 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4-211ENST00000589528 HGH1Q9BTY7 390 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTN4-211ENST00000589528 AP1M1Q9BXS5 423 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTN4-211ENST00000589528 RUBCNLQ9H714 662 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTN4-211ENST00000589528 VPS37BQ9H9H4 285 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTN4-211ENST00000589528 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
ACTN4-211ENST00000589528 ACTR10Q9NZ32 417 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTN4-211ENST00000589528 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
ACTN4-211ENST00000589528 RSPH14Q9UHP6 348 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTN4-211ENST00000589528 OSGIN2Q9Y236 505 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTN4-211ENST00000589528 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
ACTN4-211ENST00000589528 PRLHRP49683 370 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTN4-211ENST00000589528 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
ACTN4-211ENST00000589528 PRKG2Q13237 762 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTN4-211ENST00000589528 TFDP2Q14188 446 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTN4-211ENST00000589528 DEFB110Q30KQ9 67 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTN4-211ENST00000589528 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
ACTN4-211ENST00000589528 KAZNQ674X7 775 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTN4-211ENST00000589528 RHBDD2Q6NTF9 364 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTN4-211ENST00000589528 MYO7BQ6PIF6 2116 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTN4-211ENST00000589528 SPESP1Q6UW49 350 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTN4-211ENST00000589528 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
ACTN4-211ENST00000589528 PHC3Q8NDX5 983 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTN4-211ENST00000589528 OR52E1Q8NGJ3 308 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTN4-211ENST00000589528 ULK4Q96C45 1275 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTN4-211ENST00000589528 CNDP1Q96KN2 507 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTN4-211ENST00000589528 FCRL5Q96RD9 977 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTN4-211ENST00000589528 VAT1Q99536 393 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTN4-211ENST00000589528 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
ACTN4-211ENST00000589528 XKR8Q9H6D3 395 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTN4-211ENST00000589528 FKBPLQ9UIM3 349 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTN4-211ENST00000589528 ENTPD4Q9Y227 616 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTN4-211ENST00000589528 NTNG1Q9Y2I2 539 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTN4-211ENST00000589528 CSMD1Q96PZ7 3565 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTN4-211ENST00000589528 PRSS44E7EML9 344 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTN4-211ENST00000589528 AGPSO00116 658 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTN4-211ENST00000589528 MASP2O00187 686 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTN4-211ENST00000589528 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
ACTN4-211ENST00000589528 TMEM253P0C7T8 217 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTN4-211ENST00000589528 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
ACTN4-211ENST00000589528 ITGALP20701 1170 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTN4-211ENST00000589528 ARHGAP25P42331 645 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTN4-211ENST00000589528 UBASH3AP57075 661 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTN4-211ENST00000589528 WASHC5Q12768 1159 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTN4-211ENST00000589528 CDC16Q13042 620 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTN4-211ENST00000589528 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
ACTN4-211ENST00000589528 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
ACTN4-211ENST00000589528 SLC18A3Q16572 532 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTN4-211ENST00000589528 HIF1AQ16665 826 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTN4-211ENST00000589528 CRB2Q5IJ48 1285 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTN4-211ENST00000589528 KCNMB4Q86W47 210 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTN4-211ENST00000589528 ZNF567Q8N184 647 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTN4-211ENST00000589528 SLC35G2Q8TBE7 412 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTN4-211ENST00000589528 DNAJB14Q8TBM8 379 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTN4-211ENST00000589528 PPP4R1Q8TF05 950 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTN4-211ENST00000589528 COG1Q8WTW3 980 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTN4-211ENST00000589528 P3H4Q92791 437 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTN4-211ENST00000589528 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
ACTN4-211ENST00000589528 COPS8Q99627 209 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTN4-211ENST00000589528 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
ACTN4-211ENST00000589528 MVB12BQ9H7P6 319 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTN4-211ENST00000589528 COG4Q9H9E3 785 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTN4-211ENST00000589528 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
ACTN4-211ENST00000589528 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
ACTN4-211ENST00000589528 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
ACTN4-211ENST00000589528 CDYLQ9Y232 598 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTN4-211ENST00000589528 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTN4-211ENST00000589528 CST8O60676 142 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTN4-211ENST00000589528 ZG16O60844 167 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTN4-211ENST00000589528 GEMP55040 296 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTN4-211ENST00000589528 FANCCQ00597 558 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTN4-211ENST00000589528 LRRC38Q5VT99 294 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTN4-211ENST00000589528 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTN4-211ENST00000589528 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
ACTN4-211ENST00000589528 MFSD7Q6UXD7 560 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTN4-211ENST00000589528 TRIM73Q86UV7 250 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTN4-211ENST00000589528 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTN4-211ENST00000589528 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
ACTN4-211ENST00000589528 GRHL3Q8TE85 626 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTN4-211ENST00000589528 HEXDCQ8WVB3 486 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTN4-211ENST00000589528 AGAP4Q96P64 663 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTN4-211ENST00000589528 NRTNQ99748 197 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTN4-211ENST00000589528 NDC1Q9BTX1 674 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTN4-211ENST00000589528 FICDQ9BVA6 458 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTN4-211ENST00000589528 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
ACTN4-211ENST00000589528 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
ACTN4-211ENST00000589528 EPS8L2Q9H6S3 715 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTN4-211ENST00000589528 NENFQ9UMX5 172 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTN4-211ENST00000589528 C2CD3Q4AC94 2353 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTN4-211ENST00000589528 C5orf60A6NFR6 353 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTN4-211ENST00000589528 SPOPO43791 374 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTN4-211ENST00000589528 ANXA9O76027 345 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTN4-211ENST00000589528 CRTAMO95727 393 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTN4-211ENST00000589528 AGTP01019 485 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTN4-211ENST00000589528 EDN3P14138 238 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTN4-211ENST00000589528 PRF1P14222 555 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTN4-211ENST00000589528 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
ACTN4-211ENST00000589528 ALAS2P22557 587 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTN4-211ENST00000589528 CD151P48509 253 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTN4-211ENST00000589528 RIPPLY3P57055 190 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTN4-211ENST00000589528 SOX8P57073 446 aa14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms