RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580515.5

TSPOAP1-AS1-206, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 980 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 KATNA1O75449 491 aa23.38■■□□□ 1.33
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 SCRG1O75711 98 aa23.38■■□□□ 1.33
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 MSL3P1P0C860 447 aa23.38■■□□□ 1.33
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 SEMA3AQ14563 771 aa23.38■■□□□ 1.33
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 BRD3Q15059 726 aa23.38■■□□□ 1.33
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 SYTL3Q4VX76 610 aa23.38■■□□□ 1.33
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TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 TMEM126BQ8IUX1 230 aa23.38■■□□□ 1.33
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 TBC1D21Q8IYX1 336 aa23.38■■□□□ 1.33
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TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 XKR8Q9H6D3 395 aa23.38■■□□□ 1.33
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 FANCEQ9HB96 536 aa23.38■■□□□ 1.33
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 CHRAC1Q9NRG0 131 aa23.38■■□□□ 1.33
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 POLG2Q9UHN1 485 aa23.38■■□□□ 1.33
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ICKQ9UPZ9 632 aa23.38■■□□□ 1.33
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TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ST6GAL1P15907 406 aa23.37■■□□□ 1.33
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ERV3-1Q14264 604 aa23.37■■□□□ 1.33
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TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 GSTA5Q7RTV2 222 aa23.37■■□□□ 1.33
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 OR5K2Q8NHB8 316 aa23.37■■□□□ 1.33
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TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 HOMER3Q9NSC5 361 aa23.37■■□□□ 1.33
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa23.37■■□□□ 1.33
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TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 SUV39H1O43463 412 aa23.36■■□□□ 1.33
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TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 SHMT2P34897 504 aa23.36■■□□□ 1.33
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 KCNJ1P48048 391 aa23.36■■□□□ 1.33
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 BASP1P80723 227 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 NFKB2Q00653 900 aa23.36■■□□□ 1.33
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 SLC38A9Q8NBW4 561 aa23.36■■□□□ 1.33
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 LRFN5Q96NI6 719 aa23.36■■□□□ 1.33
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa23.36■■□□□ 1.33
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 CARD6Q9BX69 1037 aa23.36■■□□□ 1.33
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TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 TSSK1BQ9BXA7 367 aa23.35■■□□□ 1.33
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 AP1M1Q9BXS5 423 aa23.35■■□□□ 1.33
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TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ACTL8Q9H568 366 aa23.35■■□□□ 1.33
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 CATSPERZQ9NTU4 200 aa23.35■■□□□ 1.33
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TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 PIPSLA2A3N6 862 aa23.34■■□□□ 1.33
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 TTPAP49638 278 aa23.34■■□□□ 1.33
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 CRADDP78560 199 aa23.34■■□□□ 1.33
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 CDK16Q00536 496 aa23.34■■□□□ 1.33
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ABRQ12979 859 aa23.34■■□□□ 1.33
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 GPS2Q13227 327 aa23.34■■□□□ 1.33
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ZNF789Q5FWF6 425 aa23.34■■□□□ 1.33
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ATG14Q6ZNE5 492 aa23.34■■□□□ 1.33
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 SLC22A15Q8IZD6 547 aa23.34■■□□□ 1.33
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 PRELID2Q8N945 189 aa23.34■■□□□ 1.33
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 OR1L3Q8NH93 324 aa23.34■■□□□ 1.33
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ASZ1Q8WWH4 475 aa23.34■■□□□ 1.33
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 SEC14L1Q92503 715 aa23.34■■□□□ 1.33
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 CPT1BQ92523 772 aa23.34■■□□□ 1.33
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 OR6C2Q9NZP2 312 aa23.34■■□□□ 1.33
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 BFARQ9NZS9 450 aa23.34■■□□□ 1.33
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TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 CDYLQ9Y232 598 aa23.34■■□□□ 1.33
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa23.34■■□□□ 1.33
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 TMEM150CB9EJG8 249 aa23.33■■□□□ 1.33
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 GPC4O75487 556 aa23.33■■□□□ 1.33
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 PVRP15151 417 aa23.33■■□□□ 1.33
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 TPSB2P20231 275 aa23.33■■□□□ 1.33
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 PTPN4P29074 926 aa23.33■■□□□ 1.33
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 TPSAB1Q15661 275 aa23.33■■□□□ 1.33
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa23.33■■□□□ 1.33
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 MR1Q95460 341 aa23.33■■□□□ 1.33
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ABHD17AQ96GS6 310 aa23.33■■□□□ 1.33
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 RUFY1Q96T51 708 aa23.33■■□□□ 1.33
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 CDC14CA4D256 554 aa23.32■■□□□ 1.32
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