RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555557.5

SRP54-208, Transcript of signal recognition particle 54, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SRP54, Length 1,949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54-208ENST00000555557 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
SRP54-208ENST00000555557 DPEP2Q9H4A9 486 aa9.96□□□□□ -0.81
SRP54-208ENST00000555557 ARL15Q9NXU5 204 aa9.96□□□□□ -0.81
SRP54-208ENST00000555557 VPS13AQ96RL7 3174 aa9.96□□□□□ -0.82
SRP54-208ENST00000555557 PDZK1P1A8MUH7 402 aa9.95□□□□□ -0.82
SRP54-208ENST00000555557 PPP6CO00743 305 aa9.95□□□□□ -0.82
SRP54-208ENST00000555557 TAPBPO15533 448 aa9.95□□□□□ -0.82
SRP54-208ENST00000555557 EDF1O60869 148 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
SRP54-208ENST00000555557 SNNO75324 88 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
SRP54-208ENST00000555557 C1orf105O95561 183 aa9.95□□□□□ -0.82
SRP54-208ENST00000555557 EML2O95834 649 aa9.95□□□□□ -0.82
SRP54-208ENST00000555557 TNFP01375 233 aa9.95□□□□□ -0.82
SRP54-208ENST00000555557 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
SRP54-208ENST00000555557 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
SRP54-208ENST00000555557 KITP10721 976 aa9.95□□□□□ -0.82
SRP54-208ENST00000555557 HIST1H2ADP20671 130 aa9.95□□□□□ -0.82
SRP54-208ENST00000555557 CYP2A7P20853 494 aa9.95□□□□□ -0.82
SRP54-208ENST00000555557 DRD4P21917 467 aa9.95□□□□□ -0.82
SRP54-208ENST00000555557 GRK2P25098 689 aa9.95□□□□□ -0.82
SRP54-208ENST00000555557 HSPA7P48741 367 aa9.95□□□□□ -0.82
SRP54-208ENST00000555557 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
SRP54-208ENST00000555557 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
SRP54-208ENST00000555557 HERVK_113P63132 956 aa9.95□□□□□ -0.82
SRP54-208ENST00000555557 NFKB2Q00653 900 aa9.95□□□□□ -0.82
SRP54-208ENST00000555557 OCRLQ01968 901 aa9.95□□□□□ -0.82
SRP54-208ENST00000555557 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
SRP54-208ENST00000555557 DMPKQ09013 629 aa9.95□□□□□ -0.82
SRP54-208ENST00000555557 RPA4Q13156 261 aa9.95□□□□□ -0.82
SRP54-208ENST00000555557 PRKG2Q13237 762 aa9.95□□□□□ -0.82
SRP54-208ENST00000555557 C1orf61Q13536 156 aa9.95□□□□□ -0.82
SRP54-208ENST00000555557 CLCA4Q14CN2 919 aa9.95□□□□□ -0.82
SRP54-208ENST00000555557 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
SRP54-208ENST00000555557 CFAP157Q5JU67 520 aa9.95□□□□□ -0.82
SRP54-208ENST00000555557 CGB2Q6NT52 195 aa9.95□□□□□ -0.82
SRP54-208ENST00000555557 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
SRP54-208ENST00000555557 CPLX4Q7Z7G2 160 aa9.95□□□□□ -0.82
SRP54-208ENST00000555557 PDZD3Q86UT5 571 aa9.95□□□□□ -0.82
SRP54-208ENST00000555557 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
SRP54-208ENST00000555557 RASGRP3Q8IV61 690 aa9.95□□□□□ -0.82
SRP54-208ENST00000555557 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa9.95□□□□□ -0.82
SRP54-208ENST00000555557 OR5AR1Q8NGP9 310 aa9.95□□□□□ -0.82
SRP54-208ENST00000555557 AGR3Q8TD06 166 aa9.95□□□□□ -0.82
SRP54-208ENST00000555557 MCOLN3Q8TDD5 553 aa9.95□□□□□ -0.82
SRP54-208ENST00000555557 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
SRP54-208ENST00000555557 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
SRP54-208ENST00000555557 RHBDF1Q96CC6 855 aa9.95□□□□□ -0.82
SRP54-208ENST00000555557 CCDC126Q96EE4 140 aa9.95□□□□□ -0.82
SRP54-208ENST00000555557 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa9.95□□□□□ -0.82
SRP54-208ENST00000555557 RMDN2Q96LZ7 410 aa9.95□□□□□ -0.82
SRP54-208ENST00000555557 FOPNLQ96NB1 174 aa9.95□□□□□ -0.82
SRP54-208ENST00000555557 CCT8L2Q96SF2 557 aa9.95□□□□□ -0.82
SRP54-208ENST00000555557 SORT1Q99523 831 aa9.95□□□□□ -0.82
SRP54-208ENST00000555557 NRTNQ99748 197 aa9.95□□□□□ -0.82
SRP54-208ENST00000555557 HIST1H2AJQ99878 128 aa9.95□□□□□ -0.82
SRP54-208ENST00000555557 H2AFJQ9BTM1 129 aa9.95□□□□□ -0.82
SRP54-208ENST00000555557 ERVK-6Q9BXR3 956 aa9.95□□□□□ -0.82
SRP54-208ENST00000555557 RDH14Q9HBH5 336 aa9.95□□□□□ -0.82
SRP54-208ENST00000555557 TMEM74BQ9NUR3 256 aa9.95□□□□□ -0.82
SRP54-208ENST00000555557 THAP1Q9NVV9 213 aa9.95□□□□□ -0.82
SRP54-208ENST00000555557 PSD3Q9NYI0 1048 aa9.95□□□□□ -0.82
SRP54-208ENST00000555557 NUDT4Q9NZJ9 180 aa9.95□□□□□ -0.82
SRP54-208ENST00000555557 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
SRP54-208ENST00000555557 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
SRP54-208ENST00000555557 TBC1D29Q9UFV1 150 aa9.95□□□□□ -0.82
SRP54-208ENST00000555557 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
SRP54-208ENST00000555557 ASF1AQ9Y294 204 aa9.95□□□□□ -0.82
SRP54-208ENST00000555557 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa9.95□□□□□ -0.82
SRP54-208ENST00000555557 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa9.95□□□□□ -0.82
SRP54-208ENST00000555557 CCDC189A1A4V9 331 aa9.95□□□□□ -0.82
SRP54-208ENST00000555557 PRR19A6NJB7 356 aa9.95□□□□□ -0.82
SRP54-208ENST00000555557 OR52A4PA6NMU1 304 aa9.95□□□□□ -0.82
SRP54-208ENST00000555557 TLR4O00206 839 aa9.95□□□□□ -0.82
SRP54-208ENST00000555557 SLC16A5O15375 505 aa9.95□□□□□ -0.82
SRP54-208ENST00000555557 S100BP04271 92 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
SRP54-208ENST00000555557 ANXA5P08758 320 aa9.95□□□□□ -0.82
SRP54-208ENST00000555557 SLC35G4P0C7Q5 338 aa9.95□□□□□ -0.82
SRP54-208ENST00000555557 IDSP22304 550 aa9.95□□□□□ -0.82
SRP54-208ENST00000555557 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
SRP54-208ENST00000555557 ACTR1BP42025 376 aa9.95□□□□□ -0.82
SRP54-208ENST00000555557 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
SRP54-208ENST00000555557 ACTR1AP61163 376 aa9.95□□□□□ -0.82
SRP54-208ENST00000555557 SP140Q13342 867 aa9.95□□□□□ -0.82
SRP54-208ENST00000555557 SETDB1Q15047 1291 aa9.95□□□□□ -0.82
SRP54-208ENST00000555557 WDR45BQ5MNZ6 344 aa9.95□□□□□ -0.82
SRP54-208ENST00000555557 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
SRP54-208ENST00000555557 PARGQ86W56 976 aa9.95□□□□□ -0.82
SRP54-208ENST00000555557 NRROSQ86YC3 692 aa9.95□□□□□ -0.82
SRP54-208ENST00000555557 LSMEM2Q8N112 164 aa9.95□□□□□ -0.82
SRP54-208ENST00000555557 PDPRQ8NCN5 879 aa9.95□□□□□ -0.82
SRP54-208ENST00000555557 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa9.95□□□□□ -0.82
SRP54-208ENST00000555557 BCAS4Q8TDM0 211 aa9.95□□□□□ -0.82
SRP54-208ENST00000555557 GAB3Q8WWW8 586 aa9.95□□□□□ -0.82
SRP54-208ENST00000555557 L3HYPDHQ96EM0 354 aa9.95□□□□□ -0.82
SRP54-208ENST00000555557 C12orf66Q96MD2 445 aa9.95□□□□□ -0.82
SRP54-208ENST00000555557 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
SRP54-208ENST00000555557 PKP4Q99569 1192 aa9.95□□□□□ -0.82
SRP54-208ENST00000555557 TMEM79Q9BSE2 394 aa9.95□□□□□ -0.82
SRP54-208ENST00000555557 TRIM54Q9BYV2 358 aa9.95□□□□□ -0.82
SRP54-208ENST00000555557 DRC3Q9H069 523 aa9.95□□□□□ -0.82
SRP54-208ENST00000555557 ATG10Q9H0Y0 220 aa9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms