RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-231	ENST00000552222	SLC29A3	Q9BZD2	475 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	TRIM31	Q9BZY9	425 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	IL22	Q9GZX6	179 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	XAB2	Q9HCS7	855 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	IL26	Q9NPH9	171 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	BFAR	Q9NZS9	450 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	SCHIP1	Q9P0W5	487 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	PADI1	Q9ULC6	663 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	PCDHGA6	Q9Y5G7	932 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	HEATR9	A2RTY3	570 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	GOLGA8M	H3BSY2	632 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	SMAP	O00193	183 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	LRRTM2	O43300	516 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	AVIL	O75366	819 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	PYGL	P06737	847 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	ADRA1D	P25100	572 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	SPAM1	P38567	509 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	RPL21	P46778	160 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	PTPRCAP	Q14761	206 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	NAA30	Q147X3	362 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	UGT8	Q16880	541 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	CCDC38	Q502W7	563 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	PCID2	Q5JVF3	399 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	DNTTIP2	Q5QJE6	756 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	PWWP2B	Q6NUJ5	590 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	HIBCH	Q6NVY1	386 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	IYD	Q6PHW0	289 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	ADAMTSL4	Q6UY14	1074 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	CHST15	Q7LFX5	561 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	OR13C4	Q8NGS5	318 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	DTX3L	Q8TDB6	740 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	SCARF2	Q96GP6	870 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	CARD6	Q9BX69	1037 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	RAB17	Q9H0T7	212 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	NLE1	Q9NVX2	485 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	WHRN	Q9P202	907 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	RIMKLB	Q9ULI2	386 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	SNX24	Q9Y343	169 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	UTP11	Q9Y3A2	253 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	TCAF1	Q9Y4C2	921 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	PCDHGA9	Q9Y5G4	932 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	FADS2P1	A8MWK0	482 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	PRSS44	E7EML9	344 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	GAPDHS	O14556	408 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	MGAT1	P26572	445 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	HADHA	P40939	763 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	GPR1	P46091	355 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	ITGA8	P53708	1063 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	ITGA1	P56199	1179 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	CRADD	P78560	199 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	CHRNA6	Q15825	494 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	ZNF648	Q5T619	568 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	PRAMEF17	Q5VTA0	474 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	ARMC3	Q5W041	872 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	ALS2CL	Q60I27	953 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	PDPK2P	Q6A1A2	396 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	FAM92B	Q6ZTR7	304 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	NLRP9	Q7RTR0	991 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	MPP5	Q8N3R9	675 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	TRAM1L1	Q8N609	369 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	BBOF1	Q8ND07	529 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	PPHLN1	Q8NEY8	458 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	STYX	Q8WUJ0	223 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	PEX13	Q92968	403 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	DNAJC1	Q96KC8	554 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	ZNF778	Q96MU6	729 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	ZSCAN5A	Q9BUG6	496 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	SPATA16	Q9BXB7	569 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	ARFGAP3	Q9NP61	516 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	SYBU	Q9NX95	663 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	GRHL1	Q9NZI5	618 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	ZNHIT2	Q9UHR6	403 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	ANAPC5	Q9UJX4	755 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	CNOT6	Q9ULM6	557 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	ENTPD4	Q9Y227	616 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	DNHD1	Q96M86	4753 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	MN1	Q10571	1320 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	GLYATL1P3	A0A0U1RQE8	302 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	SDR42E2	A6NKP2	422 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	BHMG1	C9JSJ3	638 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222		H7C0S8	307 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	NDC80	O14777	642 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	RASSF9	O75901	435 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	CCNYL3	P0C7X3	344 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	ACP5	P13686	325 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	FOLR1	P15328	257 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	CA5A	P35218	305 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	DRG2	P55039	364 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	XIAP	P98170	497 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	SLC7A5	Q01650	507 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	ACVR1	Q04771	509 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	GLE1	Q53GS7	698 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	TSTD2	Q5T7W7	516 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	AGGF1	Q8N302	714 aa	eCLIP	13.46	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	OR13J1	Q8NGT2	312 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	SEC14L1	Q92503	715 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	RSC1A1	Q92681	617 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	PNPLA2	Q96AD5	504 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	COX14	Q96I36	57 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	KIFC1	Q9BW19	673 aa		13.46	□□□□□ -0.25

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