RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 FKBPLQ9UIM3 349 aa8.36□□□□□ -1.07
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PTPRB-208ENST00000550358 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 OXSMQ9NWU1 459 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 MS4A12Q9NXJ0 267 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
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