RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548557.1

CASC18-202, Transcript of cancer susceptibility 18, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CASC18, Length 2,503 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC18-202ENST00000548557 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa6.46□□□□□ -1.38
CASC18-202ENST00000548557 ARMC12Q5T9G4 340 aa6.46□□□□□ -1.38
CASC18-202ENST00000548557 METTL21CQ5VZV1 264 aa6.46□□□□□ -1.38
CASC18-202ENST00000548557 BRAT1Q6PJG6 821 aa6.46□□□□□ -1.38
CASC18-202ENST00000548557 FRMD7Q6ZUT3 714 aa6.46□□□□□ -1.38
CASC18-202ENST00000548557 SPARTQ8N0X7 666 aa6.46□□□□□ -1.38
CASC18-202ENST00000548557 IL17RCQ8NAC3 791 aa6.46□□□□□ -1.38
CASC18-202ENST00000548557 ACVR1CQ8NER5 493 aa6.46□□□□□ -1.38
CASC18-202ENST00000548557 OR6P1Q8NGX9 317 aa6.46□□□□□ -1.38
CASC18-202ENST00000548557 MAPK15Q8TD08 544 aa6.46□□□□□ -1.38
CASC18-202ENST00000548557 OR8D1Q8WZ84 308 aa6.46□□□□□ -1.38
CASC18-202ENST00000548557 ECHDC3Q96DC8 303 aa6.46□□□□□ -1.38
CASC18-202ENST00000548557 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
CASC18-202ENST00000548557 TRIB3Q96RU7 358 aa6.46□□□□□ -1.38
CASC18-202ENST00000548557 ECSITQ9BQ95 431 aa6.46□□□□□ -1.38
CASC18-202ENST00000548557 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
CASC18-202ENST00000548557 OSBPL6Q9BZF3 934 aa6.46□□□□□ -1.38
CASC18-202ENST00000548557 YIPF3Q9GZM5 350 aa6.46□□□□□ -1.38
CASC18-202ENST00000548557 IL22Q9GZX6 179 aa6.46□□□□□ -1.38
CASC18-202ENST00000548557 ADNPQ9H2P0 1102 aa6.46□□□□□ -1.38
CASC18-202ENST00000548557 SUV39H2Q9H5I1 410 aa6.46□□□□□ -1.38
CASC18-202ENST00000548557 NMRAL1Q9HBL8 299 aa6.46□□□□□ -1.38
CASC18-202ENST00000548557 CHRAC1Q9NRG0 131 aa6.46□□□□□ -1.38
CASC18-202ENST00000548557 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
CASC18-202ENST00000548557 OXSMQ9NWU1 459 aa6.46□□□□□ -1.38
CASC18-202ENST00000548557 IL36AQ9UHA7 158 aa6.46□□□□□ -1.38
CASC18-202ENST00000548557 MOSPD1Q9UJG1 213 aa6.46□□□□□ -1.38
CASC18-202ENST00000548557 MED16Q9Y2X0 877 aa6.46□□□□□ -1.38
CASC18-202ENST00000548557 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa6.46□□□□□ -1.38
CASC18-202ENST00000548557 RAI2Q9Y5P3 530 aa6.46□□□□□ -1.38
CASC18-202ENST00000548557 KANSL1LA0AUZ9 987 aa6.45□□□□□ -1.38
CASC18-202ENST00000548557 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CASC18-202ENST00000548557 ANKRD66B4E2M5 251 aa6.45□□□□□ -1.38
CASC18-202ENST00000548557 PDLIM1O00151 329 aa6.45□□□□□ -1.38
CASC18-202ENST00000548557 DCXO43602 365 aa6.45□□□□□ -1.38
CASC18-202ENST00000548557 BNIP3LO60238 219 aa6.45□□□□□ -1.38
CASC18-202ENST00000548557 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CASC18-202ENST00000548557 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CASC18-202ENST00000548557 GJB3O75712 270 aa6.45□□□□□ -1.38
CASC18-202ENST00000548557 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CASC18-202ENST00000548557 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CASC18-202ENST00000548557 OR5F1O95221 314 aa6.45□□□□□ -1.38
CASC18-202ENST00000548557 PRLP01236 227 aa6.45□□□□□ -1.38
CASC18-202ENST00000548557 TPH1P17752 444 aa6.45□□□□□ -1.38
CASC18-202ENST00000548557 NFKBIAP25963 317 aa6.45□□□□□ -1.38
CASC18-202ENST00000548557 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CASC18-202ENST00000548557 GRIA4P48058 902 aa6.45□□□□□ -1.38
CASC18-202ENST00000548557 HNMTP50135 292 aa6.45□□□□□ -1.38
CASC18-202ENST00000548557 DCAF7P61962 342 aa6.45□□□□□ -1.38
CASC18-202ENST00000548557 KLF10Q13118 480 aa6.45□□□□□ -1.38
CASC18-202ENST00000548557 STARD3Q14849 445 aa6.45□□□□□ -1.38
CASC18-202ENST00000548557 PCSK7Q16549 785 aa6.45□□□□□ -1.38
CASC18-202ENST00000548557 TJAP1Q5JTD0 557 aa6.45□□□□□ -1.38
CASC18-202ENST00000548557 EOGTQ5NDL2 527 aa6.45□□□□□ -1.38
CASC18-202ENST00000548557 DENND5AQ6IQ26 1287 aa6.45□□□□□ -1.38
CASC18-202ENST00000548557 GDPD4Q6W3E5 623 aa6.45□□□□□ -1.38
CASC18-202ENST00000548557 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CASC18-202ENST00000548557 RNF111Q6ZNA4 994 aa6.45□□□□□ -1.38
CASC18-202ENST00000548557 SLC15A3Q8IY34 581 aa6.45□□□□□ -1.38
CASC18-202ENST00000548557 ZNF687Q8N1G0 1237 aa6.45□□□□□ -1.38
CASC18-202ENST00000548557 TMEM151AQ8N4L1 468 aa6.45□□□□□ -1.38
CASC18-202ENST00000548557 OR6K2Q8NGY2 324 aa6.45□□□□□ -1.38
CASC18-202ENST00000548557 JADE3Q92613 823 aa6.45□□□□□ -1.38
CASC18-202ENST00000548557 ACOX2Q99424 681 aa6.45□□□□□ -1.38
CASC18-202ENST00000548557 GPR22Q99680 433 aa6.45□□□□□ -1.38
CASC18-202ENST00000548557 APOL2Q9BQE5 337 aa6.45□□□□□ -1.38
CASC18-202ENST00000548557 FICDQ9BVA6 458 aa6.45□□□□□ -1.38
CASC18-202ENST00000548557 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa6.45□□□□□ -1.38
CASC18-202ENST00000548557 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa6.45□□□□□ -1.38
CASC18-202ENST00000548557 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa6.45□□□□□ -1.38
CASC18-202ENST00000548557 PRSS16Q9NQE7 514 aa6.45□□□□□ -1.38
CASC18-202ENST00000548557 ITM2CQ9NQX7 267 aa6.45□□□□□ -1.38
CASC18-202ENST00000548557 SEMA3GQ9NS98 782 aa6.45□□□□□ -1.38
CASC18-202ENST00000548557 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CASC18-202ENST00000548557 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa6.45□□□□□ -1.38
CASC18-202ENST00000548557 CA14Q9ULX7 337 aa6.45□□□□□ -1.38
CASC18-202ENST00000548557 F5P12259 2224 aa6.45□□□□□ -1.38
CASC18-202ENST00000548557 LOC100653049A0A140TA62 436 aa6.45□□□□□ -1.38
CASC18-202ENST00000548557 RGSL1A5PLK6 1076 aa6.45□□□□□ -1.38
CASC18-202ENST00000548557 OR6C65A6NJZ3 312 aa6.45□□□□□ -1.38
CASC18-202ENST00000548557 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa6.45□□□□□ -1.38
CASC18-202ENST00000548557 E9PBE3 544 aa6.45□□□□□ -1.38
CASC18-202ENST00000548557 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa6.45□□□□□ -1.38
CASC18-202ENST00000548557 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CASC18-202ENST00000548557 ATG13O75143 517 aa6.45□□□□□ -1.38
CASC18-202ENST00000548557 LEFTY1O75610 366 aa6.45□□□□□ -1.38
CASC18-202ENST00000548557 KRT34O76011 436 aa6.45□□□□□ -1.38
CASC18-202ENST00000548557 PDE5AO76074 875 aa6.45□□□□□ -1.38
CASC18-202ENST00000548557 PGLSO95336 258 aa6.45□□□□□ -1.38
CASC18-202ENST00000548557 SBK3P0C264 359 aa6.45□□□□□ -1.38
CASC18-202ENST00000548557 CHRNB1P11230 501 aa6.45□□□□□ -1.38
CASC18-202ENST00000548557 HLA-EP13747 358 aa6.45□□□□□ -1.38
CASC18-202ENST00000548557 NMBRP28336 390 aa6.45□□□□□ -1.38
CASC18-202ENST00000548557 TRAF2Q12933 501 aa6.45□□□□□ -1.38
CASC18-202ENST00000548557 CUL3Q13618 768 aa6.45□□□□□ -1.38
CASC18-202ENST00000548557 ZNF805Q5CZA5 627 aa6.45□□□□□ -1.38
CASC18-202ENST00000548557 CFAP157Q5JU67 520 aa6.45□□□□□ -1.38
CASC18-202ENST00000548557 FAM46CQ5VWP2 391 aa6.45□□□□□ -1.38
CASC18-202ENST00000548557 BRICD5Q6PL45 260 aa6.45□□□□□ -1.38
CASC18-202ENST00000548557 GPR155Q7Z3F1 870 aa6.45□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.2 ms