RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540109.5

PTPRD-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 6,210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-214ENST00000540109 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 PCDHB8Q9UN66 801 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 C5orf58C9J3I9 102 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 AQP9O43315 295 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 SERPINF2P08697 491 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 TNNI3P19429 210 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 TKTL1P51854 596 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 CTBP2P56545 445 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 MGAT3Q09327 533 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 GPR68Q15743 365 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 SNAPC1Q16533 368 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 ZNF773Q6PK81 442 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 Q6ZNX1 250 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 SCUBE3Q8IX30 993 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 DCAKDQ8WVC6 231 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 KLHL6Q8WZ60 621 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 PIGKQ92643 395 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP5.96□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 CFHR5Q9BXR6 569 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 CLN6Q9NWW5 311 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 NOD1Q9Y239 953 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 GMPPBQ9Y5P6 360 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 A0A1B0GVI7 797 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 LRRC14BA6NHZ5 514 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 UBXN8O00124 270 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 OR2B3O76000 313 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 TMEM63AO94886 807 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 GNAO1P09471 354 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 LBPP18428 481 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 S100A2P29034 98 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 GPX6P59796 221 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 SSTP61278 116 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 ADIGQ0VDE8 80 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 IL18Q14116 193 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 DSG2Q14126 1118 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 SNX29P2Q8IUI4 249 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 CFAP206Q8IYR0 622 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 NODALQ96S42 347 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 RRAGCQ9HB90 399 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 TMEM138Q9NPI0 162 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 ARHGEF4Q9NR80 690 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 USP3Q9Y6I4 520 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 A0A0U1RQF3 1178 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 FAM159BA6NKW6 160 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 A8MUA0 341 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 ALDH1A2O94788 518 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 RASGRP1O95267 797 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 CRHR1P34998 444 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 ADRA1BP35368 520 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 FGL2Q14314 439 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 MED22Q15528 200 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 GPRC6AQ5T6X5 926 aa5.95□□□□□ -1.46
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PTPRD-214ENST00000540109 KCNT2Q6UVM3 1135 aa5.95□□□□□ -1.46
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PTPRD-214ENST00000540109 PID1Q7Z2X4 250 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 SPATA19Q7Z5L4 167 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 KRT77Q7Z794 578 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 SPPL2CQ8IUH8 684 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 UBQLNLQ8IYU4 475 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 IZUMO1Q8IYV9 350 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 SNAPC3Q92966 411 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 SLC45A3Q96JT2 553 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 FOPNLQ96NB1 174 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 TSGA13Q96PP4 275 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 FEM1AQ9BSK4 669 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 ABCC13Q9NSE7 274 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 NDFIP2Q9NV92 336 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 HPF1Q9NWY4 346 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 VPS28Q9UK41 221 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 KRBOX1C9JBD0 128 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 LRIG2O94898 1065 aa5.95□□□□□ -1.46
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PTPRD-214ENST00000540109 NUDT7P0C024 238 aa5.95□□□□□ -1.46
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PTPRD-214ENST00000540109 CES1P23141 567 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 GLDCP23378 1020 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 EPHA3P29320 983 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 IDH2P48735 452 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 MAN2A2P49641 1150 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 GALEQ14376 348 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 HKDC1Q2TB90 917 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 PM20D1Q6GTS8 502 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 RETREG3Q86VR2 466 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 LACC1Q8IV20 430 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 DSELQ8IZU8 1212 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 CCDC185Q8N715 623 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 C12orf29Q8N999 325 aa5.95□□□□□ -1.46
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