RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534219.5

PTPRJ-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRJ, Length 546 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-206ENST00000534219 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa24.21■■□□□ 1.47
PTPRJ-206ENST00000534219 F8W8V4 182 aa24.2■■□□□ 1.46
PTPRJ-206ENST00000534219 CREG1O75629 220 aa24.2■■□□□ 1.46
PTPRJ-206ENST00000534219 FGGP02679 453 aa24.2■■□□□ 1.46
PTPRJ-206ENST00000534219 FURINP09958 794 aa24.2■■□□□ 1.46
PTPRJ-206ENST00000534219 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
PTPRJ-206ENST00000534219 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
PTPRJ-206ENST00000534219 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
PTPRJ-206ENST00000534219 HOOK3Q86VS8 718 aa24.2■■□□□ 1.46
PTPRJ-206ENST00000534219 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
PTPRJ-206ENST00000534219 MAIP1Q8WWC4 291 aa24.2■■□□□ 1.46
PTPRJ-206ENST00000534219 MR1Q95460 341 aa24.2■■□□□ 1.46
PTPRJ-206ENST00000534219 KLHL25Q9H0H3 589 aa24.2■■□□□ 1.46
PTPRJ-206ENST00000534219 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
PTPRJ-206ENST00000534219 ACTR10Q9NZ32 417 aa24.2■■□□□ 1.46
PTPRJ-206ENST00000534219 ANAPC5Q9UJX4 755 aa24.2■■□□□ 1.46
PTPRJ-206ENST00000534219 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
PTPRJ-206ENST00000534219 ST6GAL1P15907 406 aa24.19■■□□□ 1.46
PTPRJ-206ENST00000534219 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
PTPRJ-206ENST00000534219 RPS15P62841 145 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
PTPRJ-206ENST00000534219 BASP1P80723 227 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
PTPRJ-206ENST00000534219 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
PTPRJ-206ENST00000534219 ACVR1Q04771 509 aa24.19■■□□□ 1.46
PTPRJ-206ENST00000534219 ZNF662Q6ZS27 426 aa24.19■■□□□ 1.46
PTPRJ-206ENST00000534219 LRRC8AQ8IWT6 810 aa24.19■■□□□ 1.46
PTPRJ-206ENST00000534219 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa24.19■■□□□ 1.46
PTPRJ-206ENST00000534219 TRIM58Q8NG06 486 aa24.19■■□□□ 1.46
PTPRJ-206ENST00000534219 ABHD17AQ96GS6 310 aa24.19■■□□□ 1.46
PTPRJ-206ENST00000534219 RUFY1Q96T51 708 aa24.19■■□□□ 1.46
PTPRJ-206ENST00000534219 ACTL8Q9H568 366 aa24.19■■□□□ 1.46
PTPRJ-206ENST00000534219 CHRAC1Q9NRG0 131 aa24.19■■□□□ 1.46
PTPRJ-206ENST00000534219 POLG2Q9UHN1 485 aa24.19■■□□□ 1.46
PTPRJ-206ENST00000534219 ICKQ9UPZ9 632 aa24.19■■□□□ 1.46
PTPRJ-206ENST00000534219 POLHQ9Y253 713 aa24.19■■□□□ 1.46
PTPRJ-206ENST00000534219 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
PTPRJ-206ENST00000534219 KCNMB2Q9Y691 235 aa24.19■■□□□ 1.46
PTPRJ-206ENST00000534219 SLC5A10A0PJK1 596 aa24.18■■□□□ 1.46
PTPRJ-206ENST00000534219 TMEM150CB9EJG8 249 aa24.18■■□□□ 1.46
PTPRJ-206ENST00000534219 CEP104O60308 925 aa24.18■■□□□ 1.46
PTPRJ-206ENST00000534219 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
PTPRJ-206ENST00000534219 ACADLP28330 430 aa24.18■■□□□ 1.46
PTPRJ-206ENST00000534219 SHMT2P34897 504 aa24.18■■□□□ 1.46
PTPRJ-206ENST00000534219 PCID2Q5JVF3 399 aa24.18■■□□□ 1.46
PTPRJ-206ENST00000534219 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa24.18■■□□□ 1.46
PTPRJ-206ENST00000534219 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
PTPRJ-206ENST00000534219 C4orf22Q6V702 233 aa24.18■■□□□ 1.46
PTPRJ-206ENST00000534219 ZNF534Q76KX8 674 aa24.18■■□□□ 1.46
PTPRJ-206ENST00000534219 TMEM135Q86UB9 458 aa24.18■■□□□ 1.46
PTPRJ-206ENST00000534219 TBC1D21Q8IYX1 336 aa24.18■■□□□ 1.46
PTPRJ-206ENST00000534219 CLIP3Q96DZ5 547 aa24.18■■□□□ 1.46
PTPRJ-206ENST00000534219 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa24.18■■□□□ 1.46
PTPRJ-206ENST00000534219 TSSK1BQ9BXA7 367 aa24.18■■□□□ 1.46
PTPRJ-206ENST00000534219 GPR87Q9BY21 358 aa24.18■■□□□ 1.46
PTPRJ-206ENST00000534219 PITPNM3Q9BZ71 974 aa24.18■■□□□ 1.46
PTPRJ-206ENST00000534219 SYTL2Q9HCH5 934 aa24.18■■□□□ 1.46
PTPRJ-206ENST00000534219 LATS2Q9NRM7 1088 aa24.18■■□□□ 1.46
PTPRJ-206ENST00000534219 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa24.18■■□□□ 1.46
PTPRJ-206ENST00000534219 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
PTPRJ-206ENST00000534219 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
PTPRJ-206ENST00000534219 WISP1O95388 367 aa24.17■■□□□ 1.46
PTPRJ-206ENST00000534219 PVRP15151 417 aa24.17■■□□□ 1.46
PTPRJ-206ENST00000534219 PTPN4P29074 926 aa24.17■■□□□ 1.46
PTPRJ-206ENST00000534219 KCNJ1P48048 391 aa24.17■■□□□ 1.46
PTPRJ-206ENST00000534219 KCNC4Q03721 635 aa24.17■■□□□ 1.46
PTPRJ-206ENST00000534219 GPS2Q13227 327 aa24.17■■□□□ 1.46
PTPRJ-206ENST00000534219 SEMA3AQ14563 771 aa24.17■■□□□ 1.46
PTPRJ-206ENST00000534219 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
PTPRJ-206ENST00000534219 UNC5AQ6ZN44 842 aa24.17■■□□□ 1.46
PTPRJ-206ENST00000534219 SLC38A9Q8NBW4 561 aa24.17■■□□□ 1.46
PTPRJ-206ENST00000534219 CPT1BQ92523 772 aa24.17■■□□□ 1.46
PTPRJ-206ENST00000534219 PEX13Q92968 403 aa24.17■■□□□ 1.46
PTPRJ-206ENST00000534219 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa24.17■■□□□ 1.46
PTPRJ-206ENST00000534219 SERTAD3Q9UJW9 196 aa24.17■■□□□ 1.46
PTPRJ-206ENST00000534219 NRDCO43847 1150 aa24.16■■□□□ 1.46
PTPRJ-206ENST00000534219 CYP2A7P20853 494 aa24.16■■□□□ 1.46
PTPRJ-206ENST00000534219 CXCR5P32302 372 aa24.16■■□□□ 1.46
PTPRJ-206ENST00000534219 RPS18P62269 152 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
PTPRJ-206ENST00000534219 CRADDP78560 199 aa24.16■■□□□ 1.46
PTPRJ-206ENST00000534219 HSPA14Q0VDF9 509 aa24.16■■□□□ 1.46
PTPRJ-206ENST00000534219 ABRQ12979 859 aa24.16■■□□□ 1.46
PTPRJ-206ENST00000534219 SPESP1Q6UW49 350 aa24.16■■□□□ 1.46
PTPRJ-206ENST00000534219 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
PTPRJ-206ENST00000534219 OR1L3Q8NH93 324 aa24.16■■□□□ 1.46
PTPRJ-206ENST00000534219 OR5K2Q8NHB8 316 aa24.16■■□□□ 1.46
PTPRJ-206ENST00000534219 SEC14L1Q92503 715 aa24.16■■□□□ 1.46
PTPRJ-206ENST00000534219 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
PTPRJ-206ENST00000534219 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
PTPRJ-206ENST00000534219 CATSPERZQ9NTU4 200 aa24.16■■□□□ 1.46
PTPRJ-206ENST00000534219 PLAGL1Q9UM63 463 aa24.16■■□□□ 1.46
PTPRJ-206ENST00000534219 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
PTPRJ-206ENST00000534219 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa24.16■■□□□ 1.46
PTPRJ-206ENST00000534219 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
PTPRJ-206ENST00000534219 AP3B1O00203 1094 aa24.15■■□□□ 1.46
PTPRJ-206ENST00000534219 KDM1AO60341 852 aa24.15■■□□□ 1.46
PTPRJ-206ENST00000534219 RECKO95980 971 aa24.15■■□□□ 1.46
PTPRJ-206ENST00000534219 CCR7P32248 378 aa24.15■■□□□ 1.46
PTPRJ-206ENST00000534219 TRIM73Q86UV7 250 aa24.15■■□□□ 1.46
PTPRJ-206ENST00000534219 SGSM3Q96HU1 749 aa24.15■■□□□ 1.46
PTPRJ-206ENST00000534219 CHST8Q9H2A9 424 aa24.15■■□□□ 1.46
PTPRJ-206ENST00000534219 CLMPQ9H6B4 373 aa24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45 ms