RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524325.5

TSNARE1-208, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-208ENST00000524325 SAP25Q8TEE9 199 aa22.18■■□□□ 1.14
TSNARE1-208ENST00000524325 PARD6AQ9NPB6 346 aa22.18■■□□□ 1.14
TSNARE1-208ENST00000524325 NEMP2A6NFY4 417 aa22.17■■□□□ 1.14
TSNARE1-208ENST00000524325 GLRA3O75311 464 aa22.17■■□□□ 1.14
TSNARE1-208ENST00000524325 GUCA1CO95843 209 aa22.17■■□□□ 1.14
TSNARE1-208ENST00000524325 ANXA6P08133 673 aa22.17■■□□□ 1.14
TSNARE1-208ENST00000524325 COL6A2P12110 1019 aa22.17■■□□□ 1.14
TSNARE1-208ENST00000524325 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
TSNARE1-208ENST00000524325 ACAP2Q15057 778 aa22.17■■□□□ 1.14
TSNARE1-208ENST00000524325 TECRLQ5HYJ1 363 aa22.17■■□□□ 1.14
TSNARE1-208ENST00000524325 IYDQ6PHW0 289 aa22.17■■□□□ 1.14
TSNARE1-208ENST00000524325 ARMC2Q8NEN0 867 aa22.17■■□□□ 1.14
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TSNARE1-208ENST00000524325 FERD3LQ96RJ6 166 aa22.17■■□□□ 1.14
TSNARE1-208ENST00000524325 HGH1Q9BTY7 390 aa22.17■■□□□ 1.14
TSNARE1-208ENST00000524325 ACSS2Q9NR19 701 aa22.17■■□□□ 1.14
TSNARE1-208ENST00000524325 NCDNQ9UBB6 729 aa22.17■■□□□ 1.14
TSNARE1-208ENST00000524325 PDE10AQ9Y233 779 aa22.17■■□□□ 1.14
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TSNARE1-208ENST00000524325 ACTL7BQ9Y614 415 aa22.17■■□□□ 1.14
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC19A1P41440 591 aa22.16■■□□□ 1.14
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TSNARE1-208ENST00000524325 ATP6V0D1P61421 351 aa22.16■■□□□ 1.14
TSNARE1-208ENST00000524325 KLC3Q6P597 504 aa22.16■■□□□ 1.14
TSNARE1-208ENST00000524325 IL27RAQ6UWB1 636 aa22.16■■□□□ 1.14
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
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TSNARE1-208ENST00000524325 RNF112Q9ULX5 631 aa22.16■■□□□ 1.14
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TSNARE1-208ENST00000524325 GFYI3L273 518 aa22.16■■□□□ 1.14
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TSNARE1-208ENST00000524325 HALP42357 657 aa22.16■■□□□ 1.14
TSNARE1-208ENST00000524325 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
TSNARE1-208ENST00000524325 NEK10Q6ZWH5 1172 aa22.16■■□□□ 1.14
TSNARE1-208ENST00000524325 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa22.16■■□□□ 1.14
TSNARE1-208ENST00000524325 CCDC91Q7Z6B0 441 aa22.16■■□□□ 1.14
TSNARE1-208ENST00000524325 CCDC63Q8NA47 563 aa22.16■■□□□ 1.14
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC37A2Q8TED4 501 aa22.16■■□□□ 1.14
TSNARE1-208ENST00000524325 FOPNLQ96NB1 174 aa22.16■■□□□ 1.14
TSNARE1-208ENST00000524325 SEMA4GQ9NTN9 838 aa22.16■■□□□ 1.14
TSNARE1-208ENST00000524325 GRID1Q9ULK0 1009 aa22.16■■□□□ 1.14
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TSNARE1-208ENST00000524325 TRIM38O00635 465 aa22.15■■□□□ 1.14
TSNARE1-208ENST00000524325 PLIN3O60664 434 aa22.15■■□□□ 1.14
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TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF806P0C7X5 589 aa22.15■■□□□ 1.14
TSNARE1-208ENST00000524325 PPP1R3AQ16821 1122 aa22.15■■□□□ 1.14
TSNARE1-208ENST00000524325 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa22.15■■□□□ 1.14
TSNARE1-208ENST00000524325 WASH2PQ6VEQ5 465 aa22.15■■□□□ 1.14
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TSNARE1-208ENST00000524325 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
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TSNARE1-208ENST00000524325 WASH6PQ9NQA3 447 aa22.15■■□□□ 1.14
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TSNARE1-208ENST00000524325 CCT8P50990 548 aa22.14■■□□□ 1.14
TSNARE1-208ENST00000524325 KRT33BQ14525 404 aa22.14■■□□□ 1.14
TSNARE1-208ENST00000524325 GPSM1Q86YR5 675 aa22.14■■□□□ 1.14
TSNARE1-208ENST00000524325 MOCOSQ96EN8 888 aa22.14■■□□□ 1.14
TSNARE1-208ENST00000524325 IL17FQ96PD4 163 aa22.14■■□□□ 1.14
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC12A9Q9BXP2 914 aa22.14■■□□□ 1.14
TSNARE1-208ENST00000524325 MKS1Q9NXB0 559 aa22.14■■□□□ 1.14
TSNARE1-208ENST00000524325 TMEM131Q92545 1883 aa22.14■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 GSTA1P08263 222 aa22.14■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 TPBGLP0DKB5 382 aa22.14■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 GPS2Q13227 327 aa22.14■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 FRA10AC1Q70Z53 315 aa22.14■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 RASGRP3Q8IV61 690 aa22.14■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 KYQ8NBH2 561 aa22.14■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 STAG3L4Q8TBR4 150 aa22.14■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 ESAMQ96AP7 390 aa22.14■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 CXorf40BQ96DE9 158 aa22.14■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 PKNOX2Q96KN3 472 aa22.14■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 MECRQ9BV79 373 aa22.14■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa22.14■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 XKR8Q9H6D3 395 aa22.14■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 PARVBQ9HBI1 364 aa22.14■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 PCDH15Q96QU1 1955 aa22.13■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 SUPT3HB4E1H0 165 aa22.13■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP22.13■■□□□ 1.132e-6■■■■□ 22.4
TSNARE1-208ENST00000524325 NOBOXO60393 691 aa22.13■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 SUPT3HO75486 399 aa22.13■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 C8GP07360 202 aa22.13■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 MTHFD2P13995 350 aa22.13■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 RPIAP49247 311 aa22.13■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 ATP1A2P50993 1020 aa22.13■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 TGFBIQ15582 683 aa22.13■■□□□ 1.13
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