RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523636.5

PABPC1-223, Transcript of poly(A) binding protein cytoplasmic 1, human

TSL 5

Gene PABPC1, Length 818 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PABPC1-223	ENST00000523636	NKX2-8	O15522	239 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PABPC1-223	ENST00000523636	GRID2	O43424	1007 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PABPC1-223	ENST00000523636	CHMP2A	O43633	222 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PABPC1-223	ENST00000523636	SLC25A17	O43808	307 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PABPC1-223	ENST00000523636	PRAMEF10	O60809	474 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PABPC1-223	ENST00000523636	BCAS2	O75934	225 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
PABPC1-223	ENST00000523636	CBX6	O95503	412 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PABPC1-223	ENST00000523636	LY86	O95711	162 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PABPC1-223	ENST00000523636	PNP	P00491	289 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PABPC1-223	ENST00000523636	NPPA	P01160	153 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PABPC1-223	ENST00000523636	CYP3A4	P08684	503 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PABPC1-223	ENST00000523636	TPM1	P09493	284 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PABPC1-223	ENST00000523636	LTA4H	P09960	611 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
PABPC1-223	ENST00000523636	GPR89B	P0CG08	455 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PABPC1-223	ENST00000523636	CTAGE8	P0CG41	777 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PABPC1-223	ENST00000523636	GAA	P10253	952 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PABPC1-223	ENST00000523636	LIF	P15018	202 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PABPC1-223	ENST00000523636	RXRA	P19793	462 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PABPC1-223	ENST00000523636	ITIH1	P19827	911 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PABPC1-223	ENST00000523636	CDH3	P22223	829 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PABPC1-223	ENST00000523636	CMA1	P23946	247 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PABPC1-223	ENST00000523636	CFP	P27918	469 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PABPC1-223	ENST00000523636	EEF1D	P29692	281 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
PABPC1-223	ENST00000523636	RABIF	P47224	123 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PABPC1-223	ENST00000523636	CAMLG	P49069	296 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PABPC1-223	ENST00000523636	NT5C2	P49902	561 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PABPC1-223	ENST00000523636	ZNF75D	P51815	510 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PABPC1-223	ENST00000523636	ART1	P52961	327 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PABPC1-223	ENST00000523636	SLC16A1	P53985	500 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PABPC1-223	ENST00000523636	PNLIPRP1	P54315	467 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PABPC1-223	ENST00000523636	WNT3A	P56704	352 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PABPC1-223	ENST00000523636	C21orf59	P57076	290 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PABPC1-223	ENST00000523636	KCNJ10	P78508	379 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PABPC1-223	ENST00000523636	GABPB1	Q06547	395 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
PABPC1-223	ENST00000523636	CD69	Q07108	199 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PABPC1-223	ENST00000523636	MGAT5	Q09328	741 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PABPC1-223	ENST00000523636	CETN1	Q12798	172 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PABPC1-223	ENST00000523636	DMP1	Q13316	513 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
PABPC1-223	ENST00000523636	SNX1	Q13596	522 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PABPC1-223	ENST00000523636	FRG1	Q14331	258 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
PABPC1-223	ENST00000523636	KCNJ12	Q14500	433 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PABPC1-223	ENST00000523636	DRAP1	Q14919	205 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
PABPC1-223	ENST00000523636	MORF4L2	Q15014	288 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PABPC1-223	ENST00000523636	TBCC	Q15814	346 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PABPC1-223	ENST00000523636	ZSCAN26	Q16670	478 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PABPC1-223	ENST00000523636	VMAC	Q2NL98	169 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PABPC1-223	ENST00000523636	CCDC40	Q4G0X9	1142 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PABPC1-223	ENST00000523636	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PABPC1-223	ENST00000523636	XKR9	Q5GH70	373 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PABPC1-223	ENST00000523636	TCP11X2	Q5H9J9	407 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PABPC1-223	ENST00000523636	ZCCHC12	Q6PEW1	402 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PABPC1-223	ENST00000523636	ISLR2	Q6UXK2	745 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PABPC1-223	ENST00000523636	USP30	Q70CQ3	517 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PABPC1-223	ENST00000523636	H1FNT	Q75WM6	255 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
PABPC1-223	ENST00000523636	CTAGE6	Q86UF2	777 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PABPC1-223	ENST00000523636	TMEM200A	Q86VY9	491 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PABPC1-223	ENST00000523636	METTL23	Q86XA0	190 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PABPC1-223	ENST00000523636	C1QL4	Q86Z23	238 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PABPC1-223	ENST00000523636	ARMC8	Q8IUR7	673 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PABPC1-223	ENST00000523636	CTAGE4	Q8IX94	777 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PABPC1-223	ENST00000523636	PEX5L	Q8IYB4	626 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PABPC1-223	ENST00000523636	FSIP1	Q8NA03	581 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PABPC1-223	ENST00000523636		Q8NA96	180 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PABPC1-223	ENST00000523636	ATP11C	Q8NB49	1132 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PABPC1-223	ENST00000523636	GLB1L3	Q8NCI6	653 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
PABPC1-223	ENST00000523636	FBXO18	Q8NFZ0	1043 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PABPC1-223	ENST00000523636	GPR150	Q8NGU9	434 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PABPC1-223	ENST00000523636	FIBIN	Q8TAL6	211 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PABPC1-223	ENST00000523636	IFI44	Q8TCB0	444 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PABPC1-223	ENST00000523636	MAPK15	Q8TD08	544 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PABPC1-223	ENST00000523636	SLC5A11	Q8WWX8	675 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PABPC1-223	ENST00000523636	MRPS31	Q92665	395 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
PABPC1-223	ENST00000523636	WBP2	Q969T9	261 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PABPC1-223	ENST00000523636	ZNF653	Q96CK0	615 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PABPC1-223	ENST00000523636	SLC7A6OS	Q96CW6	309 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
PABPC1-223	ENST00000523636	SIPA1	Q96FS4	1042 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PABPC1-223	ENST00000523636	EPSTI1	Q96J88	318 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PABPC1-223	ENST00000523636	APOLD1	Q96LR9	279 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PABPC1-223	ENST00000523636	GBP5	Q96PP8	586 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PABPC1-223	ENST00000523636	BPIFA3	Q9BQP9	254 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PABPC1-223	ENST00000523636	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PABPC1-223	ENST00000523636	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PABPC1-223	ENST00000523636	INTS2	Q9H0H0	1204 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
PABPC1-223	ENST00000523636	RNF41	Q9H4P4	317 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
PABPC1-223	ENST00000523636	TTC12	Q9H892	705 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
PABPC1-223	ENST00000523636	TRPC7	Q9HCX4	862 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PABPC1-223	ENST00000523636	TAB2	Q9NYJ8	693 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PABPC1-223	ENST00000523636	HSFX1	Q9UBD0	423 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PABPC1-223	ENST00000523636	LRWD1	Q9UFC0	647 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PABPC1-223	ENST00000523636	IL19	Q9UHD0	177 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PABPC1-223	ENST00000523636	KLHL20	Q9Y2M5	609 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PABPC1-223	ENST00000523636	CCL27	Q9Y4X3	112 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PABPC1-223	ENST00000523636	STON1	Q9Y6Q2	735 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PABPC1-223	ENST00000523636	HIVEP2	P31629	2446 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	TRAV19	A0A0A6YYK7	116 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	RNF103-CHMP3	A0A140T963	221 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	CCDC151	A5D8V7	595 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	CCDC154	A6NI56	674 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	LRRIQ4	A6NIV6	560 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	PALM2-AKAP2	B1ALY0	433 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6

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