RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511439.5

TOPBP1-208, Transcript of DNA topoisomerase II binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene TOPBP1, Length 1,142 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1-208ENST00000511439 TDRPQ86YL5 185 aa3.57□□□□□ -1.84
TOPBP1-208ENST00000511439 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa3.57□□□□□ -1.84
TOPBP1-208ENST00000511439 OIT3Q8WWZ8 545 aa3.57□□□□□ -1.84
TOPBP1-208ENST00000511439 DNASE1L2Q92874 299 aa3.57□□□□□ -1.84
TOPBP1-208ENST00000511439 FGF14Q92915 247 aa3.57□□□□□ -1.84
TOPBP1-208ENST00000511439 ATP6V0A1Q93050 837 aa3.57□□□□□ -1.84
TOPBP1-208ENST00000511439 FBXL8Q96CD0 374 aa3.57□□□□□ -1.84
TOPBP1-208ENST00000511439 PERPQ96FX8 193 aa3.57□□□□□ -1.84
TOPBP1-208ENST00000511439 ZNF479Q96JC4 524 aa3.57□□□□□ -1.84
TOPBP1-208ENST00000511439 ZNF558Q96NG5 402 aa3.57□□□□□ -1.84
TOPBP1-208ENST00000511439 MAP7D2Q96T17 732 aa3.57□□□□□ -1.84
TOPBP1-208ENST00000511439 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
TOPBP1-208ENST00000511439 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
TOPBP1-208ENST00000511439 DCLK3Q9C098 648 aa3.57□□□□□ -1.84
TOPBP1-208ENST00000511439 MAGEE1Q9HCI5 957 aa3.57□□□□□ -1.84
TOPBP1-208ENST00000511439 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
TOPBP1-208ENST00000511439 HEBP1Q9NRV9 189 aa3.57□□□□□ -1.84
TOPBP1-208ENST00000511439 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa3.57□□□□□ -1.84
TOPBP1-208ENST00000511439 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa3.57□□□□□ -1.84
TOPBP1-208ENST00000511439 TXLNGQ9NUQ3 528 aa3.57□□□□□ -1.84
TOPBP1-208ENST00000511439 RAI14Q9P0K7 980 aa3.57□□□□□ -1.84
TOPBP1-208ENST00000511439 HAO1Q9UJM8 370 aa3.57□□□□□ -1.84
TOPBP1-208ENST00000511439 CAPN7Q9Y6W3 813 aa3.57□□□□□ -1.84
TOPBP1-208ENST00000511439 OTOGQ6ZRI0 2925 aa3.57□□□□□ -1.84
TOPBP1-208ENST00000511439 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa3.56□□□□□ -1.84
TOPBP1-208ENST00000511439 ZMYM6O95789 1325 aa3.56□□□□□ -1.84
TOPBP1-208ENST00000511439 A0A1B0GVM2 712 aa3.56□□□□□ -1.84
TOPBP1-208ENST00000511439 USP17L23D6RBM5 183 aa3.56□□□□□ -1.84
TOPBP1-208ENST00000511439 HAS3O00219 553 aa3.56□□□□□ -1.84
TOPBP1-208ENST00000511439 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
TOPBP1-208ENST00000511439 DIAPH2O60879 1101 aa3.56□□□□□ -1.84
TOPBP1-208ENST00000511439 MTA2O94776 668 aa3.56□□□□□ -1.84
TOPBP1-208ENST00000511439 CCNDBP1O95273 360 aa3.56□□□□□ -1.84
TOPBP1-208ENST00000511439 CXCL14O95715 111 aa3.56□□□□□ -1.84
TOPBP1-208ENST00000511439 GH1P01241 217 aa3.56□□□□□ -1.84
TOPBP1-208ENST00000511439 ZNF286BP0CG31 522 aa3.56□□□□□ -1.84
TOPBP1-208ENST00000511439 KRT10P13645 584 aa3.56□□□□□ -1.84
TOPBP1-208ENST00000511439 CHATP28329 748 aa3.56□□□□□ -1.84
TOPBP1-208ENST00000511439 CDAP32320 146 aa3.56□□□□□ -1.84
TOPBP1-208ENST00000511439 RARSP54136 660 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
TOPBP1-208ENST00000511439 OLR1P78380 273 aa3.56□□□□□ -1.84
TOPBP1-208ENST00000511439 IRX4P78413 519 aa3.56□□□□□ -1.84
TOPBP1-208ENST00000511439 SETQ01105 290 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
TOPBP1-208ENST00000511439 ITGADQ13349 1161 aa3.56□□□□□ -1.84
TOPBP1-208ENST00000511439 MAPK6Q16659 721 aa3.56□□□□□ -1.84
TOPBP1-208ENST00000511439 ALG11Q2TAA5 492 aa3.56□□□□□ -1.84
TOPBP1-208ENST00000511439 PCGF5Q86SE9 256 aa3.56□□□□□ -1.84
TOPBP1-208ENST00000511439 SLC35F3Q8IY50 421 aa3.56□□□□□ -1.84
TOPBP1-208ENST00000511439 FBXL14Q8N1E6 418 aa3.56□□□□□ -1.84
TOPBP1-208ENST00000511439 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
TOPBP1-208ENST00000511439 AADATQ8N5Z0 425 aa3.56□□□□□ -1.84
TOPBP1-208ENST00000511439 ARRDC2Q8TBH0 407 aa3.56□□□□□ -1.84
TOPBP1-208ENST00000511439 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
TOPBP1-208ENST00000511439 DNAAF4Q8WXU2 420 aa3.56□□□□□ -1.84
TOPBP1-208ENST00000511439 FAM3CQ92520 227 aa3.56□□□□□ -1.84
TOPBP1-208ENST00000511439 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
TOPBP1-208ENST00000511439 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa3.56□□□□□ -1.84
TOPBP1-208ENST00000511439 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
TOPBP1-208ENST00000511439 STRA6Q9BX79 667 aa3.56□□□□□ -1.84
TOPBP1-208ENST00000511439 TKTL2Q9H0I9 626 aa3.56□□□□□ -1.84
TOPBP1-208ENST00000511439 SCPEP1Q9HB40 452 aa3.56□□□□□ -1.84
TOPBP1-208ENST00000511439 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa3.56□□□□□ -1.84
TOPBP1-208ENST00000511439 BPIFA1Q9NP55 256 aa3.56□□□□□ -1.84
TOPBP1-208ENST00000511439 ASAH2Q9NR71 780 aa3.56□□□□□ -1.84
TOPBP1-208ENST00000511439 TBC1D22BQ9NU19 505 aa3.56□□□□□ -1.84
TOPBP1-208ENST00000511439 SPG21Q9NZD8 308 aa3.56□□□□□ -1.84
TOPBP1-208ENST00000511439 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP3.56□□□□□ -1.84
TOPBP1-208ENST00000511439 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa3.56□□□□□ -1.84
TOPBP1-208ENST00000511439 PCDHA7Q9UN72 937 aa3.56□□□□□ -1.84
TOPBP1-208ENST00000511439 MYH7BA7E2Y1 1941 aa3.56□□□□□ -1.84
TOPBP1-208ENST00000511439 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa3.56□□□□□ -1.84
TOPBP1-208ENST00000511439 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa3.56□□□□□ -1.84
TOPBP1-208ENST00000511439 FOCADQ5VW36 1801 aa3.56□□□□□ -1.84
TOPBP1-208ENST00000511439 C2orf16Q68DN1 1984 aa3.55□□□□□ -1.84
TOPBP1-208ENST00000511439 MYH15Q9Y2K3 1946 aa3.55□□□□□ -1.84
TOPBP1-208ENST00000511439 J3KR12 359 aa3.55□□□□□ -1.84
TOPBP1-208ENST00000511439 ACOT8O14734 319 aa3.55□□□□□ -1.84
TOPBP1-208ENST00000511439 WNT9BO14905 357 aa3.55□□□□□ -1.84
TOPBP1-208ENST00000511439 TIMM23O14925 209 aa3.55□□□□□ -1.84
TOPBP1-208ENST00000511439 PAGE4O60829 102 aa3.55□□□□□ -1.84
TOPBP1-208ENST00000511439 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
TOPBP1-208ENST00000511439 NDUFB4O95168 129 aa3.55□□□□□ -1.84
TOPBP1-208ENST00000511439 VNN2O95498 520 aa3.55□□□□□ -1.84
TOPBP1-208ENST00000511439 SCGB1D1O95968 90 aa3.55□□□□□ -1.84
TOPBP1-208ENST00000511439 MMP2P08253 660 aa3.55□□□□□ -1.84
TOPBP1-208ENST00000511439 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
TOPBP1-208ENST00000511439 AMTP48728 403 aa3.55□□□□□ -1.84
TOPBP1-208ENST00000511439 COMPP49747 757 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
TOPBP1-208ENST00000511439 MXI1P50539 228 aa3.55□□□□□ -1.84
TOPBP1-208ENST00000511439 CLCN4P51793 760 aa3.55□□□□□ -1.84
TOPBP1-208ENST00000511439 DSC1Q08554 894 aa3.55□□□□□ -1.84
TOPBP1-208ENST00000511439 MAMLD1Q13495 774 aa3.55□□□□□ -1.84
TOPBP1-208ENST00000511439 OLIG2Q13516 323 aa3.55□□□□□ -1.84
TOPBP1-208ENST00000511439 FGFBP1Q14512 234 aa3.55□□□□□ -1.84
TOPBP1-208ENST00000511439 WTAPQ15007 396 aa3.55□□□□□ -1.84
TOPBP1-208ENST00000511439 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
TOPBP1-208ENST00000511439 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
TOPBP1-208ENST00000511439 MZT2BQ6NZ67 158 aa3.55□□□□□ -1.84
TOPBP1-208ENST00000511439 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
TOPBP1-208ENST00000511439 LCTLQ6UWM7 567 aa3.55□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.4 ms