RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503362.1

SPCS3-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS3, Length 4,571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS3-201ENST00000503362 SGTAO43765 313 aa13.01□□□□□ -0.33
SPCS3-201ENST00000503362 DIRAS1O95057 198 aa13.01□□□□□ -0.33
SPCS3-201ENST00000503362 TFPTP0C1Z6 253 aa13.01□□□□□ -0.33
SPCS3-201ENST00000503362 ZNF12P17014 697 aa13.01□□□□□ -0.33
SPCS3-201ENST00000503362 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
SPCS3-201ENST00000503362 RAB39AQ14964 217 aa13.01□□□□□ -0.33
SPCS3-201ENST00000503362 INAQ16352 499 aa13.01□□□□□ -0.33
SPCS3-201ENST00000503362 ERICH5Q6P6B1 374 aa13.01□□□□□ -0.33
SPCS3-201ENST00000503362 CNTN4Q8IWV2 1026 aa13.01□□□□□ -0.33
SPCS3-201ENST00000503362 DEPDC4Q8N2C3 294 aa13.01□□□□□ -0.33
SPCS3-201ENST00000503362 TCAIMQ8N3R3 496 aa13.01□□□□□ -0.33
SPCS3-201ENST00000503362 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
SPCS3-201ENST00000503362 NLNQ9BYT8 704 aa13.01□□□□□ -0.33
SPCS3-201ENST00000503362 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa13.01□□□□□ -0.33
SPCS3-201ENST00000503362 MAGEB17A8MXT2 336 aa13.01□□□□□ -0.33
SPCS3-201ENST00000503362 ERN1O75460 977 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
SPCS3-201ENST00000503362 BMP2P12643 396 aa13.01□□□□□ -0.33
SPCS3-201ENST00000503362 CTSKP43235 329 aa13.01□□□□□ -0.33
SPCS3-201ENST00000503362 PRKAG1P54619 331 aa13.01□□□□□ -0.33
SPCS3-201ENST00000503362 TRIM32Q13049 653 aa13.01□□□□□ -0.33
SPCS3-201ENST00000503362 GPR153Q6NV75 609 aa13.01□□□□□ -0.33
SPCS3-201ENST00000503362 TRAF7Q6Q0C0 670 aa13.01□□□□□ -0.33
SPCS3-201ENST00000503362 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
SPCS3-201ENST00000503362 HPS1Q92902 700 aa13.01□□□□□ -0.33
SPCS3-201ENST00000503362 PEX13Q92968 403 aa13.01□□□□□ -0.33
SPCS3-201ENST00000503362 MTERF3Q96E29 417 aa13.01□□□□□ -0.33
SPCS3-201ENST00000503362 ZNF382Q96SR6 550 aa13.01□□□□□ -0.33
SPCS3-201ENST00000503362 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
SPCS3-201ENST00000503362 PSME2Q9UL46 239 aa13.01□□□□□ -0.33
SPCS3-201ENST00000503362 CORO2BQ9UQ03 480 aa13.01□□□□□ -0.33
SPCS3-201ENST00000503362 TESMINQ9Y4I5 508 aa13.01□□□□□ -0.33
SPCS3-201ENST00000503362 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
SPCS3-201ENST00000503362 ARVCFO00192 962 aa13□□□□□ -0.33
SPCS3-201ENST00000503362 KDELR3O43731 214 aa13□□□□□ -0.33
SPCS3-201ENST00000503362 RASAL1O95294 804 aa13□□□□□ -0.33
SPCS3-201ENST00000503362 HSD17B1P14061 328 aa13□□□□□ -0.33
SPCS3-201ENST00000503362 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
SPCS3-201ENST00000503362 CASP9P55211 416 aa13□□□□□ -0.33
SPCS3-201ENST00000503362 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
SPCS3-201ENST00000503362 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP13□□□□□ -0.332e-7■□□□□ 9.2
SPCS3-201ENST00000503362 NPAS4Q8IUM7 802 aa13□□□□□ -0.33
SPCS3-201ENST00000503362 KBTBD8Q8NFY9 601 aa13□□□□□ -0.33
SPCS3-201ENST00000503362 OR13J1Q8NGT2 312 aa13□□□□□ -0.33
SPCS3-201ENST00000503362 AGRPO00253 132 aa13□□□□□ -0.33
SPCS3-201ENST00000503362 MYL12BO14950 172 aa13□□□□□ -0.33
SPCS3-201ENST00000503362 MTX2O75431 263 aa13□□□□□ -0.33
SPCS3-201ENST00000503362 GJB5O95377 273 aa13□□□□□ -0.33
SPCS3-201ENST00000503362 RPL10P27635 214 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
SPCS3-201ENST00000503362 TP53BP2Q13625 1128 aa13□□□□□ -0.33
SPCS3-201ENST00000503362 ATP6AP1Q15904 470 aa13□□□□□ -0.33
SPCS3-201ENST00000503362 ANXA8L1Q5VT79 327 aa13□□□□□ -0.33
SPCS3-201ENST00000503362 OR4F3Q6IEY1 312 aa13□□□□□ -0.33
SPCS3-201ENST00000503362 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
SPCS3-201ENST00000503362 TRIM40Q6P9F5 258 aa13□□□□□ -0.33
SPCS3-201ENST00000503362 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
SPCS3-201ENST00000503362 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
SPCS3-201ENST00000503362 TMEM181Q9P2C4 612 aa13□□□□□ -0.33
SPCS3-201ENST00000503362 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
SPCS3-201ENST00000503362 PHIPQ8WWQ0 1821 aa13□□□□□ -0.33
SPCS3-201ENST00000503362 SNTNA6NMZ2 147 aa13□□□□□ -0.33
SPCS3-201ENST00000503362 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa13□□□□□ -0.33
SPCS3-201ENST00000503362 ITGA2P17301 1181 aa13□□□□□ -0.33
SPCS3-201ENST00000503362 PPIBP23284 216 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
SPCS3-201ENST00000503362 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
SPCS3-201ENST00000503362 CYP2A13Q16696 494 aa13□□□□□ -0.33
SPCS3-201ENST00000503362 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
SPCS3-201ENST00000503362 LCN8Q6JVE9 175 aa13□□□□□ -0.33
SPCS3-201ENST00000503362 CYP2U1Q7Z449 544 aa13□□□□□ -0.33
SPCS3-201ENST00000503362 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
SPCS3-201ENST00000503362 PPCDCQ96CD2 204 aa13□□□□□ -0.33
SPCS3-201ENST00000503362 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa13□□□□□ -0.33
SPCS3-201ENST00000503362 GPR62Q9BZJ7 368 aa13□□□□□ -0.33
SPCS3-201ENST00000503362 MAPRE3Q9UPY8 281 aa13□□□□□ -0.33
SPCS3-201ENST00000503362 TNFRSF11BO00300 401 aa13□□□□□ -0.33
SPCS3-201ENST00000503362 CREG1O75629 220 aa13□□□□□ -0.33
SPCS3-201ENST00000503362 GLUD1P00367 558 aa13□□□□□ -0.33
SPCS3-201ENST00000503362 C8BP07358 591 aa13□□□□□ -0.33
SPCS3-201ENST00000503362 GKP32189 559 aa13□□□□□ -0.33
SPCS3-201ENST00000503362 MAGEA11P43364 429 aa13□□□□□ -0.33
SPCS3-201ENST00000503362 MPPE1Q53F39 396 aa13□□□□□ -0.33
SPCS3-201ENST00000503362 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
SPCS3-201ENST00000503362 ZNF773Q6PK81 442 aa13□□□□□ -0.33
SPCS3-201ENST00000503362 SPNS2Q8IVW8 549 aa13□□□□□ -0.33
SPCS3-201ENST00000503362 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
SPCS3-201ENST00000503362 FAM83DQ9H4H8 585 aa13□□□□□ -0.33
SPCS3-201ENST00000503362 ASAH2Q9NR71 780 aa13□□□□□ -0.33
SPCS3-201ENST00000503362 A0A0U1RQS6 177 aa12.99□□□□□ -0.33
SPCS3-201ENST00000503362 C7orf72A4D263 438 aa12.99□□□□□ -0.33
SPCS3-201ENST00000503362 HAS3O00219 553 aa12.99□□□□□ -0.33
SPCS3-201ENST00000503362 FBP2O00757 339 aa12.99□□□□□ -0.33
SPCS3-201ENST00000503362 GNAO1P09471 354 aa12.99□□□□□ -0.33
SPCS3-201ENST00000503362 POU2F1P14859 743 aa12.99□□□□□ -0.33
SPCS3-201ENST00000503362 GPX3P22352 226 aa12.99□□□□□ -0.33
SPCS3-201ENST00000503362 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
SPCS3-201ENST00000503362 GATMP50440 423 aa12.99□□□□□ -0.33
SPCS3-201ENST00000503362 PIGFQ07326 219 aa12.99□□□□□ -0.33
SPCS3-201ENST00000503362 SEMA3BQ13214 749 aa12.99□□□□□ -0.33
SPCS3-201ENST00000503362 PAGE3Q5JUK9 113 aa12.99□□□□□ -0.33
SPCS3-201ENST00000503362 C11orf65Q8NCR3 313 aa12.99□□□□□ -0.33
SPCS3-201ENST00000503362 STON2Q8WXE9 905 aa12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.7 ms