RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497210.5

CTPS1-211, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 463 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-211ENST00000497210 CEP192Q8TEP8 1941 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 A0A096LPK6 155 aa9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 A0A1B0GTW7 788 aa9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 CCDC189A1A4V9 331 aa9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 PRSS38A1L453 326 aa9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 POM121BA6NF01 834 aa9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 H0Y8X5 98 aa9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 COPEO14579 308 aa9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 CHUKO15111 745 aa9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 GRID2O43424 1007 aa9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 NIPSNAP2O75323 286 aa9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 ALX3O95076 343 aa9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 RASGRP1O95267 797 aa9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 TRIM16O95361 564 aa9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 GSTA1P08263 222 aa9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 COL6A2P12110 1019 aa9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 KRT4P19013 534 aa9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 MAGEA12P43365 314 aa9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 FAM83EQ2M2I3 478 aa9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 PLK5Q496M5 336 aa9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF789Q5FWF6 425 aa9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 AGAP9Q5VTM2 703 aa9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 ANKRD34AQ69YU3 496 aa9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 CRTC3Q6UUV7 619 aa9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 ENPP7Q6UWV6 458 aa9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 PRR23BQ6ZRT6 265 aa9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 Q6ZSR6 202 aa9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 AMZ2Q86W34 360 aa9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 MYO1HQ8N1T3 1032 aa9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 PELI3Q8N2H9 469 aa9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 CLDN19Q8N6F1 224 aa9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 FRMD1Q8N878 549 aa9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 ZBTB44Q8NCP5 570 aa9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 CEP76Q8TAP6 659 aa9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 ELMO1Q92556 727 aa9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 OR2M4Q96R27 311 aa9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 GPR21Q99679 349 aa9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 CCM2Q9BSQ5 444 aa9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 VPS11Q9H270 941 aa9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 TM9SF3Q9HD45 589 aa9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 GPR27Q9NS67 375 aa9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 HIF3AQ9Y2N7 669 aa9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 ACOT9Q9Y305 439 aa9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa9.52□□□□□ -0.89
CTPS1-211ENST00000497210 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa9.52□□□□□ -0.89
CTPS1-211ENST00000497210 AGPSO00116 658 aa9.52□□□□□ -0.89
CTPS1-211ENST00000497210 VILLO15195 856 aa9.52□□□□□ -0.89
CTPS1-211ENST00000497210 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
CTPS1-211ENST00000497210 ATE1O95260 518 aa9.52□□□□□ -0.89
CTPS1-211ENST00000497210 RPN2P04844 631 aa9.52□□□□□ -0.89
CTPS1-211ENST00000497210 F7P08709 466 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
CTPS1-211ENST00000497210 SLC35E2BP0CK96 405 aa9.52□□□□□ -0.89
CTPS1-211ENST00000497210 DGKAP23743 735 aa9.52□□□□□ -0.89
CTPS1-211ENST00000497210 NTF4P34130 210 aa9.52□□□□□ -0.89
CTPS1-211ENST00000497210 CCNFP41002 786 aa9.52□□□□□ -0.89
CTPS1-211ENST00000497210 GNPDA1P46926 289 aa9.52□□□□□ -0.89
CTPS1-211ENST00000497210 CCT5P48643 541 aa9.52□□□□□ -0.89
CTPS1-211ENST00000497210 CTSCP53634 463 aa9.52□□□□□ -0.89
CTPS1-211ENST00000497210 CDKN2DP55273 166 aa9.52□□□□□ -0.89
CTPS1-211ENST00000497210 TAS2R39P59534 338 aa9.52□□□□□ -0.89
CTPS1-211ENST00000497210 IL2P60568 153 aa9.52□□□□□ -0.89
CTPS1-211ENST00000497210 ATP6V0D1P61421 351 aa9.52□□□□□ -0.89
CTPS1-211ENST00000497210 PPARDQ03181 441 aa9.52□□□□□ -0.89
CTPS1-211ENST00000497210 DMPKQ09013 629 aa9.52□□□□□ -0.89
CTPS1-211ENST00000497210 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP9.52□□□□□ -0.89
CTPS1-211ENST00000497210 RPA4Q13156 261 aa9.52□□□□□ -0.89
CTPS1-211ENST00000497210 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
CTPS1-211ENST00000497210 FDX2Q6P4F2 183 aa9.52□□□□□ -0.89
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF549Q6P9A3 640 aa9.52□□□□□ -0.89
CTPS1-211ENST00000497210 TMEM220Q6QAJ8 160 aa9.52□□□□□ -0.89
CTPS1-211ENST00000497210 CMC1Q7Z7K0 106 aa9.52□□□□□ -0.89
CTPS1-211ENST00000497210 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa9.52□□□□□ -0.89
CTPS1-211ENST00000497210 PIM3Q86V86 326 aa9.52□□□□□ -0.89
CTPS1-211ENST00000497210 DEFB119Q8N690 84 aa9.52□□□□□ -0.89
CTPS1-211ENST00000497210 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa9.52□□□□□ -0.89
CTPS1-211ENST00000497210 OR2L2Q8NH16 312 aa9.52□□□□□ -0.89
CTPS1-211ENST00000497210 CD200R1Q8TD46 325 aa9.52□□□□□ -0.89
CTPS1-211ENST00000497210 MZB1Q8WU39 189 aa9.52□□□□□ -0.89
CTPS1-211ENST00000497210 INPP5DQ92835 1189 aa9.52□□□□□ -0.89
CTPS1-211ENST00000497210 SGF29Q96ES7 293 aa9.52□□□□□ -0.89
CTPS1-211ENST00000497210 PDXPQ96GD0 296 aa9.52□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.2 ms