RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496574.6

PKD1-222, Transcript of polycystin 1, transient receptor potential channel interacting, human

TSL 5

Gene PKD1, Length 4,419 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKD1-222	ENST00000496574	PSMG2	Q969U7	264 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	HMCES	Q96FZ2	354 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	PCED1B	Q96HM7	432 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	FRMD6	Q96NE9	622 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	COL21A1	Q96P44	957 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	COMMD9	Q9P000	198 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	SIX4	Q9UIU6	781 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	MAN2B2	Q9Y2E5	1009 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	TRPV2	Q9Y5S1	764 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	PRL	P01236	227 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	DARS	P14868	501 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	GTF2E2	P29084	291 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	RPIA	P49247	311 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	NKX2-5	P52952	324 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	SRSF11	Q05519	484 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	SMARCB1	Q12824	385 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	DSC3	Q14574	896 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	DCST1	Q5T197	706 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	LIN54	Q6MZP7	749 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	ZSCAN2	Q7Z7L9	614 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	TMEM199	Q8N511	208 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	VANGL1	Q8TAA9	524 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	TFAP2C	Q92754	450 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	KCNC2	Q96PR1	638 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	NPL	Q9BXD5	320 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	TRIT1	Q9H3H1	467 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	NECTIN3	Q9NQS3	549 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	ARMC1	Q9NVT9	282 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	KCTD5	Q9NXV2	234 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	GULP1	Q9UBP9	304 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	RPS6KB2	Q9UBS0	482 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	ABT1	Q9ULW3	272 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	MYBPHL	A2RUH7	354 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	PRAMEF1	O95521	474 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	BMP7	P18075	431 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	BRCC3	P46736	316 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	MAPK12	P53778	367 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	POLR2L	P62875	67 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	LCN8	Q6JVE9	175 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	CRYBG2	Q8N1P7	616 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	CFAP52	Q8N1V2	620 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	OR10Q1	Q8NGQ4	319 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	PYURF	Q96I23	114 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	MYRFL	Q96LU7	910 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	XYLT2	Q9H1B5	865 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	MEAF6	Q9HAF1	191 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	CPNE5	Q9HCH3	593 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	C11orf16	Q9NQ32	467 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	INTS7	Q9NVH2	962 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	MIOS	Q9NXC5	875 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	TAS2R7	Q9NYW3	318 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	PCDHGA7	Q9Y5G6	932 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	RAI2	Q9Y5P3	530 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574		A0A1W2PQH9	124 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	CHST10	O43529	356 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	ALDH1A2	O94788	518 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	SMIM10L2A	P0DMW4	78 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	SMIM10L2B	P0DMW5	78 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	G6PD	P11413	515 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	HTR1E	P28566	365 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	RNASE12	Q5GAN4	147 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	KIAA1614	Q5VZ46	1190 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	TAS1R3	Q7RTX0	852 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	PHC3	Q8NDX5	983 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	OR13C4	Q8NGS5	318 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	CNIH3	Q8TBE1	160 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	LPP	Q93052	612 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	RTP4	Q96DX8	246 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	SIPA1	Q96FS4	1042 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	SNX27	Q96L92	541 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	AARSD1	Q9BTE6	412 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	CIPC	Q9C0C6	399 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	SACM1L	Q9NTJ5	587 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	LRRC37A3	O60309	1634 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	PRSS51	A0A1B0GVH4	220 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574		H7C0S8	307 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	SLITRK5	O94991	958 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	GADD45G	O95257	159 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	CCNDBP1	O95273	360 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	HPR	P00739	348 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	SLC2A2	P11168	524 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	HSD17B1	P14061	328 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	NTS	P30990	170 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	PTGER3	P43115	390 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	ATN1	P54259	1190 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	GALNT2	Q10471	571 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	SLC10A2	Q12908	348 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	LAPTM4A	Q15012	233 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	KDM1B	Q8NB78	822 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	SLC38A4	Q969I6	547 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	LHPP	Q9H008	270 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	AKAP7	Q9P0M2	348 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	SEC14L3	Q9UDX4	400 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	DNMT3L	Q9UJW3	386 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	ENTPD4	Q9Y227	616 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	SPACA6	W5XKT8	324 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	GRID2	O43424	1007 aa		13.9	□□□□□ -0.18

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