RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496325.5

PRKCZ-222, Transcript of protein kinase C zeta, human

TSL 4

Gene PRKCZ, Length 563 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRKCZ-222	ENST00000496325	PMEPA1	Q969W9	287 aa		15.42	■□□□□ 0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	C9orf72	Q96LT7	481 aa		15.42	■□□□□ 0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	BIRC8	Q96P09	236 aa		15.42	■□□□□ 0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	THSD1	Q9NS62	852 aa		15.42	■□□□□ 0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	CDYL	Q9Y232	598 aa		15.42	■□□□□ 0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	CRYL1	Q9Y2S2	319 aa		15.42	■□□□□ 0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	SNX24	Q9Y343	169 aa		15.42	■□□□□ 0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	HEMK1	Q9Y5R4	338 aa	Predicted RBP	15.42	■□□□□ 0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	HEBP2	Q9Y5Z4	205 aa		15.42	■□□□□ 0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	COLEC10	Q9Y6Z7	277 aa		15.42	■□□□□ 0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	FLNC	Q14315	2725 aa		15.42	■□□□□ 0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	C9orf172	C9J069	976 aa		15.41	■□□□□ 0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	IFRD1	O00458	451 aa	Predicted RBP	15.41	■□□□□ 0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	EFS	O43281	561 aa		15.41	■□□□□ 0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	RAD51C	O43502	376 aa		15.41	■□□□□ 0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	GPC4	O75487	556 aa		15.41	■□□□□ 0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	SEC31A	O94979	1220 aa	Known RBP	15.41	■□□□□ 0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	S1PR4	O95977	384 aa		15.41	■□□□□ 0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	OGN	P20774	298 aa	Known RBP	15.41	■□□□□ 0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	AOAH	P28039	575 aa		15.41	■□□□□ 0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	CSTF2	P33240	577 aa	Known RBP eCLIP	15.41	■□□□□ 0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	MLLT3	P42568	568 aa	Predicted RBP	15.41	■□□□□ 0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	HSPA14	Q0VDF9	509 aa		15.41	■□□□□ 0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	PRKG2	Q13237	762 aa		15.41	■□□□□ 0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	CTBP1	Q13363	440 aa		15.41	■□□□□ 0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	LONRF1	Q17RB8	773 aa		15.41	■□□□□ 0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	SYTL3	Q4VX76	610 aa		15.41	■□□□□ 0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZNF470	Q6ECI4	717 aa		15.41	■□□□□ 0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	PTRHD1	Q6GMV3	140 aa	Known RBP	15.41	■□□□□ 0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	IRGC	Q6NXR0	463 aa		15.41	■□□□□ 0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	FAM92B	Q6ZTR7	304 aa		15.41	■□□□□ 0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	SPNS2	Q8IVW8	549 aa		15.41	■□□□□ 0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	DENND6A	Q8IWF6	608 aa		15.41	■□□□□ 0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	AGBL5	Q8NDL9	886 aa		15.41	■□□□□ 0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	OR4E2	Q8NGC2	313 aa		15.41	■□□□□ 0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	SNF8	Q96H20	258 aa		15.41	■□□□□ 0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	TCF12	Q99081	682 aa		15.41	■□□□□ 0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	EBNA1BP2	Q99848	306 aa	Known RBP	15.41	■□□□□ 0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	WDR83	Q9BRX9	315 aa	Known RBP	15.41	■□□□□ 0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	RAB33B	Q9H082	229 aa		15.41	■□□□□ 0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	PLAC1	Q9HBJ0	212 aa		15.41	■□□□□ 0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	C20orf96	Q9NUD7	363 aa	Predicted RBP	15.41	■□□□□ 0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	AKAP7	Q9P0M2	348 aa	Predicted RBP	15.41	■□□□□ 0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	ANKMY1	Q9P2S6	941 aa		15.41	■□□□□ 0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	GALP	Q9UBC7	116 aa		15.41	■□□□□ 0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	EPHA6	Q9UF33	1036 aa		15.41	■□□□□ 0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	GNPTG	Q9UJJ9	305 aa		15.41	■□□□□ 0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	FAM169A	Q9Y6X4	670 aa		15.41	■□□□□ 0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	HEATR5B	Q9P2D3	2071 aa		15.4	■□□□□ 0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	OR6C74	A6NCV1	312 aa		15.4	■□□□□ 0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	OR5K3	A6NET4	321 aa		15.4	■□□□□ 0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	EFCAB7	A8K855	629 aa		15.4	■□□□□ 0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325		F8W8V4	182 aa		15.4	■□□□□ 0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	PRAMEF10	O60809	474 aa		15.4	■□□□□ 0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	NIPSNAP2	O75323	286 aa		15.4	■□□□□ 0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	PGAM1	P18669	254 aa		15.4	■□□□□ 0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	NDUFS1	P28331	727 aa		15.4	■□□□□ 0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	SEPHS1	P49903	392 aa		15.4	■□□□□ 0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	THOC5	Q13769	683 aa	Known RBP	15.4	■□□□□ 0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	CRYM	Q14894	314 aa		15.4	■□□□□ 0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	LRRC6	Q86X45	466 aa		15.4	■□□□□ 0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	FAM129C	Q86XR2	697 aa		15.4	■□□□□ 0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	SLC22A15	Q8IZD6	547 aa		15.4	■□□□□ 0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	BMPER	Q8N8U9	685 aa		15.4	■□□□□ 0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	SERBP1	Q8NC51	408 aa	Known RBP eCLIP	15.4	■□□□□ 0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	ACVR1C	Q8NER5	493 aa		15.4	■□□□□ 0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	OR52E1	Q8NGJ3	308 aa		15.4	■□□□□ 0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	OR5AR1	Q8NGP9	310 aa		15.4	■□□□□ 0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	ART4	Q93070	314 aa		15.4	■□□□□ 0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	HGH1	Q9BTY7	390 aa		15.4	■□□□□ 0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	DPH5	Q9H2P9	285 aa		15.4	■□□□□ 0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	FBXO6	Q9NRD1	293 aa	Predicted RBP	15.4	■□□□□ 0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	HRASLS2	Q9NWW9	162 aa		15.4	■□□□□ 0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	FOXJ2	Q9P0K8	574 aa		15.4	■□□□□ 0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	PCDHGA7	Q9Y5G6	932 aa		15.4	■□□□□ 0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	TLN1	Q9Y490	2541 aa	Known RBP	15.4	■□□□□ 0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	CCDC88C	Q9P219	2028 aa		15.39	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	FAM187A	A6NFU0	413 aa		15.39	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	NVL	O15381	856 aa	Known RBP	15.39	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	URI1	O94763	535 aa	Predicted RBP	15.39	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	TPBGL	P0DKB5	382 aa		15.39	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	POLR2C	P19387	275 aa	Predicted RBP	15.39	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	ELK3	P41970	407 aa		15.39	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	SLC1A2	P43004	574 aa		15.39	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	SRSF6	Q13247	344 aa	Known RBP	15.39	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	HSP90AA5P	Q58FG0	334 aa		15.39	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	DNAJC21	Q5F1R6	531 aa	Known RBP	15.39	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	CACHD1	Q5VU97	1274 aa		15.39	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	CCDC81	Q6ZN84	652 aa		15.39	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZNF572	Q7Z3I7	529 aa	Predicted RBP	15.39	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	PDIK1L	Q8N165	341 aa		15.39	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	ASZ1	Q8WWH4	475 aa		15.39	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	FAM136A	Q96C01	138 aa		15.39	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	PPM1M	Q96MI6	270 aa		15.39	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	PANX3	Q96QZ0	392 aa		15.39	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	TAAR9	Q96RI9	348 aa		15.39	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	MAP3K3	Q99759	626 aa		15.39	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	ERP44	Q9BS26	406 aa		15.39	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	TSSK1B	Q9BXA7	367 aa		15.39	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	XKR8	Q9H6D3	395 aa		15.39	■□□□□ 0.05

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