RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496055.5

RABGGTB-213, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 3,863 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-213ENST00000496055 BLZF1Q9H2G9 400 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 PDZD7Q9H5P4 517 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 GNPTGQ9UJJ9 305 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 INSL5Q9Y5Q6 135 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 GPR45Q9Y5Y3 372 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 A0A1W2PRG6 482 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 CRCPO75575 148 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 SPDEFO95238 335 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 OAS1P00973 400 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 IFI30P13284 250 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 PKMP14618 531 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 NDUFB7P17568 137 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 CCR4P51679 360 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 PON3Q15166 354 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 SEC23BQ15437 767 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 ETFRF1Q6IPR1 90 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 PARM1Q6UWI2 310 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 B3GNT9Q6UX72 402 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 ZPBP2Q6X784 338 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 KIAA0408Q6ZU52 694 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 ASRGL1Q7L266 308 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 NPAS3Q8IXF0 933 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 DSELQ8IZU8 1212 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 GALNT4Q8N4A0 578 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 SIMC1Q8NDZ2 872 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 RFFLQ8WZ73 363 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 FIG4Q92562 907 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 PIK3R3Q92569 461 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC32A1Q9H598 525 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 MINDY3Q9H8M7 445 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 ETNK1Q9HBU6 452 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 TAS2R10Q9NYW0 307 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 A0A0A0MRY4 1105 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 BTBD18B2RXH4 712 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 CCDC188H7C350 402 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 RNF103O00237 685 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 CHADO15335 359 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 VEGFDO43915 354 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 NUAK1O60285 661 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 UGDHO60701 494 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 KRT36O76013 467 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 ATF2P15336 505 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 TYMPP19971 482 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 ABCB4P21439 1286 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 DRD4P21917 467 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 CRHR1P34998 444 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 THBS2P35442 1172 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 PAFAH1B1P43034 410 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 PGDP52209 483 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 GPLD1P80108 840 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 RHDQ02161 417 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 TWF1Q12792 350 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 NFYCQ13952 458 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 PDGFRLQ15198 375 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 SURF1Q15526 300 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 MGAT5BQ3V5L5 792 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 SV2CQ496J9 727 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 ESCO2Q56NI9 601 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 ZMAT1Q5H9K5 638 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 GLRA4Q5JXX5 417 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 ACER2Q5QJU3 275 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 OVOS1Q6IE37 1185 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC9A9Q8IVB4 645 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF786Q8N393 782 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 CADM2Q8N3J6 435 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 UBL4BQ8N7F7 174 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF781Q8N8C0 355 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP4.49□□□□□ -1.694e-8■■■■■ 29.9
RABGGTB-213ENST00000496055 KIAA1191Q96A73 305 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 NTAN1Q96AB6 310 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 DPYSL5Q9BPU6 564 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 CLSTN3Q9BQT9 956 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 KIFC1Q9BW19 673 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC19A3Q9BZV2 496 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 CHRDQ9H2X0 955 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 PIGUQ9H490 435 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 CYP3A43Q9HB55 503 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 CD274Q9NZQ7 290 aa4.49□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.7 ms