RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488015.5

SRI-208, Transcript of sorcin, human

TSL 2

Gene SRI, Length 588 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SRI-208	ENST00000488015	ABCC13	Q9NSE7	274 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	SACM1L	Q9NTJ5	587 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	DKK2	Q9UBU2	259 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	APPL1	Q9UKG1	709 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	ITGB1BP2	Q9UKP3	347 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	PHTF1	Q9UMS5	762 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	CORO2B	Q9UQ03	480 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	NEU2	Q9Y3R4	380 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	ARHGEF17	Q96PE2	2063 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	LOC101059948	A0A1B0GTJ6	334 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	IGLON5	A6NGN9	336 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	TMEM200C	A6NKL6	621 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	RHPN2P1	A8MT19	583 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	TCP11X1	B4DZS4	312 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	CPNE6	O95741	557 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	BMP15	O95972	392 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	PEX11B	O96011	259 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	HLA-DRA	P01903	254 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	ADRB3	P13945	408 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	TCN2	P20062	427 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	GJB2	P29033	226 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	STAT6	P42226	847 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	BLK	P51451	505 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	PLK1	P53350	603 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	PFN3	P60673	137 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	SNRPF	P62306	86 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	MC2R	Q01718	297 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	PPARD	Q03181	441 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	ARHGEF7	Q14155	803 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	INPP5J	Q15735	1006 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	AMZ1	Q400G9	498 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	ZACN	Q401N2	412 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	SPDYE7P	Q495Y7	208 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	NADK2	Q4G0N4	442 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	MIIP	Q5JXC2	388 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	CERCAM	Q5T4B2	595 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	RAP1GAP2	Q684P5	730 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	MACC1	Q6ZN28	852 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	KDELC2	Q7Z4H8	507 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	PIM3	Q86V86	326 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	CHSY1	Q86X52	802 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	MCEMP1	Q8IX19	187 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	NELFCD	Q8IXH7	590 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	ANKRD52	Q8NB46	1076 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	PSD4	Q8NDX1	1056 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	DENND6B	Q8NEG7	585 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	STARD8	Q92502	1023 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	ART4	Q93070	314 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	RNF31	Q96EP0	1072 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	PPP1R16A	Q96I34	528 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	BOD1	Q96IK1	185 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	CCDC114	Q96M63	670 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	TBCB	Q99426	244 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	KLF6	Q99612	283 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	SPATA5L1	Q9BVQ7	753 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	DDA1	Q9BW61	102 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	ALOXE3	Q9BYJ1	711 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	EDEM3	Q9BZQ6	932 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	RDH14	Q9HBH5	336 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	SLC39A1	Q9NY26	324 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	GPRC5B	Q9NZH0	403 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	XPR1	Q9UBH6	696 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	HESX1	Q9UBX0	185 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	TLK1	Q9UKI8	766 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	ENTPD4	Q9Y227	616 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	NOX1	Q9Y5S8	564 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	SNX13	Q9Y5W8	968 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	CROCC	Q5TZA2	2017 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	PCSK5	Q92824	1860 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015		A0A087WWL8	130 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	IGHV5-10-1	A0A0J9YXX1	117 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015		A0A1W2PS29	197 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	TMEM233	B4DJY2	109 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015		E7ENX8	843 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015		F5H5T6	163 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015		F8W8V4	182 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015		H3BQV1	296 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	MYO1C	O00159	1063 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	RNF103	O00237	685 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	TOR1B	O14657	336 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	XPO1	O14980	1071 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	KPNA5	O15131	536 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	SORBS2	O94875	1100 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	APOE	P02649	317 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	SRC	P12931	536 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	CHRM3	P20309	590 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	CSTF2	P33240	577 aa	Known RBP eCLIP	4.49	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	LEPR	P48357	1165 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	PRIM2	P49643	509 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	ANXA11	P50995	505 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	OR1D5	P58170	312 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	DAOA	P59103	153 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	KRTAP10-9	P60411	292 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	RPS16	P62249	146 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	YPEL5	P62699	121 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	TAP2	Q03519	686 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	ABHD18	Q0P651	414 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	DYRK1A	Q13627	763 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	RAB32	Q13637	225 aa		4.49	□□□□□ -1.69

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