RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484179.5

USP34-215, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, human

TSL 3

Gene USP34, Length 927 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP34-215	ENST00000484179	PDCL3	Q9H2J4	239 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	BRF2	Q9HAW0	419 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	HPS4	Q9NQG7	708 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	COMMD8	Q9NX08	183 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	GDAP2	Q9NXN4	497 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	DDX43	Q9NXZ2	648 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	HCN3	Q9P1Z3	774 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	UPB1	Q9UBR1	384 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	CDH9	Q9ULB4	789 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	NFE2L3	Q9Y4A8	694 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	PDCD11	Q14690	1871 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	GREB1	Q4ZG55	1949 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	NOTCH4	Q99466	2003 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	CACNA1A	O00555	2505 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	ATP8B3	O60423	1300 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	NPIPB15	A6NHN6	443 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	TEX22	C9J3V5	150 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	FAM189A1	O60320	539 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	DOK2	O60496	412 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	TNNC2	P02585	160 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	SERPINF2	P08697	491 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	TMEM191B	P0C7N4	346 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	UBL4A	P11441	157 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	GNS	P15586	552 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	HOXB9	P17482	250 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	GSTM2	P28161	218 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	TYK2	P29597	1187 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	DEK	P35659	375 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	GJC1	P36383	396 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	P2RY2	P41231	377 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	STAT1	P42224	750 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	DHPS	P49366	369 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	NOP14	P78316	857 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	RBP5	P82980	135 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	HOXA4	Q00056	320 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	GAD2	Q05329	585 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	SPAG1	Q07617	926 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	GOLGA8DP	Q0D2H9	430 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	SEMA3A	Q14563	771 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	ZNF77	Q15935	545 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	GLE1	Q53GS7	698 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	ARL13A	Q5H913	290 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	ZNF667	Q5HYK9	610 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	LYSMD4	Q5XG99	296 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	WSCD1	Q658N2	575 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	TXNDC8	Q6A555	127 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	SLC30A9	Q6PML9	568 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	SERPINA13P	Q6UXR4	307 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	RANBP10	Q6VN20	620 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	DENND5B	Q6ZUT9	1274 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	ZNF720	Q7Z2F6	126 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	TFAP2D	Q7Z6R9	452 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	PXK	Q7Z7A4	578 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	GPBP1	Q86WP2	473 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	EFCAB13	Q8IY85	973 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	OLIG1	Q8TAK6	271 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	FAM110D	Q8TAY7	271 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	CREB3L4	Q8TEY5	395 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	CNOT9	Q92600	299 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	FYTTD1	Q96QD9	318 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	ACCS	Q96QU6	501 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	ZNF347	Q96SE7	839 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	PI4K2A	Q9BTU6	479 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	MMTAG2	Q9BU76	263 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	SCNM1	Q9BWG6	230 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	NUAK2	Q9H093	628 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	POLD4	Q9HCU8	107 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	TRPC7	Q9HCX4	862 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	OLFML3	Q9NRN5	406 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	MTPAP	Q9NVV4	582 aa	Known RBP eCLIP	4.84	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	TMEM248	Q9NWD8	314 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	ARL15	Q9NXU5	204 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	CLIC5	Q9NZA1	410 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	POLG2	Q9UHN1	485 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	ADAM21	Q9UKJ8	722 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	GPR34	Q9UPC5	381 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179		E9PAM4	449 aa		4.83	□□□□□ -1.64
USP34-215	ENST00000484179	CDX4	O14627	284 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
USP34-215	ENST00000484179	LDLRAD4	O15165	306 aa		4.83	□□□□□ -1.64
USP34-215	ENST00000484179	PTP4A3	O75365	173 aa		4.83	□□□□□ -1.64
USP34-215	ENST00000484179	MLYCD	O95822	493 aa		4.83	□□□□□ -1.64
USP34-215	ENST00000484179	ENO1	P06733	434 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
USP34-215	ENST00000484179	KRT19	P08727	400 aa		4.83	□□□□□ -1.64
USP34-215	ENST00000484179	FAM200B	P0CF97	657 aa		4.83	□□□□□ -1.64
USP34-215	ENST00000484179	ACOT2	P49753	483 aa		4.83	□□□□□ -1.64
USP34-215	ENST00000484179	CLNS1A	P54105	237 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
USP34-215	ENST00000484179	ARF3	P61204	181 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
USP34-215	ENST00000484179	UFM1	P61960	85 aa		4.83	□□□□□ -1.64
USP34-215	ENST00000484179	SNRPF	P62306	86 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
USP34-215	ENST00000484179	SLC7A9	P82251	487 aa		4.83	□□□□□ -1.64
USP34-215	ENST00000484179	ARF1	P84077	181 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
USP34-215	ENST00000484179	TFAM	Q00059	246 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
USP34-215	ENST00000484179	ZBTB16	Q05516	673 aa		4.83	□□□□□ -1.64
USP34-215	ENST00000484179	DCTN2	Q13561	401 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
USP34-215	ENST00000484179	CCDC6	Q16204	474 aa		4.83	□□□□□ -1.64
USP34-215	ENST00000484179	SLC18A3	Q16572	532 aa		4.83	□□□□□ -1.64
USP34-215	ENST00000484179	ANXA2R	Q3ZCQ2	193 aa		4.83	□□□□□ -1.64
USP34-215	ENST00000484179	FAM171B	Q6P995	826 aa		4.83	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 87.5 ms